80 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gdia_0947 on replicon NC_011365
Organism: Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011365  Gdia_0947  NAD-dependent epimerase/dehydratase  100 
 
 		 351 aa  707    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0589188  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0792  NAD-dependent epimerase/dehydratase  73.78 
 
 		 351 aa  514  1.0000000000000001e-145  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1116  NAD-dependent epimerase/dehydratase  51.45 
 
 		 375 aa  330  2e-89  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1266  NAD-dependent epimerase/dehydratase  51.45 
 
 		 350 aa  328  1.0000000000000001e-88  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.892328  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3058  NAD-dependent epimerase/dehydratase  42.77 
 
 		 350 aa  295  9e-79  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39930  hypothetical protein  46.82 
 
 		 350 aa  294  2e-78  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0190143  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4680  NAD-dependent epimerase/dehydratase  40.06 
 
 		 352 aa  275  9e-73  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.181232  hitchhiker  0.000198161 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5283  NAD-dependent epimerase/dehydratase  42.78 
 
 		 352 aa  275  1.0000000000000001e-72  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1785  hypothetical protein  45.95 
 
 		 375 aa  263  4e-69  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.599753 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3616  hypothetical protein  40.75 
 
 		 357 aa  238  1e-61  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0272546  normal  1 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5140  hypothetical protein  38.57 
 
 		 360 aa  226  3e-58  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4325  NAD-dependent epimerase/dehydratase  38.66 
 
 		 353 aa  207  3e-52  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.488542 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3957  NAD-dependent epimerase/dehydratase  38.66 
 
 		 353 aa  206  3e-52  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4434  NAD-dependent epimerase/dehydratase  37.64 
 
 		 353 aa  202  5e-51  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.324626 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6626  NAD-dependent epimerase/dehydratase  37.96 
 
 		 354 aa  200  3e-50  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.208307  normal  0.360352 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0869  hypothetical protein  34.45 
 
 		 356 aa  200  3.9999999999999996e-50  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.452866  normal  0.48377 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3779  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase protein  35.31 
 
 		 353 aa  195  8.000000000000001e-49  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1079  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.13 
 
 		 353 aa  191  1e-47  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34450  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  36.18 
 
 		 358 aa  191  2e-47  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.306905  normal  0.223868 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2695  hypothetical protein  35.39 
 
 		 353 aa  190  2.9999999999999997e-47  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0626105  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2129  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.82 
 
 		 355 aa  190  4e-47  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.461337 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2429  hypothetical protein  35.11 
 
 		 353 aa  189  8e-47  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.143055  normal  0.111053 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5534  NAD-dependent epimerase/dehydratase  40.85 
 
 		 213 aa  189  8e-47  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.397768 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0359  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.24 
 
 		 368 aa  185  9e-46  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.748859  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3123  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.43 
 
 		 373 aa  184  2.0000000000000003e-45  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3850  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.15 
 
 		 373 aa  181  1e-44  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3364  NAD-dependent epimerase/dehydratase  36.67 
 
 		 363 aa  178  1e-43  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4109  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.05 
 
 		 368 aa  177  3e-43  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1981  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.67 
 
 		 355 aa  176  7e-43  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2324  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.05 
 
 		 354 aa  175  9.999999999999999e-43  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.485838  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00595  aldo-keto reductase family protein  35.03 
 
 		 292 aa  169  7e-41  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0504  NAD-dependent epimerase/dehydratase  36.36 
 
 		 375 aa  169  9e-41  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.836684  normal  0.0567731 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1008  hypothetical protein  34.9 
 
 		 362 aa  167  4e-40  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_09028  conserved hypothetical protein  26.74 
 
 		 376 aa  134  3e-30  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_04177  NAD dependent epimerase/dehydratase family protein (AFU_orthologue; AFUA_8G00600)  30.63 
 
 		 424 aa  126  5e-28  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01302  conserved hypothetical protein  24.88 
 
 		 432 aa  112  8.000000000000001e-24  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02921  conserved hypothetical protein  26.94 
 
