97 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mchl_4325 on replicon NC_011757
Organism: Methylobacterium chloromethanicum CM4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011757  Mchl_4325  NAD-dependent epimerase/dehydratase  100 
 
 		 353 aa  709    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.488542 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4434  NAD-dependent epimerase/dehydratase  92.63 
 
 		 353 aa  667    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.324626 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3957  NAD-dependent epimerase/dehydratase  99.15 
 
 		 353 aa  703    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6626  NAD-dependent epimerase/dehydratase  78.81 
 
 		 354 aa  562  1.0000000000000001e-159  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.208307  normal  0.360352 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2129  NAD-dependent epimerase/dehydratase  75.35 
 
 		 355 aa  545  1e-154  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.461337 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1079  NAD-dependent epimerase/dehydratase  73.94 
 
 		 353 aa  533  1e-150  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3779  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase protein  71.95 
 
 		 353 aa  524  1e-148  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0359  NAD-dependent epimerase/dehydratase  66.38 
 
 		 368 aa  494  1e-139  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.748859  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2324  NAD-dependent epimerase/dehydratase  67.51 
 
 		 354 aa  488  1e-137  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.485838  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2429  hypothetical protein  63.74 
 
 		 353 aa  480  1e-134  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.143055  normal  0.111053 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2695  hypothetical protein  63.74 
 
 		 353 aa  476  1e-133  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0626105  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1981  NAD-dependent epimerase/dehydratase  65.82 
 
 		 355 aa  476  1e-133  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4109  NAD-dependent epimerase/dehydratase  64.41 
 
 		 368 aa  470  1.0000000000000001e-131  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3364  NAD-dependent epimerase/dehydratase  60.97 
 
 		 363 aa  410  1e-113  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0504  NAD-dependent epimerase/dehydratase  60.46 
 
 		 375 aa  403  1e-111  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.836684  normal  0.0567731 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34450  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  54.44 
 
 		 358 aa  378  1e-104  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.306905  normal  0.223868 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00595  aldo-keto reductase family protein  62.89 
 
 		 292 aa  364  1e-99  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3058  NAD-dependent epimerase/dehydratase  38.48 
 
 		 350 aa  212  7.999999999999999e-54  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5283  NAD-dependent epimerase/dehydratase  38.06 
 
 		 352 aa  210  4e-53  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39930  hypothetical protein  40.17 
 
 		 350 aa  209  8e-53  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0190143  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0947  NAD-dependent epimerase/dehydratase  38.66 
 
 		 351 aa  207  3e-52  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0589188  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4680  NAD-dependent epimerase/dehydratase  37.71 
 
 		 352 aa  207  3e-52  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.181232  hitchhiker  0.000198161 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0792  NAD-dependent epimerase/dehydratase  37.11 
 
 		 351 aa  200  3e-50  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1116  NAD-dependent epimerase/dehydratase  39.3 
 
 		 375 aa  191  2e-47  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1266  NAD-dependent epimerase/dehydratase  38.84 
 
 		 350 aa  188  1e-46  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.892328  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1785  hypothetical protein  37.36 
 
 		 375 aa  183  4.0000000000000006e-45  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.599753 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5140  hypothetical protein  36.66 
 
 		 360 aa  171  2e-41  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1008  hypothetical protein  34.95 
 
 		 362 aa  166  8e-40  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0869  hypothetical protein  31.61 
 
 		 356 aa  164  3e-39  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.452866  normal  0.48377 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3616  hypothetical protein  33.9 
 
 		 357 aa  160  5e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0272546  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3123  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.48 
 
 		 373 aa  154  2e-36  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3850  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.22 
 
 		 373 aa  153  4e-36  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_09028  conserved hypothetical protein  32.38 
 
 		 376 aa  153  4e-36  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5534  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.35 
 
 		 213 aa  145  1e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.397768 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_04177  NAD dependent epimerase/dehydratase family protein (AFU_orthologue; AFUA_8G00600)  27.38 
 
 		 424 aa  131  2.0000000000000002e-29  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01302  conserved hypothetical protein  27.6 
 
 		 432 aa  127  4.0000000000000003e-28  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02921  conserved hypothetical protein  29.82 
 
 		 437 aa  118  9.999999999999999e-26  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.569439 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1168  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.82 
 
 		 320 aa  60.8  0.00000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0939  NAD-dependent epimerase/dehydratase  36.99 
 
 		 324 aa  59.3  0.00000009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0249986  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1227  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.89 
 
 		 320 aa  57  0.0000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1329  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.89 
 
 		 327 aa  56.2  0.0000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3655  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.21 
 
 		 321 aa  56.2  0.0000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.033551  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00593  hypothetical protein  65.31 
 
 		 53 aa  55.8  0.000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1215  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.95 
 
 		 329 aa  55.1  0.000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.190053  normal  1 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05289  conserved hypothetical protein  25.73 
 
 		 388 aa  54.3  0.000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  hitchhiker  0.00191099  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1710  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.42 
 
