60 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bind_0792 on replicon NC_010581
Organism: Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010581  Bind_0792  NAD-dependent epimerase/dehydratase  100 
 
 		 351 aa  713    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0947  NAD-dependent epimerase/dehydratase  73.78 
 
 		 351 aa  528  1e-149  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0589188  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1116  NAD-dependent epimerase/dehydratase  51.74 
 
 		 375 aa  337  1.9999999999999998e-91  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1266  NAD-dependent epimerase/dehydratase  51.74 
 
 		 350 aa  335  5e-91  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.892328  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3058  NAD-dependent epimerase/dehydratase  42.2 
 
 		 350 aa  291  1e-77  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39930  hypothetical protein  45.66 
 
 		 350 aa  290  3e-77  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0190143  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4680  NAD-dependent epimerase/dehydratase  40.92 
 
 		 352 aa  275  9e-73  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.181232  hitchhiker  0.000198161 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5283  NAD-dependent epimerase/dehydratase  41.45 
 
 		 352 aa  248  1e-64  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1785  hypothetical protein  42.69 
 
 		 375 aa  244  1.9999999999999999e-63  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.599753 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3616  hypothetical protein  38.73 
 
 		 357 aa  221  9.999999999999999e-57  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0272546  normal  1 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5140  hypothetical protein  38.37 
 
 		 360 aa  211  1e-53  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2695  hypothetical protein  38.59 
 
 		 353 aa  209  8e-53  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0626105  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0869  hypothetical protein  34.92 
 
 		 356 aa  209  8e-53  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.452866  normal  0.48377 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2429  hypothetical protein  38.03 
 
 		 353 aa  206  3e-52  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.143055  normal  0.111053 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4325  NAD-dependent epimerase/dehydratase  37.68 
 
 		 353 aa  207  3e-52  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.488542 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4434  NAD-dependent epimerase/dehydratase  37.54 
 
 		 353 aa  205  9e-52  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.324626 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3957  NAD-dependent epimerase/dehydratase  37.11 
 
 		 353 aa  204  2e-51  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6626  NAD-dependent epimerase/dehydratase  39.15 
 
 		 354 aa  202  9.999999999999999e-51  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.208307  normal  0.360352 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34450  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  37.61 
 
 		 358 aa  202  9.999999999999999e-51  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.306905  normal  0.223868 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1981  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.23 
 
 		 355 aa  197  3e-49  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3779  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase protein  34.84 
 
 		 353 aa  192  7e-48  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0359  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.52 
 
 		 368 aa  191  1e-47  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.748859  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1079  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.51 
 
 		 353 aa  191  2e-47  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4109  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.94 
 
 		 368 aa  189  8e-47  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2129  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.83 
 
 		 355 aa  187  2e-46  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.461337 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2324  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.28 
 
 		 354 aa  182  9.000000000000001e-45  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.485838  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3364  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.96 
 
 		 363 aa  181  2e-44  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5534  NAD-dependent epimerase/dehydratase  40.38 
 
 		 213 aa  180  2.9999999999999997e-44  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.397768 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1008  hypothetical protein  34.71 
 
 		 362 aa  175  8e-43  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0504  NAD-dependent epimerase/dehydratase  36.18 
 
 		 375 aa  172  5.999999999999999e-42  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.836684  normal  0.0567731 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3123  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.78 
 
 		 373 aa  171  2e-41  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3850  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.5 
 
 		 373 aa  168  1e-40  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00595  aldo-keto reductase family protein  34.35 
 
 		 292 aa  163  4.0000000000000004e-39  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_09028  conserved hypothetical protein  27.06 
 
 		 376 aa  130  3e-29  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_04177  NAD dependent epimerase/dehydratase family protein (AFU_orthologue; AFUA_8G00600)  32.37 
 
 		 424 aa  127  3e-28  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01302  conserved hypothetical protein  26.03 
 
 		 432 aa  107  3e-22  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02921  conserved hypothetical protein  24.91 
 
 		 437 aa  85.1  0.000000000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.569439 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2301  hypothetical protein  41.89 
 
 		 78 aa  60.5  0.00000005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.181563 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1168  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.04 
 
 		 320 aa  55.1  0.000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1227  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.72 
 
 		 320 aa  52.8  0.000008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1329  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.72 
 
 		 327 aa  52.8  0.000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0774  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.32 
 
 		 321 aa  52.8  0.00001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.966324  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0763  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.05 
 
 		 320 aa  50.1  0.00005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0855  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.46 
 
 		 321 aa  49.7  0.00008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05289  conserved hypothetical protein  25.34 
 
 		 388 aa  49.7  0.00008  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  hitchhiker  0.00191099  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0885  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.46 
 
 		 321 aa  48.9  0.0001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0406  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.46 
 
 		 321 aa  48.9  0.0001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3982  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.37 
 
 		 320 aa  48.5  0.0002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.667307 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2122  hypothetical protein  31.25 
 
 		 329 aa  47.8  0.0003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.744824  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1781  hopanoid-associated sugar epimerase  31.25 
 
 		 329 aa  47.8  0.0003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.889296  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1215  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.52 
 
 		 329 aa  47.4  0.0004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.190053  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3216  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.39 
 
 		 373 aa  46.6  0.0006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4317  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.7 
 
 		 276 aa  46.6  0.0007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.191598  normal  0.130895 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0670  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.01 
 
 		 310 aa  45.8  0.001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.125394  normal  0.553916 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5601  oxidoreductase domain protein  25.77 
 
 		 746 aa  44.7  0.003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4306  UDP-glucose 4-epimerase  24.73 
 
 		 324 aa  44.3  0.003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.0064009  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2079  NmrA family protein  30 
 
 		 605 aa  43.9  0.004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3266  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.67 
 
 		 321 aa  43.9  0.004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3113  NAD-dependent epimerase/dehydratase  21.72 
 
 		 333 aa  43.5  0.006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0280203  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2506  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.64 
 
 		 321 aa  42.7  0.009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>