64 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Achl_3364 on replicon NC_011886
Organism: Arthrobacter chlorophenolicus A6



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011886  Achl_3364  NAD-dependent epimerase/dehydratase  100 
 
 
363 aa  739    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2129  NAD-dependent epimerase/dehydratase  59.94 
 
 
355 aa  429  1e-119  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.461337 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1981  NAD-dependent epimerase/dehydratase  61.43 
 
 
355 aa  425  1e-118  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2695  hypothetical protein  58.52 
 
 
353 aa  423  1e-117  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0626105  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4434  NAD-dependent epimerase/dehydratase  60.11 
 
 
353 aa  419  1e-116  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.324626 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2429  hypothetical protein  58.24 
 
 
353 aa  419  1e-116  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.143055  normal  0.111053 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4325  NAD-dependent epimerase/dehydratase  60.97 
 
 
353 aa  419  1e-116  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.488542 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3779  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase protein  60.11 
 
 
353 aa  419  1e-116  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2324  NAD-dependent epimerase/dehydratase  58.69 
 
 
354 aa  415  9.999999999999999e-116  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.485838  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34450  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  61.19 
 
 
358 aa  417  9.999999999999999e-116  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.306905  normal  0.223868 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1079  NAD-dependent epimerase/dehydratase  60.4 
 
 
353 aa  414  9.999999999999999e-116  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3957  NAD-dependent epimerase/dehydratase  60.68 
 
 
353 aa  417  9.999999999999999e-116  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6626  NAD-dependent epimerase/dehydratase  58.97 
 
 
354 aa  413  1e-114  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.208307  normal  0.360352 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4109  NAD-dependent epimerase/dehydratase  56.53 
 
 
368 aa  410  1e-113  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0504  NAD-dependent epimerase/dehydratase  61.47 
 
 
375 aa  407  1.0000000000000001e-112  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.836684  normal  0.0567731 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0359  NAD-dependent epimerase/dehydratase  55.81 
 
 
368 aa  400  9.999999999999999e-111  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.748859  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00595  aldo-keto reductase family protein  55.17 
 
 
292 aa  323  2e-87  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3058  NAD-dependent epimerase/dehydratase  38.5 
 
 
350 aa  225  1e-57  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39930  hypothetical protein  35.83 
 
 
350 aa  192  7e-48  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0190143  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5283  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.2 
 
 
352 aa  189  5e-47  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4680  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.7 
 
 
352 aa  189  7e-47  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.181232  hitchhiker  0.000198161 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1116  NAD-dependent epimerase/dehydratase  36.67 
 
 
375 aa  184  2.0000000000000003e-45  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0947  NAD-dependent epimerase/dehydratase  36.67 
 
 
351 aa  184  3e-45  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0589188  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1266  NAD-dependent epimerase/dehydratase  36.39 
 
 
350 aa  182  7e-45  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.892328  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0792  NAD-dependent epimerase/dehydratase  36.52 
 
 
351 aa  181  2e-44  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1785  hypothetical protein  33.9 
 
 
375 aa  179  7e-44  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.599753 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3616  hypothetical protein  33.43 
 
 
357 aa  169  7e-41  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0272546  normal 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5140  hypothetical protein  31.42 
 
 
360 aa  166  8e-40  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1008  hypothetical protein  32.43 
 
 
362 aa  154  2e-36  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_09028  conserved hypothetical protein  30.37 
 
 
376 aa  152  1e-35  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0869  hypothetical protein  29.16 
 
 
356 aa  145  2e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.452866  normal  0.48377 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3123  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.89 
 
 
373 aa  137  3.0000000000000003e-31  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3850  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.62 
 
 
373 aa  135  9.999999999999999e-31  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01302  conserved hypothetical protein  29.16 
 
 
432 aa  135  9.999999999999999e-31  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5534  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.55 
 
 
213 aa  130  5.0000000000000004e-29  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.397768 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_04177  NAD dependent epimerase/dehydratase family protein (AFU_orthologue; AFUA_8G00600)  27.86 
 
 
424 aa  127  2.0000000000000002e-28  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02921  conserved hypothetical protein  29.52 
 
 
437 aa  119  9.999999999999999e-26  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.569439 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05289  conserved hypothetical protein  26.07 
 
 
388 aa  60.5  0.00000005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  hitchhiker  0.00191099  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2789  NAD-dependent epimerase/dehydratase  36.94 
 
 
326 aa  54.3  0.000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0794985  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1215  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.08 
 
 
329 aa  49.7  0.00008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.190053  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1629  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.79 
 
 
304 aa  49.3  0.0001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.356198  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3021  NAD-dependent epimerase/dehydratase  36 
 
 
349 aa  48.9  0.0001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1700  NDP-hexose epimerase/oxydoreductase  31.78 
 
 
304 aa  49.3  0.0001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0751046  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1484  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.88 
 
 
330 aa  49.3  0.0001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1225  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.52 
 
 
304 aa  48.5  0.0002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0381  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  34.18 
 
 
281 aa  48.5  0.0002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.217368  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2220  Male sterility-like protein  44.07 
 
 
306 aa  47.8  0.0003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.589015  normal  0.345847 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00593  hypothetical protein  51.02 
 
 
53 aa  47.4  0.0004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2301  hypothetical protein  39.44 
 
 
78 aa  47.4  0.0004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.181563 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1227  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.96 
 
 
320 aa  46.6  0.0007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1329  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.96 
 
 
327 aa  45.8  0.001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1710  NAD-dependent epimerase/dehydratase  23.66 
 
 
326 aa  46.2  0.001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_5020  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.27 
 
 
213 aa  45.4  0.002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0420481  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3897  NmrA-like  36.21 
 
 
257 aa  44.3  0.003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1168  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.15 
 
 
320 aa  44.7  0.003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0380  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.59 
 
 
348 aa  44.7  0.003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0674993  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1490  NAD-dependent epimerase/dehydratase  23.3 
 
 
413 aa  43.5  0.005  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.245536  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3020  hypothetical protein  28 
 
 
289 aa  43.5  0.005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.375622  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4627  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.93 
 
 
325 aa  43.5  0.006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4540  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.93 
 
 
325 aa  43.5  0.006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.451447  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4923  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.93 
 
 
325 aa  43.5  0.006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3646  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.3 
 
 
284 aa  43.1  0.007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.701865  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2242  UDP-galactose 4-epimerase  26.85 
 
 
326 aa  43.1  0.008  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0491  NAD-dependent epimerase/dehydratase  23.3 
 
 
411 aa  43.1  0.008  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  hitchhiker  0.00000639635 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>