 		 326 aa  52.8  0.000009  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0917  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.55 
 
 		 334 aa  52.4  0.00001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0702  NAD-dependent epimerase/dehydratase  42 
 
 		 292 aa  51.2  0.00003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36590  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  30.9 
 
 		 330 aa  50.4  0.00004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1853  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.02 
 
 		 319 aa  50.4  0.00005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.669064  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4567  GDP-mannose 4,6-dehydratase  32.11 
 
 		 325 aa  49.7  0.00008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1506  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  43.55 
 
 		 364 aa  49.3  0.0001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.185126  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2079  NmrA family protein  35.29 
 
 		 605 aa  48.5  0.0002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3928  GDP-mannose 4,6-dehydratase  31.13 
 
 		 324 aa  48.5  0.0002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0487  NAD-dependent epimerase/dehydratase  42.37 
 
 		 305 aa  47.8  0.0003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00126012  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0923  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  31.06 
 
 		 205 aa  47.4  0.0004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0864  NAD-dependent epimerase/dehydratase  37 
 
 		 328 aa  47.4  0.0004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3217  GDP-mannose 4,6-dehydratase  33.94 
 
 		 321 aa  47.4  0.0004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.304058 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2097  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.55 
 
 		 213 aa  47  0.0005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.427063  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1061  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.78 
 
 		 352 aa  46.6  0.0006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.808093  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2084  GDP-mannose 4,6-dehydratase  31.82 
 
 		 324 aa  46.6  0.0007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1189  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.91 
 
 		 352 aa  46.2  0.0009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2538  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.78 
 
 		 373 aa  45.4  0.001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000014544 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1120  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.91 
 
 		 352 aa  45.8  0.001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0108801  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3062  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.87 
 
 		 245 aa  45.4  0.001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.108862  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3281  NAD-dependent epimerase/dehydratase  47.14 
 
 		 319 aa  46.2  0.001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.711314 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1969  NAD-dependent epimerase/dehydratase  45.61 
 
 		 313 aa  45.8  0.001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.210288  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0168  NAD-dependent epimerase/dehydratase  40.26 
 
 		 285 aa  45.1  0.002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0296892 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4472  GDP-mannose 4,6-dehydratase  37.04 
 
 		 328 aa  44.7  0.002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.234866  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0209  NAD-dependent epimerase/dehydratase  41.94 
 
 		 307 aa  45.1  0.002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0178809  hitchhiker  0.0040496 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1991  NmrA family protein  32.8 
 
 		 290 aa  44.3  0.003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0720  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.02 
 
 		 297 aa  44.7  0.003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0688  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.64 
 
 		 276 aa  44.3  0.003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1673  NmrA family protein  32.8 
 
 		 290 aa  44.3  0.003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.491569  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3216  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.81 
 
 		 373 aa  44.3  0.003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2560  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.85 
 
 		 335 aa  44.7  0.003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23780  UDP-glucose 4-epimerase  30.07 
 
 		 308 aa  44.3  0.003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  hitchhiker  0.00097023  normal  0.178512 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0331  GDP-mannose 4,6-dehydratase  31.37 
 
 		 322 aa  44.3  0.003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1774  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.28 
 
 		 348 aa  43.9  0.004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.174057  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2545  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  36.67 
 
 		 375 aa  43.9  0.004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2612  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  36.67 
 
 		 375 aa  43.5  0.005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5305  NAD-dependent epimerase/dehydratase  43.14 
 
 		 285 aa  43.5  0.005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.622115  normal  0.159546 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2547  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  36.51 
 
 		 334 aa  43.5  0.005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000000238477  normal  1 
 
 
-
 
NC_007488  RSP_3989  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.22 
 
 		 332 aa  43.9  0.005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0771  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.91 
 
 		 305 aa  43.5  0.005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1332  GDP-6-deoxy-D-lyxo-4-hexulose reductase, putative  30.23 
 
 		 297 aa  43.9  0.005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5214  NAD-dependent epimerase/dehydratase  43.14 
 
 		 285 aa  43.5  0.005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.304626 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1683  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.34 
 
 		 373 aa  43.5  0.006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0436408  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1909  CDP-glucose 4,6-dehydratase  31.45 
 
 		 369 aa  43.1  0.007  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3444  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.36 
 
 		 334 aa  43.1  0.007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.105526  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1680  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.95 
 
 		 325 aa  43.1  0.008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0210493  normal  0.642206 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1900  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.94 
 
 		 358 aa  42.7  0.008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0547255  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0234  short chain dehydrogenase  44.07 
 
 		 227 aa  42.7  0.008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.100339 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3367  NmrA family protein  37.29 
 
 		 215 aa  42.7  0.009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.670735  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2622  GDP-mannose 4,6-dehydratase  31.58 
 
 		 344 aa  42.7  0.009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00207032  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1028  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.92 
 
 		 331 aa  42.7  0.009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1449  NmrA family protein  33.94 
 
 		 275 aa  42.7  0.01  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0204448  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>