60 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_0504 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009664  Krad_0504  NAD-dependent epimerase/dehydratase  100 
 
 		 375 aa  741    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.836684  normal  0.0567731 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34450  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  78.21 
 
 		 358 aa  559  1e-158  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.306905  normal  0.223868 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2429  hypothetical protein  56.73 
 
 		 353 aa  418  1e-116  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.143055  normal  0.111053 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3364  NAD-dependent epimerase/dehydratase  61.47 
 
 		 363 aa  416  9.999999999999999e-116  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4325  NAD-dependent epimerase/dehydratase  60.46 
 
 		 353 aa  414  1e-114  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.488542 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2695  hypothetical protein  55.59 
 
 		 353 aa  411  1e-114  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0626105  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3957  NAD-dependent epimerase/dehydratase  60.17 
 
 		 353 aa  412  1e-114  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3779  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase protein  57.59 
 
 		 353 aa  405  1.0000000000000001e-112  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4434  NAD-dependent epimerase/dehydratase  58.74 
 
 		 353 aa  403  1e-111  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.324626 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2129  NAD-dependent epimerase/dehydratase  56.98 
 
 		 355 aa  398  9.999999999999999e-111  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.461337 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4109  NAD-dependent epimerase/dehydratase  53.71 
 
 		 368 aa  391  1e-108  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1079  NAD-dependent epimerase/dehydratase  57.59 
 
 		 353 aa  392  1e-108  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6626  NAD-dependent epimerase/dehydratase  57.14 
 
 		 354 aa  386  1e-106  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.208307  normal  0.360352 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1981  NAD-dependent epimerase/dehydratase  55.43 
 
 		 355 aa  385  1e-106  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0359  NAD-dependent epimerase/dehydratase  54.13 
 
 		 368 aa  383  1e-105  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.748859  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2324  NAD-dependent epimerase/dehydratase  56.57 
 
 		 354 aa  379  1e-104  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.485838  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00595  aldo-keto reductase family protein  51.55 
 
 		 292 aa  289  6e-77  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3058  NAD-dependent epimerase/dehydratase  37.64 
 
 		 350 aa  206  4e-52  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4680  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.73 
 
 		 352 aa  194  2e-48  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.181232  hitchhiker  0.000198161 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1116  NAD-dependent epimerase/dehydratase  39.78 
 
 		 375 aa  186  4e-46  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1266  NAD-dependent epimerase/dehydratase  39.5 
 
 		 350 aa  184  3e-45  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.892328  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5283  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.64 
 
 		 352 aa  181  1e-44  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0947  NAD-dependent epimerase/dehydratase  36.36 
 
 		 351 aa  181  2e-44  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0589188  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3616  hypothetical protein  37.18 
 
 		 357 aa  176  4e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0272546  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39930  hypothetical protein  35.39 
 
 		 350 aa  176  5e-43  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0190143  n/a   
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5140  hypothetical protein  35.01 
 
 		 360 aa  171  1e-41  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0792  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.76 
 
 		 351 aa  171  2e-41  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1785  hypothetical protein  34.38 
 
 		 375 aa  165  1.0000000000000001e-39  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.599753 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1008  hypothetical protein  34.85 
 
 		 362 aa  160  4e-38  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0869  hypothetical protein  31.78 
 
 		 356 aa  157  3e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.452866  normal  0.48377 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_04177  NAD dependent epimerase/dehydratase family protein (AFU_orthologue; AFUA_8G00600)  29.26 
 
 		 424 aa  137  4e-31  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3123  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.25 
 
 		 373 aa  136  5e-31  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3850  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.52 
 
 		 373 aa  135  9e-31  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5534  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.02 
 
 		 213 aa  135  9.999999999999999e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.397768 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_09028  conserved hypothetical protein  28.91 
 
 		 376 aa  128  2.0000000000000002e-28  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01302  conserved hypothetical protein  26.09 
 
 		 432 aa  117  5e-25  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02921  conserved hypothetical protein  27.64 
 
 		 437 aa  100  3e-20  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.569439 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0075  hypothetical protein  40.96 
 
 		 305 aa  51.2  0.00003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05289  conserved hypothetical protein  24.2 
 
 		 388 aa  50.4  0.00006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  hitchhiker  0.00191099  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4085  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.03 
 
 		 211 aa  48.1  0.0003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0412177  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1111  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.58 
 
 		 226 aa  48.1  0.0003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1710  NAD-dependent epimerase/dehydratase  38.46 
 
 		 326 aa  46.6  0.0007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0501  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase-like  47.62 
 
 		 216 aa  46.2  0.0009  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.82125 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1396  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.98 
 
 		 256 aa  45.8  0.001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1215  NAD-dependent epimerase/dehydratase  41.24 
 
 		 329 aa  45.1  0.002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.190053  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0977  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.33 
 
 		 294 aa  45.1  0.002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0152042  normal  0.193057 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2545  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  35.8 
 
 		 375 aa  45.4  0.002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0977  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.95 
 
 		 459 aa  45.1  0.002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0520232 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2612  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  35.8 
 
 		 375 aa  44.3  0.003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3532  NmrA family protein  35.9 
 
 		 513 aa  44.7  0.003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.959368 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00593  hypothetical protein  52.17 
 
 		 53 aa  44.3  0.003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4567  GDP-mannose 4,6-dehydratase  35.63 
 
 		 325 aa  44.3  0.003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1745  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase family protein  35.8 
 
 		 387 aa  43.9  0.004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2301  hypothetical protein  34.62 
 
 		 78 aa  43.5  0.005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.181563 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1448  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  36.25 
 
 		 375 aa  43.5  0.006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1553  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  35 
 
 		 402 aa  43.1  0.007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2797  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  35 
 
 		 402 aa  43.1  0.007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.872039  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1583  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  35 
 
 		 399 aa  43.1  0.008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1044  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.68 
 
 		 226 aa  42.7  0.01  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6636  NmrA family protein  42.86 
 
 		 297 aa  42.7  0.01  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>