57 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ajs_3850 on replicon NC_008782
Organism: Acidovorax sp. JS42



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008782  Ajs_3850  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  100 
 
 		 373 aa  756    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3123  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  99.2 
 
 		 373 aa  751    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1008  hypothetical protein  48.09 
 
 		 362 aa  318  1e-85  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0869  hypothetical protein  45 
 
 		 356 aa  315  8e-85  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.452866  normal  0.48377 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5283  NAD-dependent epimerase/dehydratase  40.38 
 
 		 352 aa  251  1e-65  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3616  hypothetical protein  38.33 
 
 		 357 aa  217  2.9999999999999998e-55  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0272546  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39930  hypothetical protein  37.22 
 
 		 350 aa  207  2e-52  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0190143  n/a   
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5140  hypothetical protein  35.6 
 
 		 360 aa  203  3e-51  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1785  hypothetical protein  37.09 
 
 		 375 aa  202  7e-51  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.599753 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4680  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.35 
 
 		 352 aa  200  3e-50  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.181232  hitchhiker  0.000198161 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1116  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.81 
 
 		 375 aa  195  1e-48  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0947  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.15 
 
 		 351 aa  192  6e-48  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0589188  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1266  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.54 
 
 		 350 aa  192  8e-48  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.892328  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3058  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.7 
 
 		 350 aa  186  7e-46  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2129  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.3 
 
 		 355 aa  169  9e-41  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.461337 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1079  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.96 
 
 		 353 aa  167  2e-40  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2695  hypothetical protein  34.04 
 
 		 353 aa  166  5e-40  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0626105  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0792  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.5 
 
 		 351 aa  165  1.0000000000000001e-39  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6626  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.22 
 
 		 354 aa  164  3e-39  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.208307  normal  0.360352 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3957  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.48 
 
 		 353 aa  163  5.0000000000000005e-39  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4434  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.76 
 
 		 353 aa  161  1e-38  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.324626 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2429  hypothetical protein  33.96 
 
 		 353 aa  160  3e-38  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.143055  normal  0.111053 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4325  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.22 
 
 		 353 aa  159  5e-38  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.488542 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3779  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase protein  33.16 
 
 		 353 aa  157  2e-37  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4109  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.94 
 
 		 368 aa  156  7e-37  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1981  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.8 
 
 		 355 aa  152  7e-36  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2324  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.75 
 
 		 354 aa  149  6e-35  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.485838  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5534  NAD-dependent epimerase/dehydratase  36.82 
 
 		 213 aa  146  6e-34  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.397768 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34450  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  32.35 
 
 		 358 aa  144  3e-33  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.306905  normal  0.223868 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0359  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.69 
 
 		 368 aa  140  3e-32  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.748859  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3364  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.62 
 
 		 363 aa  134  1.9999999999999998e-30  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0504  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.61 
 
 		 375 aa  130  3e-29  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.836684  normal  0.0567731 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_09028  conserved hypothetical protein  26.88 
 
 		 376 aa  128  2.0000000000000002e-28  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00595  aldo-keto reductase family protein  31.09 
 
 		 292 aa  104  3e-21  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02921  conserved hypothetical protein  26.28 
 
 		 437 aa  101  2e-20  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.569439 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_04177  NAD dependent epimerase/dehydratase family protein (AFU_orthologue; AFUA_8G00600)  28.67 
 
 		 424 aa  101  3e-20  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01302  conserved hypothetical protein  24.57 
 
 		 432 aa  92.4  1e-17  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5808  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.28 
 
 		 330 aa  53.9  0.000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2597  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.65 
 
 		 309 aa  54.3  0.000004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2103  NAD dependent epimerase/dehydratase family protein  27.5 
 
 		 320 aa  52  0.00002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1190  UDP-N-acetylglucosamine 4-epimerase  24.74 
 
 		 331 aa  52  0.00002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.380145  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2502  NAD dependent epimerase/dehydratase family protein  27.5 
 
 		 320 aa  51.6  0.00002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000211535 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1020  UDP-N-acetylglucosamine 4-epimerase  24.74 
 
 		 331 aa  51.2  0.00003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.280879  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1599  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.74 
 
 		 331 aa  51.2  0.00003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.979048  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2976  UDP-N-acetylglucosamine 4-epimerase  24.74 
 
 		 331 aa  51.2  0.00003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.0000873093  hitchhiker  0.00000190147 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1543  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.98 
 
 		 319 aa  50.8  0.00004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0124132  normal  0.0261393 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2213  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.5 
 
 		 320 aa  50.1  0.00006  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05289  conserved hypothetical protein  23.59 
 
 		 388 aa  48.9  0.0001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  hitchhiker  0.00191099  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3986  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.81 
 
 		 320 aa  48.1  0.0003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05409  conserved hypothetical protein  27.05 
 
 		 415 aa  45.8  0.001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.172063 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0898  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.38 
 
 		 309 aa  44.7  0.002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.760567  normal  0.885082 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3638  UDP-glucose 4-epimerase, putative  24.25 
 
 		 326 aa  45.4  0.002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.407013 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0684  NAD dependent epimerase/dehydratase family protein  29.44 
 
 		 312 aa  45.4  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4728  hypothetical protein  24.92 
 
 		 354 aa  44.3  0.003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3938  NAD-dependent epimerase/dehydratase  23.31 
 
 		 314 aa  43.9  0.004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.2451 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2106  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.56 
 
 		 336 aa  42.7  0.009  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0557769  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4054  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.43 
 
 		 320 aa  42.7  0.01  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.856106  normal  0.626016 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>