126 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_0209 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009664  Krad_0209  NAD-dependent epimerase/dehydratase  100 
 
 
307 aa  594  1e-169  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0178809  hitchhiker  0.0040496 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3985  NAD-dependent epimerase/dehydratase  40.52 
 
 
319 aa  239  4e-62  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.875328  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5717  NAD-dependent epimerase/dehydratase  41 
 
 
304 aa  216  4e-55  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0127633 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0312  NAD-dependent epimerase/dehydratase  37.37 
 
 
312 aa  176  4e-43  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.716604  normal  0.0199185 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1701  NAD-dependent epimerase/dehydratase  36.93 
 
 
307 aa  173  2.9999999999999996e-42  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.517647  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3104  NAD-dependent epimerase/dehydratase  36 
 
 
311 aa  169  6e-41  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0868  NAD-dependent epimerase/dehydratase  36 
 
 
311 aa  168  1e-40  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0837  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.89 
 
 
311 aa  167  1e-40  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001158  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.45 
 
 
314 aa  163  4.0000000000000004e-39  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4306  NAD-dependent epimerase/dehydratase  36.24 
 
 
308 aa  159  4e-38  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.244764  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3615  NAD-dependent epimerase/dehydratase  39.73 
 
 
315 aa  158  8e-38  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.036254  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1297  saccharopine dehydrogenase related protein  29.28 
 
 
305 aa  158  1e-37  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3981  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.55 
 
 
317 aa  154  2e-36  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0549387 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2329  NAD-dependent epimerase/dehydratase  39.52 
 
 
318 aa  153  2.9999999999999998e-36  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.51179  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2321  NAD-dependent epimerase/dehydratase  37.05 
 
 
312 aa  152  5e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3195  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.49 
 
 
311 aa  152  5e-36  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.67739  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1426  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.87 
 
 
316 aa  150  2e-35  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2822  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.83 
 
 
314 aa  150  4e-35  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2314  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.97 
 
 
307 aa  149  9e-35  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0046  NAD-dependent epimerase/dehydratase  42.72 
 
 
318 aa  146  4.0000000000000006e-34  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.582921 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4419  NAD-dependent epimerase/dehydratase  38.03 
 
 
321 aa  144  2e-33  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1542  NAD-dependent epimerase/dehydratase  40.2 
 
 
300 aa  144  2e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0027  NAD-dependent epimerase/dehydratase  40 
 
 
329 aa  140  1.9999999999999998e-32  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.535465  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0873  NAD-dependent epimerase/dehydratase  36.57 
 
 
316 aa  140  1.9999999999999998e-32  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.765071  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1559  NAD-dependent epimerase/dehydratase  37.37 
 
 
312 aa  140  3.9999999999999997e-32  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00329554  normal  0.0368212 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3201  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.35 
 
 
309 aa  137  2e-31  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0030  NAD-dependent epimerase/dehydratase  40.07 
 
 
329 aa  135  9e-31  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0042  NAD-dependent epimerase/dehydratase  39.74 
 
 
329 aa  135  9.999999999999999e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1987  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35 
 
 
328 aa  132  6e-30  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2007  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.88 
 
 
317 aa  131  2.0000000000000002e-29  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0894753  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1167  NAD-dependent epimerase/dehydratase  38.31 
 
 
309 aa  130  3e-29  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.184838  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2857  NAD-dependent epimerase/dehydratase  37.2 
 
 
304 aa  129  5.0000000000000004e-29  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3608  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.02 
 
 
306 aa  126  6e-28  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4635  NAD-dependent epimerase/dehydratase  42.11 
 
 
276 aa  122  5e-27  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0341156  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1740  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.48 
 
 
332 aa  121  9.999999999999999e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.377476  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1484  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.77 
 
 
319 aa  121  1.9999999999999998e-26  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.357446  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2497  putative sugar dehydratase/epimerase  33.45 
 
 
332 aa  120  3.9999999999999996e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.96633  normal  0.814546 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5665  NmrA-like protein/nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  31.96 
 
 
324 aa  115  6.9999999999999995e-25  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.783073 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2985  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.86 
 
 
324 aa  114  2.0000000000000002e-24  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.927449  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5393  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.6 
 
 
312 aa  113  4.0000000000000004e-24  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3811  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.69 
 
 
309 aa  111  1.0000000000000001e-23  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1143  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.98 
 
 
325 aa  109  5e-23  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.470047  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0353  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.2 
 
 
344 aa  108  1e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.860754 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3451  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.33 
 
 
313 aa  107  2e-22  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00141609  hitchhiker  0.00437395 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4354  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.87 
 
 
321 aa  102  7e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5344  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.52 
 
