61 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_4109 on replicon NC_010676
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010676  Bphyt_4109  NAD-dependent epimerase/dehydratase  100 
 
 		 368 aa  760    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1981  NAD-dependent epimerase/dehydratase  76.27 
 
 		 355 aa  567  1e-160  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4434  NAD-dependent epimerase/dehydratase  64.97 
 
 		 353 aa  476  1e-133  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.324626 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6626  NAD-dependent epimerase/dehydratase  64.97 
 
 		 354 aa  475  1e-133  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.208307  normal  0.360352 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3957  NAD-dependent epimerase/dehydratase  64.41 
 
 		 353 aa  471  1e-132  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4325  NAD-dependent epimerase/dehydratase  64.41 
 
 		 353 aa  470  1.0000000000000001e-131  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.488542 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1079  NAD-dependent epimerase/dehydratase  63.38 
 
 		 353 aa  459  9.999999999999999e-129  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2129  NAD-dependent epimerase/dehydratase  62.99 
 
 		 355 aa  459  9.999999999999999e-129  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.461337 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2324  NAD-dependent epimerase/dehydratase  61.41 
 
 		 354 aa  449  1e-125  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.485838  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2429  hypothetical protein  58.76 
 
 		 353 aa  444  1e-123  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.143055  normal  0.111053 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3779  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase protein  59.44 
 
 		 353 aa  442  1e-123  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2695  hypothetical protein  58.47 
 
 		 353 aa  440  9.999999999999999e-123  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0626105  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0359  NAD-dependent epimerase/dehydratase  55.12 
 
 		 368 aa  420  1e-116  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.748859  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3364  NAD-dependent epimerase/dehydratase  56.53 
 
 		 363 aa  401  1e-111  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0504  NAD-dependent epimerase/dehydratase  53.71 
 
 		 375 aa  383  1e-105  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.836684  normal  0.0567731 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34450  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  51.14 
 
 		 358 aa  369  1e-101  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.306905  normal  0.223868 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00595  aldo-keto reductase family protein  60.48 
 
 		 292 aa  363  3e-99  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3058  NAD-dependent epimerase/dehydratase  37.71 
 
 		 350 aa  224  1e-57  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39930  hypothetical protein  36.77 
 
 		 350 aa  206  4e-52  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0190143  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4680  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.75 
 
 		 352 aa  201  9.999999999999999e-51  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.181232  hitchhiker  0.000198161 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5283  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.56 
 
 		 352 aa  201  9.999999999999999e-51  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3616  hypothetical protein  35.57 
 
 		 357 aa  188  1e-46  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0272546  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0792  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.94 
 
 		 351 aa  180  4e-44  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5140  hypothetical protein  32.6 
 
 		 360 aa  179  5.999999999999999e-44  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0947  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.05 
 
 		 351 aa  177  3e-43  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0589188  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1785  hypothetical protein  33.52 
 
 		 375 aa  174  1.9999999999999998e-42  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.599753 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1116  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.06 
 
 		 375 aa  171  1e-41  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0869  hypothetical protein  33.42 
 
 		 356 aa  169  5e-41  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.452866  normal  0.48377 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1266  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.3 
 
 		 350 aa  167  2e-40  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.892328  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1008  hypothetical protein  32.08 
 
 		 362 aa  161  2e-38  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3123  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.56 
 
 		 373 aa  147  3e-34  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3850  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.83 
 
 		 373 aa  146  5e-34  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5534  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.18 
 
 		 213 aa  140  4.999999999999999e-32  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.397768 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_09028  conserved hypothetical protein  30.05 
 
 		 376 aa  135  9e-31  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_04177  NAD dependent epimerase/dehydratase family protein (AFU_orthologue; AFUA_8G00600)  27.57 
 
 		 424 aa  132  1.0000000000000001e-29  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01302  conserved hypothetical protein  26.34 
 
 		 432 aa  118  9.999999999999999e-26  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02921  conserved hypothetical protein  30.73 
 
 		 437 aa  86.7  6e-16  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.569439 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1215  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.11 
 
 		 329 aa  58.2  0.0000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.190053  normal  1 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05289  conserved hypothetical protein  22.84 
 
 		 388 aa  53.1  0.000008  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  hitchhiker  0.00191099  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1207  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.04 
 
 		 339 aa  50.4  0.00005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0228638  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1774  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.01 
 
 		 348 aa  49.3  0.00009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.174057  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1484  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.3 
 
 		 330 aa  46.6  0.0008  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2297  GDP-D-mannose dehydratase, putative  35.37 
 
 		 337 aa  45.1  0.002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5325  NmrA family protein  33.33 
 
 		 286 aa  45.4  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.260355  normal  0.558765 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2727  NAD-dependent epimerase/dehydratase  38.24 
 
 		 340 aa  45.1  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.430894  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3293  WcbK  35.37 
 
 		 337 aa  45.1  0.002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.402008  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0531  putative GDP-D-mannose dehydratase  35.37 
 
 		 337 aa  45.1  0.002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.212911  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2175  putative GDP-D-mannose dehydratase  35.37 
 
 		 337 aa  45.1  0.002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.687698  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1069  putative GDP-D-mannose dehydratase  35.37 
 
 		 337 aa  45.1  0.002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.351699  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3279  GDP-6-deoxy-D-lyxo-4-hexulose reductase  35.37 
 
 		 337 aa  45.1  0.002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.409914  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3244  GDP-6-deoxy-D-lyxo-4-hexulose reductase  35.37 
 
 		 337 aa  45.4  0.002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2301  hypothetical protein  35.9 
 
 		 78 aa  44.7  0.003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.181563 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3281  NAD-dependent epimerase/dehydratase  46.88 
 
 		 319 aa  43.9  0.004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.711314 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4084  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.98 
 
 		 355 aa  43.5  0.005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.129655 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1685  NAD-dependent epimerase/dehydratase  22.51 
 
 		 309 aa  43.5  0.006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1606  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.48 
 
 		 482 aa  43.5  0.006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_08060  oxidoreductase CipA-like, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G01630)  31.63 
 
 		 340 aa  43.5  0.006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.19032  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00593  hypothetical protein  51.02 
 
 		 53 aa  43.1  0.007  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1119  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.35 
 
 		 228 aa  43.1  0.008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0232972  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0684  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  54.05 
 
 		 227 aa  42.7  0.01  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0168  NAD-dependent epimerase/dehydratase  44 
 
 		 285 aa  42.7  0.01  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0296892 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>