72 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_3779 on replicon NC_011989
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011989  Avi_3779  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase protein  100 
 
 		 353 aa  724    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2129  NAD-dependent epimerase/dehydratase  73.09 
 
 		 355 aa  558  1e-158  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.461337 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1079  NAD-dependent epimerase/dehydratase  73.65 
 
 		 353 aa  548  1e-155  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2429  hypothetical protein  71.67 
 
 		 353 aa  531  1e-150  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.143055  normal  0.111053 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4325  NAD-dependent epimerase/dehydratase  71.95 
 
 		 353 aa  524  1e-148  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.488542 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3957  NAD-dependent epimerase/dehydratase  71.67 
 
 		 353 aa  525  1e-148  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2695  hypothetical protein  70.25 
 
 		 353 aa  521  1e-147  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0626105  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4434  NAD-dependent epimerase/dehydratase  70.25 
 
 		 353 aa  514  1.0000000000000001e-145  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.324626 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6626  NAD-dependent epimerase/dehydratase  69.49 
 
 		 354 aa  507  9.999999999999999e-143  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.208307  normal  0.360352 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0359  NAD-dependent epimerase/dehydratase  64.67 
 
 		 368 aa  485  1e-136  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.748859  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1981  NAD-dependent epimerase/dehydratase  63.84 
 
 		 355 aa  459  9.999999999999999e-129  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2324  NAD-dependent epimerase/dehydratase  61.58 
 
 		 354 aa  450  1e-125  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.485838  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4109  NAD-dependent epimerase/dehydratase  59.44 
 
 		 368 aa  442  1e-123  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3364  NAD-dependent epimerase/dehydratase  60.11 
 
 		 363 aa  412  1e-114  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0504  NAD-dependent epimerase/dehydratase  57.59 
 
 		 375 aa  391  1e-107  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.836684  normal  0.0567731 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34450  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  55.01 
 
 		 358 aa  383  1e-105  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.306905  normal  0.223868 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00595  aldo-keto reductase family protein  58.13 
 
 		 292 aa  340  2e-92  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3058  NAD-dependent epimerase/dehydratase  38.76 
 
 		 350 aa  222  6e-57  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0947  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.31 
 
 		 351 aa  195  8.000000000000001e-49  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0589188  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4680  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.38 
 
 		 352 aa  192  8e-48  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.181232  hitchhiker  0.000198161 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0792  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.84 
 
 		 351 aa  187  2e-46  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5283  NAD-dependent epimerase/dehydratase  36.01 
 
 		 352 aa  187  3e-46  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1116  NAD-dependent epimerase/dehydratase  36.09 
 
 		 375 aa  179  4.999999999999999e-44  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39930  hypothetical protein  34.82 
 
 		 350 aa  177  2e-43  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0190143  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1266  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.57 
 
 		 350 aa  176  7e-43  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.892328  normal  1 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5140  hypothetical protein  35.14 
 
 		 360 aa  173  3.9999999999999995e-42  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1785  hypothetical protein  33.9 
 
 		 375 aa  173  3.9999999999999995e-42  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.599753 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3616  hypothetical protein  35.77 
 
 		 357 aa  171  2e-41  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0272546  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1008  hypothetical protein  33.24 
 
 		 362 aa  161  2e-38  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0869  hypothetical protein  30.27 
 
 		 356 aa  160  3e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.452866  normal  0.48377 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3123  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.42 
 
 		 373 aa  155  1e-36  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3850  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.16 
 
 		 373 aa  152  1e-35  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5534  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.88 
 
 		 213 aa  139  6e-32  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.397768 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_09028  conserved hypothetical protein  29.24 
 
 		 376 aa  135  9.999999999999999e-31  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_04177  NAD dependent epimerase/dehydratase family protein (AFU_orthologue; AFUA_8G00600)  28.91 
 
 		 424 aa  130  4.0000000000000003e-29  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01302  conserved hypothetical protein  28.27 
 
 		 432 aa  124  2e-27  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02921  conserved hypothetical protein  30.21 
 
 		 437 aa  108  2e-22  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.569439 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00593  hypothetical protein  54 
 
 		 53 aa  57.4  0.0000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1710  NAD-dependent epimerase/dehydratase  46.03 
 
 		 326 aa  56.2  0.0000009  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0939  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.77 
 
 		 324 aa  54.3  0.000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0249986  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1853  NAD-dependent epimerase/dehydratase  42.86 
 
 		 319 aa  51.2  0.00003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.669064  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3281  NAD-dependent epimerase/dehydratase  45.71 
 
 		 319 aa  49.7  0.00008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.711314 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1700  NDP-hexose epimerase/oxydoreductase  34.38 
 
 		 304 aa  49.3  0.0001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0751046  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0688  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.29 
 
 		 276 aa  49.3  0.0001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1629  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.38 
 
 		 304 aa  49.3  0.0001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.356198  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17440  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  32.43 
 
 		 330 aa  49.3  0.0001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.147754  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1215  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32 
 
 		 329 aa  48.9  0.0001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.190053  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3021  NAD-dependent epimerase/dehydratase  38.14 
 
 		 349 aa  47.8  0.0003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1909  CDP-glucose 4,6-dehydratase  28.49 
 
 		 369 aa  47.4  0.0004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36590  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  35.24 
 
 		 330 aa  47  0.0005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05289  conserved hypothetical protein  23.13 
 
 		 388 aa  46.6  0.0006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  hitchhiker  0.00191099  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2562  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  27.62 
 
 		 285 aa  45.8  0.001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2132  GDP-mannose 4,6-dehydratase  29.66 
 
 		 348 aa  45.4  0.001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.0323729 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1270  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.14 
 
 		 368 aa  45.1  0.002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.329626 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0401  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.04 
 
 		 296 aa  44.7  0.003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0547  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase-like  25.7 
 
 		 347 aa  44.7  0.003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.403557 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0881  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.04 
 
 		 296 aa  44.7  0.003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0977  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.15 
 
 		 294 aa  44.7  0.003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0152042  normal  0.193057 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0340  carbon-nitrogen family hydrolase  26.72 
 
 		 241 aa  44.3  0.003  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1506  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  35.92 
 
 		 364 aa  44.7  0.003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.185126  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0508  GDP-mannose 4,6-dehydratase  26.49 
 
 		 327 aa  43.9  0.004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.174744  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1168  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.49 
 
 		 320 aa  44.3  0.004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0898  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.6 
 
 		 309 aa  43.9  0.005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.760567  normal  0.885082 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2858  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.11 
 
 		 417 aa  43.5  0.006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0350628  normal  0.478432 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4085  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.34 
 
 		 211 aa  43.5  0.006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0412177  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2367  GDP-mannose 4,6-dehydratase  36.99 
 
 		 328 aa  43.5  0.006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00426959 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3027  Short-chain dehydrogenase/reductase  29.63 
 
 		 259 aa  43.1  0.007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.730472  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0576  UDP-glucose 4-epimerase  29.36 
 
 		 325 aa  42.7  0.008  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1826  mRNA-binding protein  25.21 
 
 		 313 aa  43.1  0.008  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.334449 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2717  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.55 
 
 		 308 aa  42.7  0.009  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1028  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25 
 
 		 331 aa  42.7  0.01  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1484  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.27 
 
 		 330 aa  42.7  0.01  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>