68 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spro_3058 on replicon NC_009832
Organism: Serratia proteamaculans 568



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009832  Spro_3058  NAD-dependent epimerase/dehydratase  100 
 
 		 350 aa  716    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4680  NAD-dependent epimerase/dehydratase  68.88 
 
 		 352 aa  508  1e-143  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.181232  hitchhiker  0.000198161 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39930  hypothetical protein  47.58 
 
 		 350 aa  325  8.000000000000001e-88  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0190143  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5283  NAD-dependent epimerase/dehydratase  46.11 
 
 		 352 aa  314  1.9999999999999998e-84  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0947  NAD-dependent epimerase/dehydratase  42.77 
 
 		 351 aa  295  9e-79  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0589188  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3616  hypothetical protein  43.77 
 
 		 357 aa  291  1e-77  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0272546  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0792  NAD-dependent epimerase/dehydratase  42.2 
 
 		 351 aa  285  5.999999999999999e-76  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0869  hypothetical protein  40.68 
 
 		 356 aa  271  9e-72  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.452866  normal  0.48377 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1785  hypothetical protein  39.94 
 
 		 375 aa  241  9e-63  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.599753 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5140  hypothetical protein  38.68 
 
 		 360 aa  239  4e-62  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2695  hypothetical protein  40.88 
 
 		 353 aa  238  1e-61  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0626105  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2429  hypothetical protein  40.06 
 
 		 353 aa  235  7e-61  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.143055  normal  0.111053 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1266  NAD-dependent epimerase/dehydratase  38.53 
 
 		 350 aa  230  3e-59  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.892328  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1116  NAD-dependent epimerase/dehydratase  38.53 
 
 		 375 aa  230  3e-59  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4109  NAD-dependent epimerase/dehydratase  37.71 
 
 		 368 aa  224  1e-57  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3779  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase protein  38.76 
 
 		 353 aa  222  6e-57  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6626  NAD-dependent epimerase/dehydratase  38.48 
 
 		 354 aa  218  1e-55  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.208307  normal  0.360352 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3364  NAD-dependent epimerase/dehydratase  38.5 
 
 		 363 aa  218  1e-55  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2324  NAD-dependent epimerase/dehydratase  39.44 
 
 		 354 aa  218  1e-55  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.485838  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1079  NAD-dependent epimerase/dehydratase  37.92 
 
 		 353 aa  215  9e-55  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1981  NAD-dependent epimerase/dehydratase  36.34 
 
 		 355 aa  214  1.9999999999999998e-54  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34450  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  39.04 
 
 		 358 aa  213  4.9999999999999996e-54  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.306905  normal  0.223868 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4325  NAD-dependent epimerase/dehydratase  38.48 
 
 		 353 aa  212  7e-54  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.488542 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5534  NAD-dependent epimerase/dehydratase  42.72 
 
 		 213 aa  212  7e-54  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.397768 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3957  NAD-dependent epimerase/dehydratase  38.2 
 
 		 353 aa  211  1e-53  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0359  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.91 
 
 		 368 aa  211  1e-53  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.748859  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2129  NAD-dependent epimerase/dehydratase  36.19 
 
 		 355 aa  206  5e-52  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.461337 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4434  NAD-dependent epimerase/dehydratase  37.36 
 
 		 353 aa  204  1e-51  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.324626 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1008  hypothetical protein  34.25 
 
 		 362 aa  194  2e-48  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0504  NAD-dependent epimerase/dehydratase  37.64 
 
 		 375 aa  190  2.9999999999999997e-47  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.836684  normal  0.0567731 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3123  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.98 
 
 		 373 aa  182  6e-45  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_09028  conserved hypothetical protein  30.4 
 
 		 376 aa  181  2e-44  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3850  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.7 
 
 		 373 aa  179  5.999999999999999e-44  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00595  aldo-keto reductase family protein  37.29 
 
 		 292 aa  175  9.999999999999999e-43  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_04177  NAD dependent epimerase/dehydratase family protein (AFU_orthologue; AFUA_8G00600)  28.85 
 
 		 424 aa  150  3e-35  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01302  conserved hypothetical protein  28.4 
 
 		 432 aa  137  4e-31  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02921  conserved hypothetical protein  30.25 
 
 		 437 aa  106  7e-22  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.569439 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1481  epimerase/dehydratase  26.21 
 
 		 332 aa  53.1  0.000007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2673  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.86 
 
 		 243 aa  52.8  0.000009  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.888248  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1499  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.46 
 
 		 240 aa  50.4  0.00004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.685954  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3897  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.73 
 
 		 301 aa  50.4  0.00004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3782  putative epimerase/dehydratase  26.58 
 
 		 318 aa  50.1  0.00005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.585015  normal  0.508619 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3542  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.11 
 
 		 229 aa  48.5  0.0002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.352475  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5601  oxidoreductase domain protein  24.44 
 
 		 746 aa  48.5  0.0002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4174  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.02 
 
 		 326 aa  47.4  0.0004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.93932  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2547  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  26.42 
 
 		 334 aa  47  0.0005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000000238477  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0922  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.56 
 
 		 327 aa  47  0.0005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0230  NAD-dependent epimerase/dehydratase  41.43 
 
 		 304 aa  47  0.0005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0624037  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10130  short chain dehydrogenase  40.85 
 
 		 238 aa  47  0.0005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000206354  normal  0.858478 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3713  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.72 
 
 		 229 aa  46.6  0.0007  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0753  saccharopine dehydrogenase  36.51 
 
 		 356 aa  45.1  0.002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0487  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.93 
 
 		 305 aa  45.1  0.002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00126012  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8132  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.86 
 
 		 227 aa  45.1  0.002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.513272  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0685  saccharopine dehydrogenase  36.51 
 
 		 356 aa  45.1  0.002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2301  hypothetical protein  34.25 
 
 		 78 aa  44.7  0.002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.181563 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0977  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.67 
 
 		 459 aa  45.4  0.002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0520232 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0799  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  23.64 
 
 		 301 aa  44.7  0.002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2153  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  25.85 
 
 		 242 aa  44.7  0.003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2599  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.91 
 
 		 324 aa  44.7  0.003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02816  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.81 
 
 		 162 aa  44.3  0.003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2058  NmrA family protein  31.33 
 
 		 506 aa  44.7  0.003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.584993  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0694  NAD dependent epimerase/dehydratase family  23.64 
 
 		 301 aa  43.5  0.005  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4696  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.61 
 
 		 326 aa  43.5  0.005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.990453 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0262  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.46 
 
 		 320 aa  43.5  0.006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0684  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.53 
 
 		 227 aa  43.5  0.006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1783  NAD-dependent epimerase/dehydratase  23.81 
 
 		 334 aa  43.5  0.006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.81312  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0224  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.54 
 
 		 327 aa  42.7  0.008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.410647 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1900  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.19 
 
 		 313 aa  42.7  0.009  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.186347 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>