81 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gdia_2324 on replicon NC_011365
Organism: Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011365  Gdia_2324  NAD-dependent epimerase/dehydratase  100 
 
 		 354 aa  721    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.485838  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6626  NAD-dependent epimerase/dehydratase  68.64 
 
 		 354 aa  493  9.999999999999999e-139  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.208307  normal  0.360352 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4325  NAD-dependent epimerase/dehydratase  67.51 
 
 		 353 aa  488  1e-137  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.488542 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3957  NAD-dependent epimerase/dehydratase  67.23 
 
 		 353 aa  485  1e-136  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4434  NAD-dependent epimerase/dehydratase  66.67 
 
 		 353 aa  482  1e-135  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.324626 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2129  NAD-dependent epimerase/dehydratase  64.69 
 
 		 355 aa  478  1e-134  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.461337 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1079  NAD-dependent epimerase/dehydratase  66.38 
 
 		 353 aa  475  1e-133  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0359  NAD-dependent epimerase/dehydratase  60 
 
 		 368 aa  457  1e-127  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.748859  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2429  hypothetical protein  59.89 
 
 		 353 aa  453  1.0000000000000001e-126  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.143055  normal  0.111053 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3779  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase protein  61.58 
 
 		 353 aa  450  1e-125  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4109  NAD-dependent epimerase/dehydratase  61.41 
 
 		 368 aa  449  1e-125  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2695  hypothetical protein  60.17 
 
 		 353 aa  449  1e-125  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0626105  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1981  NAD-dependent epimerase/dehydratase  60.73 
 
 		 355 aa  444  1e-123  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3364  NAD-dependent epimerase/dehydratase  58.69 
 
 		 363 aa  405  1.0000000000000001e-112  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0504  NAD-dependent epimerase/dehydratase  56.57 
 
 		 375 aa  370  1e-101  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.836684  normal  0.0567731 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34450  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  54.13 
 
 		 358 aa  360  2e-98  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.306905  normal  0.223868 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00595  aldo-keto reductase family protein  60.82 
 
 		 292 aa  347  1e-94  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5283  NAD-dependent epimerase/dehydratase  41 
 
 		 352 aa  227  3e-58  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3058  NAD-dependent epimerase/dehydratase  39.44 
 
 		 350 aa  218  1e-55  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39930  hypothetical protein  38.2 
 
 		 350 aa  212  5.999999999999999e-54  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0190143  n/a   
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5140  hypothetical protein  39.48 
 
 		 360 aa  191  2e-47  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1116  NAD-dependent epimerase/dehydratase  37.26 
 
 		 375 aa  188  1e-46  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4680  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.2 
 
 		 352 aa  186  4e-46  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.181232  hitchhiker  0.000198161 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1266  NAD-dependent epimerase/dehydratase  36.99 
 
 		 350 aa  186  7e-46  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.892328  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0869  hypothetical protein  33.78 
 
 		 356 aa  177  3e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.452866  normal  0.48377 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3616  hypothetical protein  35.57 
 
 		 357 aa  177  3e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0272546  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0947  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.05 
 
 		 351 aa  175  9.999999999999999e-43  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0589188  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0792  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.14 
 
 		 351 aa  171  2e-41  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1785  hypothetical protein  35.29 
 
 		 375 aa  168  1e-40  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.599753 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1008  hypothetical protein  35.22 
 
 		 362 aa  165  1.0000000000000001e-39  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_09028  conserved hypothetical protein  31.51 
 
 		 376 aa  151  1e-35  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5534  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.68 
 
 		 213 aa  147  3e-34  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.397768 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_04177  NAD dependent epimerase/dehydratase family protein (AFU_orthologue; AFUA_8G00600)  29.05 
 
 		 424 aa  143  6e-33  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3123  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.57 
 
 		 373 aa  142  7e-33  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3850  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.31 
 
 		 373 aa  141  1.9999999999999998e-32  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01302  conserved hypothetical protein  27.6 
 
 		 432 aa  127  2.0000000000000002e-28  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02921  conserved hypothetical protein  33.57 
 
 		 437 aa  104  3e-21  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.569439 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1168  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.31 
 
 		 320 aa  60.8  0.00000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1329  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.41 
 
 		 327 aa  58.9  0.0000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1227  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.38 
 
 		 320 aa  58.5  0.0000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0702  NAD-dependent epimerase/dehydratase  54.55 
 