 
352 aa  102  7e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3627  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.96 
 
 
309 aa  98.6  1e-19  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1654  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.03 
 
 
326 aa  97.8  2e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.354617  normal  0.0815308 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4766  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.68 
 
 
308 aa  94.7  2e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.504553  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2286  NAD-dependent epimerase/dehydratase  22.4 
 
 
321 aa  89.4  6e-17  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1823  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.73 
 
 
301 aa  87  3e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2727  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.66 
 
 
340 aa  80.5  0.00000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.430894  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6997  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.86 
 
 
304 aa  77.4  0.0000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2988  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.11 
 
 
340 aa  76.3  0.0000000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.865432  normal  0.0888549 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3811  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.21 
 
 
336 aa  73.6  0.000000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.316364  hitchhiker  0.00353615 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11950  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  30.62 
 
 
322 aa  73.2  0.000000000006  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.274992  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3529  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.98 
 
 
318 aa  71.2  0.00000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.016337 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3203  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.3 
 
 
318 aa  70.1  0.00000000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_23000  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  29.71 
 
 
310 aa  68.6  0.0000000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.109037  normal  0.0324264 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0650  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.03 
 
 
337 aa  67  0.0000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.349018  normal  0.530155 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3335  hypothetical protein  29.47 
 
 
318 aa  67  0.0000000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0922  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.92 
 
 
327 aa  65.5  0.000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3578  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.3 
 
 
325 aa  64.3  0.000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4789  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.3 
 
 
325 aa  64.3  0.000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5493  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.3 
 
 
325 aa  64.3  0.000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.299821 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0998  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  28.67 
 
 
333 aa  62  0.00000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0510  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.77 
 
 
316 aa  62  0.00000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0189  hypothetical protein  28.09 
 
 
332 aa  61.2  0.00000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0302861  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1362  hypothetical protein  28.09 
 
 
345 aa  61.2  0.00000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.169729  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1558  hypothetical protein  28.09 
 
 
345 aa  61.2  0.00000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2723  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  28.09 
 
 
345 aa  61.2  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2579  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  28.09 
 
 
345 aa  61.2  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.62087  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0217  hypothetical protein  28.09 
 
 
345 aa  61.2  0.00000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.644245  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4696  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.8 
 
 
326 aa  61.2  0.00000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.990453 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3144  hypothetical protein  26.81 
 
 
370 aa  60.1  0.00000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.428885  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5995  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.34 
 
 
352 aa  59.3  0.00000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0746307  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4174  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.3 
 
 
326 aa  58.2  0.0000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.93932  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1458  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27 
 
 
326 aa  57.8  0.0000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.780601  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5771  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.93 
 
 
338 aa  56.2  0.0000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.783154  normal  0.678603 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0823  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.9 
 
 
340 aa  55.8  0.0000008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.895804 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1636  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.77 
 
 
324 aa  53.1  0.000005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0710053 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4434  NAD-dependent epimerase/dehydratase  40.79 
 
 
353 aa  52.8  0.000007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.324626 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3957  NAD-dependent epimerase/dehydratase  39.47 
 
 
353 aa  52.4  0.000009  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4325  NAD-dependent epimerase/dehydratase  39.47 
 
 
353 aa  52.4  0.00001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.488542 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4014  oxidoreductase domain protein  30.89 
 
 
680 aa  51.2  0.00002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.876961 
 
 
-
 
NC_004310  BR0715  epimerase/dehydratase family protein, putative  27.27 
 
 
289 aa  50.8  0.00003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.186861  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4713  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.79 
 
 
327 aa  50.8  0.00003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.809623 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4059  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.53 
 
 
316 aa  50.4  0.00004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.129791  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0368  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25 
 
 
347 aa  50.1  0.00005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0497868  normal  0.291666 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0126  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.21 
 
 
287 aa  49.7  0.00006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0507  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.49 
 
 
298 aa  49.3  0.00007  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.260305  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0130  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.17 
 
 
347 aa  48.9  0.0001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.116782  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3097  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.87 
 
 
322 aa  48.5  0.0002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.675955 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0369  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.25 
 
 
381 aa  48.1  0.0002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0842718  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33900  UDP-glucose 4-epimerase  28.77 
 
 
313 aa  47.4  0.0003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19950  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  44.44 
 
 
298 aa  47.4  0.0003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1883  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.89 
 
 
342 aa  47.8  0.0003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.832817 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0785  NAD-dependent epimerase/dehydratase  38.81 
 
 
282 aa  47.4  0.0003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.858296  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1848  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.51 
 
 
305 aa  47.4  0.0004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1547  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.57 
 
 
312 aa  46.6  0.0005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.121163  normal  0.417102 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>