 		 437 aa  100  3e-20  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.569439 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0774  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.03 
 
 		 321 aa  63.2  0.000000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.966324  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2301  hypothetical protein  45.83 
 
 		 78 aa  60.8  0.00000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.181563 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0763  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.57 
 
 		 320 aa  60.1  0.00000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2765  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  28.72 
 
 		 321 aa  57  0.0000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.162172  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0935  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  28.72 
 
 		 321 aa  57  0.0000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.109062  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1840  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  28.72 
 
 		 321 aa  57  0.0000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.79417  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1978  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  28.72 
 
 		 321 aa  57  0.0000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.364672  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3092  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  28.72 
 
 		 321 aa  57  0.0000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3129  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  28.72 
 
 		 321 aa  56.2  0.0000007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3152  UDP-glucose 4-epimerase  28.93 
 
 		 321 aa  56.2  0.0000007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0406  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.2 
 
 		 321 aa  56.6  0.0000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0885  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.2 
 
 		 321 aa  56.6  0.0000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3782  putative epimerase/dehydratase  29.03 
 
 		 318 aa  55.8  0.000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.585015  normal  0.508619 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0855  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.02 
 
 		 321 aa  55.1  0.000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2506  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.92 
 
 		 321 aa  53.5  0.000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05289  conserved hypothetical protein  24.9 
 
 		 388 aa  52.4  0.00001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  hitchhiker  0.00191099  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1215  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.8 
 
 		 329 aa  50.1  0.00006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.190053  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1481  epimerase/dehydratase  28.01 
 
 		 332 aa  47.8  0.0003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3982  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.56 
 
 		 320 aa  47.8  0.0003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.667307 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0900  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.37 
 
 		 318 aa  47.4  0.0003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1987  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.48 
 
 		 328 aa  46.2  0.0008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17440  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  35.71 
 
 		 330 aa  45.4  0.002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.147754  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2291  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.04 
 
 		 318 aa  45.1  0.002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.334485  normal  0.485366 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4278  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.46 
 
 		 312 aa  44.7  0.003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0211938  n/a   
 
 
-
 
NC_006687  CNE03540  D-lactaldehyde dehydrogenase, putative  22.97 
 
 		 346 aa  44.7  0.003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2597  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.46 
 
 		 309 aa  44.7  0.003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0303  UDP-glucose 4-epimerase, putative  24.29 
 
 		 314 aa  43.9  0.004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0230  NAD-dependent epimerase/dehydratase  38.57 
 
 		 304 aa  44.3  0.004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0624037  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2588  NAD-dependent epimerase/dehydratase  21.63 
 
 		 321 aa  43.5  0.005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3484  NAD-dependent epimerase/dehydratase  22.99 
 
 		 326 aa  43.5  0.005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0127971 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0031  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.85 
 
 		 308 aa  43.5  0.005  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.891219  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0670  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.04 
 
 		 310 aa  43.5  0.005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.125394  normal  0.553916 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3049  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  39.53 
 
 		 335 aa  43.1  0.006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.138998  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1280  dihydroflavonol-4-reductase family protein  39.53 
 
 		 338 aa  43.1  0.007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0634  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.39 
 
 		 346 aa  43.1  0.007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.133207  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0338  UDP-glucose 4-epimerase  23.3 
 
 		 314 aa  43.1  0.007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2924  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  39.53 
 
 		 335 aa  43.1  0.007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0488644  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0976  dihydroflavonol-4-reductase family protein  39.53 
 
 		 338 aa  43.1  0.008  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1263  dihydroflavonol-4-reductase family protein  39.53 
 
 		 338 aa  43.1  0.008  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2237  dihydroflavonol-4-reductase family protein  39.53 
 
 		 335 aa  43.1  0.008  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1322  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.94 
 
 		 370 aa  43.1  0.008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0487  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.48 
 
 		 305 aa  42.7  0.009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00126012  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1853  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.82 
 
 		 319 aa  42.7  0.009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.669064  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>