109 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BamMC406_3474 on replicon NC_010552
Organism: Burkholderia ambifaria MC40-6



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008391  Bamb_5296  saccharopine dehydrogenase  95.44 
 
 		 351 aa  670    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.813788  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3474  saccharopine dehydrogenase  100 
 
 		 351 aa  692    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.103531  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1404  saccharopine dehydrogenase  46.69 
 
 		 344 aa  254  2.0000000000000002e-66  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.581965 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4494  saccharopine dehydrogenase  46.82 
 
 		 343 aa  235  9e-61  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.802239  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3635  Saccharopine dehydrogenase  33.33 
 
 		 363 aa  102  8e-21  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6607  saccharopine dehydrogenase  30.33 
 
 		 340 aa  96.7  5e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1135  Saccharopine dehydrogenase  32.09 
 
 		 368 aa  90.5  4e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3084  Saccharopine dehydrogenase  32.81 
 
 		 352 aa  89  1e-16  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.413976  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2986  saccharopine dehydrogenase  43.31 
 
 		 365 aa  87.8  3e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0188424  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3185  Saccharopine dehydrogenase  41.73 
 
 		 352 aa  85.9  0.000000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.418477  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2359  Saccharopine dehydrogenase  32.91 
 
 		 345 aa  84.3  0.000000000000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0263338  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1054  hypothetical protein  29.41 
 
 		 351 aa  82.4  0.00000000000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.380877  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1149  hypothetical protein  29.54 
 
 		 351 aa  81.3  0.00000000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3672  saccharopine dehydrogenase  30.99 
 
 		 353 aa  81.3  0.00000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.420648 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2027  saccharopine dehydrogenase  32.97 
 
 		 351 aa  79.3  0.00000000000009  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0488088  normal  0.664425 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56730  hypothetical protein  30.74 
 
 		 352 aa  77.4  0.0000000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4206  saccharopine dehydrogenase  34.31 
 
 		 371 aa  76.3  0.0000000000008  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3399  Saccharopine dehydrogenase  27.97 
 
 		 350 aa  75.5  0.000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00148167  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4933  hypothetical protein  30.3 
 
 		 352 aa  74.3  0.000000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.76632  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0176  hypothetical protein  32.91 
 
 		 376 aa  73.9  0.000000000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.668245 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1361  Saccharopine dehydrogenase  30.08 
 
 		 376 aa  72  0.00000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1339  Saccharopine dehydrogenase  32.03 
 
 		 343 aa  71.2  0.00000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.072139  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2976  saccharopine dehydrogenase  26.53 
 
 		 415 aa  69.7  0.00000000007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.809568  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001157  putative integral membrane protein  28.45 
 
 		 360 aa  69.7  0.00000000007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2746  saccharopine dehydrogenase  32.39 
 
 		 377 aa  69.7  0.00000000008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000611807  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3544  putative integral membrane protein  37.4 
 
 		 324 aa  68.6  0.0000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0710897 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5762  Saccharopine dehydrogenase  25.21 
 
 		 355 aa  67.8  0.0000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.353531 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3058  saccharopine dehydrogenase  39.53 
 
 		 348 aa  66.2  0.0000000008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2316  Saccharopine dehydrogenase  25.49 
 
 		 413 aa  65.9  0.0000000009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.385349  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6392  saccharopine dehydrogenase:NmrA-like  30.22 
 
 		 377 aa  65.1  0.000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.370059  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4354  saccharopine dehydrogenase  32.37 
 
 		 376 aa  64.3  0.000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2140  saccharopine dehydrogenase  33.33 
 
 		 389 aa  63.2  0.000000006  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.307672 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5035  saccharopine dehydrogenase  31.65 
 
 		 376 aa  62.4  0.00000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5825  saccharopine dehydrogenase  31.65 
 
 		 376 aa  62.4  0.00000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.382888  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0020  Saccharopine dehydrogenase (NAD(+), L-glutamate- forming)  26.53 
 
 		 390 aa  60.5  0.00000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.947878 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0138  saccharopine dehydrogenase  28.26 
 
 		 432 aa  60.5  0.00000005  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1643  saccharopine dehydrogenase  30.83 
 
 		 382 aa  60.5  0.00000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0538  saccharopine dehydrogenase  34.81 
 
 		 394 aa  60.1  0.00000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.028356 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2300  Saccharopine dehydrogenase  35.66 
 
 		 408 aa  60.1  0.00000006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0134168  hitchhiker  0.00267876 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0147  saccharopine dehydrogenase  34.33 
 
 		 390 aa  58.2  0.0000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4124  Saccharopine dehydrogenase  29.75 
 
 		 361 aa  58.5  0.0000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2182  NmrA family protein  41.18 
 
 		 213 aa  57.8  0.0000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2873  saccharopine dehydrogenase  34.59 
 
 		 404 aa  57.8  0.0000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.183761 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2098  Saccharopine dehydrogenase  34.27 
 
 		 406 aa  57  0.0000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.176484  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2123  saccharopine dehydrogenase (NAD(+), L-glutamate-forming)  27.34 
 
 		 419 aa  55.5  0.000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0383643 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0514  saccharopine dehydrogenase  33.57 
 
 		 377 aa  55.5  0.000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.895808  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3559  saccharopine dehydrogenase  31.03 
 
 		 419 aa  55.1  0.000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.924034  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3632  saccharopine dehydrogenase  31.03 
 
 		 419 aa  55.1  0.000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.288883 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3564  saccharopine dehydrogenase  31.03 
 
 		 419 aa  55.1  0.000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.389675  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1105  Saccharopine dehydrogenase  34.27 
 
 		 422 aa  55.5  0.000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4278  saccharopine dehydrogenase  31.82 
 
