36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene YpsIP31758_0685 on replicon NC_009708
Organism: Yersinia pseudotuberculosis IP 31758



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010465  YPK_0753  saccharopine dehydrogenase  99.44 
 
 		 356 aa  725    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0685  saccharopine dehydrogenase  100 
 
 		 356 aa  728    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2081  saccharopine dehydrogenase  27.04 
 
 		 371 aa  90.5  4e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.484567  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1031  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.27 
 
 		 377 aa  89.7  6e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  hitchhiker  0.00494367  normal  0.0229045 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2645  saccharopine dehydrogenase  30.1 
 
 		 368 aa  87.8  2e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  hitchhiker  0.00207911  normal  0.116194 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1760  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.39 
 
 		 366 aa  87  4e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.122533  hitchhiker  0.00990126 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2819  saccharopine dehydrogenase  29.75 
 
 		 358 aa  83.6  0.000000000000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2673  Saccharopine dehydrogenase  26.14 
 
 		 377 aa  70.5  0.00000000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0130608  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54900  hypothetical protein  25.21 
 
 		 384 aa  70.1  0.00000000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  unclonable  0.0000000000000637066  unclonable  7.39539e-22 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3768  hypothetical protein  29.32 
 
 		 480 aa  60.8  0.00000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1148  saccharopine dehydrogenase  38.41 
 
 		 325 aa  53.9  0.000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14900  saccharopine dehydrogenase-like oxidoreductase  44.12 
 
 		 313 aa  49.7  0.00009  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  decreased coverage  0.00802223  normal  0.0704992 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3651  Saccharopine dehydrogenase  23.29 
 
 		 367 aa  49.3  0.00009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3964  Saccharopine dehydrogenase  23.6 
 
 		 360 aa  48.9  0.0001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3474  saccharopine dehydrogenase  27.45 
 
 		 351 aa  47.4  0.0004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.103531  normal  1 
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_36377  predicted protein  25.17 
 
 		 413 aa  47.4  0.0004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2007  NAD-dependent epimerase/dehydratase  36.84 
 
 		 250 aa  47  0.0005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.702052 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3635  Saccharopine dehydrogenase  32.62 
 
 		 363 aa  47  0.0005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_34724  predicted protein  23.98 
 
 		 454 aa  46.2  0.0009  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0227294  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1038  saccharopine dehydrogenase  35 
 
 		 325 aa  45.8  0.001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.264702 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5664  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.37 
 
 		 230 aa  45.4  0.001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6607  saccharopine dehydrogenase  30.1 
 
 		 340 aa  45.4  0.002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3058  NAD-dependent epimerase/dehydratase  36 
 
 		 350 aa  44.7  0.003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1406  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  30.77 
 
 		 248 aa  44.7  0.003  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  decreased coverage  0.000194485  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5296  saccharopine dehydrogenase  26.79 
 
 		 351 aa  43.9  0.004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.813788  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0060  hypothetical protein  36.14 
 
 		 294 aa  43.9  0.004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0122  oxidoreductase  32.14 
 
 		 253 aa  43.9  0.005  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.49595  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0107  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.14 
 
 		 271 aa  43.5  0.005  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5762  Saccharopine dehydrogenase  30.77 
 
 		 355 aa  43.9  0.005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.353531 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0147  saccharopine dehydrogenase  28.81 
 
 		 390 aa  43.5  0.005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0036  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  31.07 
 
 		 316 aa  43.5  0.006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0174817 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0788  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.33 
 
 		 221 aa  43.1  0.007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1790  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  24.5 
 
 		 255 aa  43.1  0.008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0755029  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1122  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  31.07 
 
 		 319 aa  43.1  0.008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5374  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.57 
 
 		 230 aa  42.7  0.009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5285  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.57 
 
 		 230 aa  42.7  0.009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>