57 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_5283 on replicon NC_010505
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010505  Mrad2831_5283  NAD-dependent epimerase/dehydratase  100 
 
 		 352 aa  726    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39930  hypothetical protein  52.87 
 
 		 350 aa  367  1e-100  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0190143  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4680  NAD-dependent epimerase/dehydratase  49.28 
 
 		 352 aa  353  2.9999999999999997e-96  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.181232  hitchhiker  0.000198161 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1785  hypothetical protein  52.46 
 
 		 375 aa  345  8e-94  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.599753 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0869  hypothetical protein  46.5 
 
 		 356 aa  319  3.9999999999999996e-86  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.452866  normal  0.48377 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3058  NAD-dependent epimerase/dehydratase  46.11 
 
 		 350 aa  316  4e-85  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5140  hypothetical protein  45.45 
 
 		 360 aa  315  9.999999999999999e-85  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3616  hypothetical protein  43.1 
 
 		 357 aa  287  2e-76  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0272546  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0947  NAD-dependent epimerase/dehydratase  43.59 
 
 		 351 aa  282  6.000000000000001e-75  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0589188  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5534  NAD-dependent epimerase/dehydratase  59.15 
 
 		 213 aa  277  2e-73  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.397768 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1116  NAD-dependent epimerase/dehydratase  41.26 
 
 		 375 aa  263  4e-69  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1266  NAD-dependent epimerase/dehydratase  40.97 
 
 		 350 aa  261  1e-68  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.892328  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0792  NAD-dependent epimerase/dehydratase  41.74 
 
 		 351 aa  249  5e-65  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3850  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.44 
 
 		 373 aa  249  7e-65  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3123  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.44 
 
 		 373 aa  248  9e-65  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2324  NAD-dependent epimerase/dehydratase  41 
 
 		 354 aa  239  4e-62  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.485838  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4434  NAD-dependent epimerase/dehydratase  38.29 
 
 		 353 aa  218  1e-55  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.324626 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3957  NAD-dependent epimerase/dehydratase  38.33 
 
 		 353 aa  218  1e-55  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1008  hypothetical protein  37.43 
 
 		 362 aa  217  2e-55  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4325  NAD-dependent epimerase/dehydratase  38.06 
 
 		 353 aa  215  9.999999999999999e-55  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.488542 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2129  NAD-dependent epimerase/dehydratase  37.4 
 
 		 355 aa  209  6e-53  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.461337 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2695  hypothetical protein  38.5 
 
 		 353 aa  209  7e-53  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0626105  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6626  NAD-dependent epimerase/dehydratase  37.12 
 
 		 354 aa  209  7e-53  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.208307  normal  0.360352 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2429  hypothetical protein  37.67 
 
 		 353 aa  207  2e-52  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.143055  normal  0.111053 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1981  NAD-dependent epimerase/dehydratase  36.39 
 
 		 355 aa  206  7e-52  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4109  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.56 
 
 		 368 aa  205  1e-51  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0359  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.18 
 
 		 368 aa  203  5e-51  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.748859  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1079  NAD-dependent epimerase/dehydratase  36.67 
 
 		 353 aa  199  7e-50  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_09028  conserved hypothetical protein  31.58 
 
 		 376 aa  195  9e-49  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3779  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase protein  36.01 
 
 		 353 aa  192  7e-48  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3364  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.2 
 
 		 363 aa  189  5.999999999999999e-47  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34450  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  35.29 
 
 		 358 aa  182  9.000000000000001e-45  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.306905  normal  0.223868 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0504  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.83 
 
 		 375 aa  174  1.9999999999999998e-42  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.836684  normal  0.0567731 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00595  aldo-keto reductase family protein  33.9 
 
 		 292 aa  167  2e-40  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_04177  NAD dependent epimerase/dehydratase family protein (AFU_orthologue; AFUA_8G00600)  27.88 
 
 		 424 aa  153  4e-36  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01302  conserved hypothetical protein  28.01 
 
 		 432 aa  137  3.0000000000000003e-31  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02921  conserved hypothetical protein  28.29 
 
 		 437 aa  137  4e-31  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.569439 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05289  conserved hypothetical protein  26.81 
 
 		 388 aa  69.3  0.0000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  hitchhiker  0.00191099  normal  1 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03477  hypothetical protein  26.44 
 
 		 274 aa  56.6  0.0000007  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  hitchhiker  0.0000507754  normal  0.0546507 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2202  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.98 
 
 		 331 aa  52.8  0.000008  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.633416 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1028  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.77 
 
 		 331 aa  50.8  0.00003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1215  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.81 
 
 		 329 aa  48.9  0.0001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.190053  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0258  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein/3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase family protein  30.17 
 
 		 330 aa  48.9  0.0001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1551  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.24 
 
 		 270 aa  48.9  0.0001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1339  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.7 
 
 		 331 aa  45.8  0.001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3938  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.38 
 
 		 314 aa  45.8  0.001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.2451 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1506  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  38.3 
 
 		 213 aa  45.4  0.002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.15916  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1373  hypothetical protein  38.3 
 
 		 240 aa  44.7  0.002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.15401  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1377  hypothetical protein  38.3 
 
 		 213 aa  45.4  0.002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.753826  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1783  hypothetical protein  38.3 
 
 		 208 aa  44.7  0.003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0359624  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1176  hypothetical protein  38.3 
 
 		 213 aa  44.3  0.003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.335392  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0694  hypothetical protein  38.3 
 
 		 213 aa  44.3  0.003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00014158  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0458  hypothetical protein  38.3 
 
 		 208 aa  44.7  0.003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0684  NAD dependent epimerase/dehydratase family protein  34.38 
 
 		 312 aa  44.3  0.004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2301  hypothetical protein  46.81 
 
 		 78 aa  43.1  0.007  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.181563 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19740  NAD dependent epimerase/dehydratase family protein  32.48 
 
 		 263 aa  43.1  0.008  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.193802  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2861  hypothetical protein  38.3 
 
 		 213 aa  42.7  0.009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.15708  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>