39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PXO_00595 on replicon NC_010717
Organism: Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010717  PXO_00595  aldo-keto reductase family protein  100 
 
 
292 aa  610  9.999999999999999e-175  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6626  NAD-dependent epimerase/dehydratase  63.57 
 
 
354 aa  365  1e-100  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.208307  normal  0.360352 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4325  NAD-dependent epimerase/dehydratase  62.89 
 
 
353 aa  364  1e-99  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.488542 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4109  NAD-dependent epimerase/dehydratase  60.48 
 
 
368 aa  363  2e-99  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1981  NAD-dependent epimerase/dehydratase  59.86 
 
 
355 aa  363  2e-99  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3957  NAD-dependent epimerase/dehydratase  62.2 
 
 
353 aa  359  3e-98  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4434  NAD-dependent epimerase/dehydratase  62.2 
 
 
353 aa  358  4e-98  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.324626 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2324  NAD-dependent epimerase/dehydratase  60.82 
 
 
354 aa  347  1e-94  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.485838  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2429  hypothetical protein  58.08 
 
 
353 aa  346  3e-94  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.143055  normal  0.111053 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2129  NAD-dependent epimerase/dehydratase  58.76 
 
 
355 aa  342  4e-93  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.461337 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2695  hypothetical protein  58.08 
 
 
353 aa  342  5e-93  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0626105  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1079  NAD-dependent epimerase/dehydratase  58.76 
 
 
353 aa  340  1e-92  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3779  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase protein  58.13 
 
 
353 aa  340  2e-92  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3364  NAD-dependent epimerase/dehydratase  55.17 
 
 
363 aa  323  3e-87  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0359  NAD-dependent epimerase/dehydratase  52.74 
 
 
368 aa  309  2.9999999999999997e-83  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.748859  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34450  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  48.8 
 
 
358 aa  279  3e-74  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.306905  normal  0.223868 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0504  NAD-dependent epimerase/dehydratase  51.55 
 
 
375 aa  277  2e-73  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.836684  normal  0.0567731 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5140  hypothetical protein  36.7 
 
 
360 aa  178  1e-43  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39930  hypothetical protein  37.97 
 
 
350 aa  176  3e-43  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0190143  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3058  NAD-dependent epimerase/dehydratase  37.29 
 
 
350 aa  175  8e-43  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0947  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.03 
 
 
351 aa  169  5e-41  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0589188  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5283  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.9 
 
 
352 aa  167  2e-40  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4680  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.23 
 
 
352 aa  166  4e-40  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.181232  hitchhiker  0.000198161 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1116  NAD-dependent epimerase/dehydratase  36.18 
 
 
375 aa  164  1.0000000000000001e-39  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1785  hypothetical protein  33.9 
 
 
375 aa  164  1.0000000000000001e-39  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.599753 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0792  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.13 
 
 
351 aa  161  1e-38  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1266  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.84 
 
 
350 aa  161  1e-38  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.892328  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0869  hypothetical protein  32.4 
 
 
356 aa  138  1e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.452866  normal  0.48377 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3616  hypothetical protein  31.85 
 
 
357 aa  137  2e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0272546  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1008  hypothetical protein  32.68 
 
 
362 aa  124  2e-27  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5534  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.09 
 
 
213 aa  124  3e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.397768 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01302  conserved hypothetical protein  29.09 
 
 
432 aa  120  3.9999999999999996e-26  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_09028  conserved hypothetical protein  29.64 
 
 
376 aa  117  1.9999999999999998e-25  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3123  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.77 
 
 
373 aa  105  8e-22  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3850  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.09 
 
 
373 aa  104  1e-21  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_04177  NAD dependent epimerase/dehydratase family protein (AFU_orthologue; AFUA_8G00600)  25.21 
 
 
424 aa  99.4  6e-20  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02921  conserved hypothetical protein  29.51 
 
 
437 aa  99  7e-20  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.569439 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2301  hypothetical protein  36.84 
 
 
78 aa  48.5  0.0001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.181563 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05289  conserved hypothetical protein  23.37 
 
 
388 aa  45.8  0.0007  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  hitchhiker  0.00191099  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>