19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PXO_00593 on replicon NC_010717
Organism: Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010717  PXO_00593  hypothetical protein  100 
 
 		 53 aa  106  1e-22  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3779  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase protein  54 
 
 		 353 aa  57.4  0.00000007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3957  NAD-dependent epimerase/dehydratase  65.31 
 
 		 353 aa  55.8  0.0000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4325  NAD-dependent epimerase/dehydratase  65.31 
 
 		 353 aa  55.8  0.0000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.488542 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4434  NAD-dependent epimerase/dehydratase  63.27 
 
 		 353 aa  54.7  0.0000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.324626 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2324  NAD-dependent epimerase/dehydratase  58.82 
 
 		 354 aa  52  0.000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.485838  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2129  NAD-dependent epimerase/dehydratase  53.33 
 
 		 355 aa  51.6  0.000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.461337 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0359  NAD-dependent epimerase/dehydratase  50.98 
 
 		 368 aa  50.1  0.00001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.748859  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1079  NAD-dependent epimerase/dehydratase  53.19 
 
 		 353 aa  48.5  0.00003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6626  NAD-dependent epimerase/dehydratase  57.14 
 
 		 354 aa  48.1  0.00004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.208307  normal  0.360352 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3364  NAD-dependent epimerase/dehydratase  52.17 
 
 		 363 aa  46.6  0.0001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2429  hypothetical protein  46.81 
 
 		 353 aa  46.2  0.0002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.143055  normal  0.111053 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1981  NAD-dependent epimerase/dehydratase  53.06 
 
 		 355 aa  46.2  0.0002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2695  hypothetical protein  46.81 
 
 		 353 aa  46.2  0.0002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0626105  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0504  NAD-dependent epimerase/dehydratase  52.17 
 
 		 375 aa  44.3  0.0005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.836684  normal  0.0567731 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4109  NAD-dependent epimerase/dehydratase  51.02 
 
 		 368 aa  43.1  0.001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0792  NAD-dependent epimerase/dehydratase  44.23 
 
 		 351 aa  42.4  0.002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34450  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  48.89 
 
 		 358 aa  40.8  0.007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.306905  normal  0.223868 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0770  GDP-mannose 4,6-dehydratase  52.78 
 
 		 346 aa  40  0.009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>