 		 388 aa  54.3  0.000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.961267 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1088  Saccharopine dehydrogenase (NAD(+), L-glutamate- forming)  32.88 
 
 		 430 aa  54.3  0.000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.147664  n/a   
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_34724  predicted protein  29.8 
 
 		 454 aa  53.9  0.000004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0227294  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0494  saccharopine dehydrogenase  32.05 
 
 		 371 aa  53.9  0.000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.961307  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0966  saccharopine dehydrogenase  27.41 
 
 		 394 aa  53.5  0.000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.287353  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15850  UbiD family decarboxylase  33.85 
 
 		 376 aa  53.1  0.000007  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.647693  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0129  hypothetical protein  26.81 
 
 		 432 aa  52.4  0.00001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.150233  normal  1 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07293  conserved hypothetical protein  30.23 
 
 		 430 aa  51.6  0.00002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.087222 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1002  NAD-dependent epimerase/dehydratase  43.16 
 
 		 200 aa  51.6  0.00002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0517555 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3651  Saccharopine dehydrogenase  22.83 
 
 		 367 aa  52  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2039  Saccharopine dehydrogenase  34.97 
 
 		 409 aa  51.6  0.00002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.823725  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1679  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  35.37 
 
 		 294 aa  51.2  0.00003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.165214  n/a   
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_16272  predicted protein  28.48 
 
 		 498 aa  50.8  0.00003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01040  Saccharopine dehydrogenase  27.41 
 
 		 391 aa  50.8  0.00003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3455  saccharopine dehydrogenase  31.25 
 
 		 378 aa  50.8  0.00003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.750747  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2237  NmrA family protein  34.12 
 
 		 305 aa  50.4  0.00004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3626  saccharopine dehydrogenase  31.21 
 
 		 410 aa  50.4  0.00005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2628  saccharopine dehydrogenase  29.66 
 
 		 420 aa  50.1  0.00005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12967  hypothetical protein  30.6 
 
 		 418 aa  50.1  0.00006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4764  Saccharopine dehydrogenase (NAD(+), L-glutamate- forming)  32.12 
 
 		 410 aa  50.1  0.00006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12475  hypothetical protein  31.13 
 
 		 419 aa  50.1  0.00007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.487465 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3229  Saccharopine dehydrogenase  30.41 
 
 		 405 aa  49.7  0.00007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.0356215 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0761  saccharopine dehydrogenase  30.43 
 
 		 390 aa  48.9  0.0001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.092015  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1038  saccharopine dehydrogenase  32.79 
 
 		 325 aa  48.9  0.0001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.264702 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1410  saccharopine dehydrogenase  30.6 
 
 		 393 aa  48.5  0.0002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2468  saccharopine dehydrogenase  31.34 
 
 		 392 aa  48.1  0.0002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54900  hypothetical protein  24.14 
 
 		 384 aa  48.1  0.0002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  unclonable  0.0000000000000637066  unclonable  7.39539e-22 
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4088  Saccharopine dehydrogenase (NAD(+), L-glutamate-forming)  28.28 
 
 		 422 aa  48.1  0.0002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2786  NAD-dependent epimerase/dehydratase  40.24 
 
 		 424 aa  48.5  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0560564  normal  0.509097 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0685  saccharopine dehydrogenase  27.45 
 
 		 356 aa  47.8  0.0003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1653  Saccharopine dehydrogenase (NAD(+), L-glutamate- forming)  30.66 
 
 		 398 aa  47.8  0.0003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0173557  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5529  saccharopine dehydrogenase (NAD(+), L-glutamate-forming)  29.93 
 
 		 413 aa  47.4  0.0004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.317622 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0612  Saccharopine dehydrogenase (NAD(+), L-glutamate- forming)  29.66 
 
 		 404 aa  47.4  0.0004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4609  hypothetical protein  28.99 
 
 		 392 aa  46.2  0.0008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.856643  normal  0.0914614 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0227  NmrA family protein  35.45 
 
 		 232 aa  46.2  0.0008  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2414  NmrA family protein  42.5 
 
 		 285 aa  45.4  0.001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0724287 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3953  saccharopine dehydrogenase  30.14 
 
 		 421 aa  45.8  0.001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0682928  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3396  saccharopine dehydrogenase (NAD(+), L-glutamate-forming)  29.93 
 
 		 389 aa  45.8  0.001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.705544  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0753  saccharopine dehydrogenase  26.96 
 
 		 356 aa  45.8  0.001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1482  hypothetical protein  24.44 
 
 		 394 aa  45.8  0.001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3008  Saccharopine dehydrogenase (NAD(+), L-glutamate-forming)  30.43 
 
 		 402 aa  45.4  0.001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.762164  normal  0.0490762 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4315  saccharopine dehydrogenase  22.09 
 
 		 378 aa  44.7  0.002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.224112  normal  0.228939 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0783  saccharopine dehydrogenase  30.66 
 
 		 388 aa  44.7  0.002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3887  Saccharopine dehydrogenase (NAD(+), L-glutamate- forming)  30.3 
 
 		 386 aa  45.1  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.011216  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2094  NAD-dependent epimerase/dehydratase  39.36 
 
 		 203 aa  44.3  0.003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0891152  normal  0.33329 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2191  NmrA family protein  35.43 
 
 		 210 aa  44.3  0.003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3639  saccharopine dehydrogenase (NAD(+), L-glutamate-forming)  28.77 
 
 		 389 aa  44.3  0.003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000739402 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0061  saccharopine dehydrogenase  23.24 
 
 		 403 aa  43.9  0.004  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3156  NAD dependent epimerase/dehydratase family protein  37.5 
 
 		 304 aa  43.9  0.004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12850  hypothetical protein  34.62 
 
 		 391 aa  43.9  0.004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.971112  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>