51 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mext_1116 on replicon NC_010172
Organism: Methylobacterium extorquens PA1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010172  Mext_1116  NAD-dependent epimerase/dehydratase  100 
 
 		 375 aa  754    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1266  NAD-dependent epimerase/dehydratase  98 
 
 		 350 aa  696    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.892328  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0947  NAD-dependent epimerase/dehydratase  51.45 
 
 		 351 aa  330  3e-89  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0589188  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0792  NAD-dependent epimerase/dehydratase  51.74 
 
 		 351 aa  318  7e-86  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39930  hypothetical protein  44.51 
 
 		 350 aa  279  5e-74  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0190143  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5283  NAD-dependent epimerase/dehydratase  41.26 
 
 		 352 aa  256  3e-67  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1785  hypothetical protein  42.2 
 
 		 375 aa  235  9e-61  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.599753 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4680  NAD-dependent epimerase/dehydratase  38.11 
 
 		 352 aa  234  2.0000000000000002e-60  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.181232  hitchhiker  0.000198161 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5140  hypothetical protein  38.27 
 
 		 360 aa  230  3e-59  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3058  NAD-dependent epimerase/dehydratase  38.53 
 
 		 350 aa  230  3e-59  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3616  hypothetical protein  38.11 
 
 		 357 aa  221  1.9999999999999999e-56  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0272546  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34450  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  41.34 
 
 		 358 aa  208  1e-52  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.306905  normal  0.223868 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2429  hypothetical protein  37.81 
 
 		 353 aa  199  5e-50  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.143055  normal  0.111053 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2695  hypothetical protein  37.53 
 
 		 353 aa  196  7e-49  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0626105  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3123  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.36 
 
 		 373 aa  194  2e-48  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0869  hypothetical protein  33.15 
 
 		 356 aa  194  2e-48  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.452866  normal  0.48377 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4325  NAD-dependent epimerase/dehydratase  39.3 
 
 		 353 aa  191  2e-47  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.488542 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4434  NAD-dependent epimerase/dehydratase  38.75 
 
 		 353 aa  191  2e-47  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.324626 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3957  NAD-dependent epimerase/dehydratase  39.02 
 
 		 353 aa  190  4e-47  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1981  NAD-dependent epimerase/dehydratase  36.49 
 
 		 355 aa  189  5e-47  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3850  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.81 
 
 		 373 aa  189  5.999999999999999e-47  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0359  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.85 
 
 		 368 aa  188  1e-46  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.748859  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2324  NAD-dependent epimerase/dehydratase  37.26 
 
 		 354 aa  188  2e-46  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.485838  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6626  NAD-dependent epimerase/dehydratase  37.6 
 
 		 354 aa  183  4.0000000000000006e-45  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.208307  normal  0.360352 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5534  NAD-dependent epimerase/dehydratase  41.04 
 
 		 213 aa  182  9.000000000000001e-45  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.397768 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1008  hypothetical protein  37.16 
 
 		 362 aa  181  2e-44  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3779  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase protein  36.09 
 
 		 353 aa  179  5.999999999999999e-44  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3364  NAD-dependent epimerase/dehydratase  36.39 
 
 		 363 aa  179  7e-44  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1079  NAD-dependent epimerase/dehydratase  36.41 
 
 		 353 aa  179  9e-44  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2129  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.25 
 
 		 355 aa  179  9e-44  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.461337 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0504  NAD-dependent epimerase/dehydratase  39.78 
 
 		 375 aa  177  3e-43  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.836684  normal  0.0567731 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4109  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.06 
 
 		 368 aa  171  1e-41  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00595  aldo-keto reductase family protein  36.18 
 
 		 292 aa  164  2.0000000000000002e-39  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_09028  conserved hypothetical protein  27.85 
 
 		 376 aa  145  1e-33  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_04177  NAD dependent epimerase/dehydratase family protein (AFU_orthologue; AFUA_8G00600)  27.71 
 
 		 424 aa  129  6e-29  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01302  conserved hypothetical protein  27.97 
 
 		 432 aa  128  1.0000000000000001e-28  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02921  conserved hypothetical protein  27.27 
 
 		 437 aa  106  6e-22  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.569439 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0915  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.34 
 
 		 298 aa  54.3  0.000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5171  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.23 
 
 		 271 aa  52.8  0.00001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05289  conserved hypothetical protein  25.35 
 
 		 388 aa  51.2  0.00003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  hitchhiker  0.00191099  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4317  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.22 
 
 		 276 aa  50.4  0.00004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.191598  normal  0.130895 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1800  oxidoreductase Rmd  31.4 
 
 		 298 aa  48.1  0.0002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0661573 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1168  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.01 
 
 		 320 aa  46.6  0.0007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3031  O-antigen biosynthetic gene WbjF  26.29 
 
 		 320 aa  45.1  0.002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0487  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.03 
 
 		 305 aa  45.4  0.002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00126012  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1956  putative NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.34 
 
 		 320 aa  45.4  0.002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  decreased coverage  0.000864089  hitchhiker  0.00126231 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4820  NAD-dependent epimerase/dehydratase  38.6 
 
 		 342 aa  44.3  0.003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.503744  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36590  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  33.33 
 
 		 330 aa  43.9  0.005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2301  hypothetical protein  28.21 
 
 		 78 aa  43.5  0.006  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.181563 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1329  NAD-dependent epimerase/dehydratase  38.98 
 
 		 327 aa  43.5  0.006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1227  NAD-dependent epimerase/dehydratase  39.09 
 
 		 320 aa  43.5  0.007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>