 		 292 aa  53.5  0.000005  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1710  NAD-dependent epimerase/dehydratase  23.08 
 
 		 326 aa  52.8  0.000008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00593  hypothetical protein  58.82 
 
 		 53 aa  52  0.00002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3021  NAD-dependent epimerase/dehydratase  50 
 
 		 349 aa  51.6  0.00002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1215  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.57 
 
 		 329 aa  49.7  0.00007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.190053  normal  1 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05289  conserved hypothetical protein  25.3 
 
 		 388 aa  48.9  0.0001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  hitchhiker  0.00191099  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0939  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.21 
 
 		 324 aa  48.5  0.0002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0249986  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4905  NmrA family protein  25.91 
 
 		 327 aa  47.4  0.0004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.554615 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0230  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.71 
 
 		 304 aa  47  0.0006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0624037  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1668  NADH dehydrogenase (ubiquinone)  41.18 
 
 		 316 aa  46.6  0.0006  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4203  GDP-mannose 4,6-dehydratase  33.07 
 
 		 340 aa  46.2  0.0008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3444  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.26 
 
 		 334 aa  46.2  0.0009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.105526  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0977  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.75 
 
 		 459 aa  46.2  0.001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0520232 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0684  NAD dependent epimerase/dehydratase family protein  35.88 
 
 		 312 aa  45.1  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10130  short chain dehydrogenase  50.77 
 
 		 238 aa  45.1  0.002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000206354  normal  0.858478 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2301  hypothetical protein  37.5 
 
 		 78 aa  44.7  0.002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.181563 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3550  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.45 
 
 		 240 aa  44.7  0.002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.191512  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4897  NAD-dependent epimerase/dehydratase  41.18 
 
 		 333 aa  44.7  0.003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1377  hypothetical protein  48.15 
 
 		 213 aa  44.3  0.003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.753826  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0977  NAD-dependent epimerase/dehydratase  43.33 
 
 		 294 aa  44.3  0.003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0152042  normal  0.193057 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1506  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  48.15 
 
 		 213 aa  44.3  0.003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.15916  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0963  GDP-mannose 4,6-dehydratase  32.54 
 
 		 351 aa  43.9  0.004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.6787 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4317  NAD-dependent epimerase/dehydratase  44.07 
 
 		 276 aa  43.9  0.004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.191598  normal  0.130895 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0945  GDP-mannose 4,6-dehydratase  32.54 
 
 		 351 aa  43.9  0.004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5980  NAD-dependent epimerase/dehydratase  48.44 
 
 		 292 aa  43.9  0.004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.853501  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0487  NAD-dependent epimerase/dehydratase  40.32 
 
 		 305 aa  44.3  0.004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00126012  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0689  GDP-6-deoxy-D-lyxo-4-hexulose reductase, putative  31.11 
 
 		 322 aa  43.9  0.004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  decreased coverage  0.000923213  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4565  NAD-dependent epimerase/dehydratase  43.33 
 
 		 298 aa  43.9  0.005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2861  hypothetical protein  46.3 
 
 		 213 aa  43.5  0.006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.15708  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12084  hypothetical protein  33.33 
 
 		 854 aa  43.1  0.007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.620055  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0168  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.32 
 
 		 285 aa  43.1  0.007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0296892 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8229  GDP-mannose 4,6-dehydratase  30.77 
 
 		 342 aa  43.1  0.007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0917  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.38 
 
 		 334 aa  43.1  0.007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5214  NAD-dependent epimerase/dehydratase  38 
 
 		 285 aa  43.1  0.008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.304626 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1373  hypothetical protein  46.3 
 
 		 240 aa  43.1  0.008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.15401  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2614  GDP-mannose 4,6-dehydratase  30.71 
 
 		 342 aa  42.7  0.009  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2097  NAD-dependent epimerase/dehydratase  46.67 
 
 		 213 aa  42.7  0.01  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.427063  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0458  hypothetical protein  46.3 
 
 		 208 aa  42.7  0.01  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0694  hypothetical protein  46.3 
 
 		 213 aa  42.7  0.01  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00014158  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1176  hypothetical protein  46.3 
 
 		 213 aa  42.7  0.01  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.335392  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1783  hypothetical protein  46.3 
 
 		 208 aa  42.7  0.01  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0359624  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>