73 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_1404 on replicon NC_007948
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007948  Bpro_1404  saccharopine dehydrogenase  100 
 
 		 344 aa  694    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.581965 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4494  saccharopine dehydrogenase  66.08 
 
 		 343 aa  419  1e-116  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.802239  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5296  saccharopine dehydrogenase  45.81 
 
 		 351 aa  256  4e-67  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.813788  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3474  saccharopine dehydrogenase  46.69 
 
 		 351 aa  254  2.0000000000000002e-66  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.103531  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2027  saccharopine dehydrogenase  32.52 
 
 		 351 aa  95.9  1e-18  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0488088  normal  0.664425 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1135  Saccharopine dehydrogenase  30.49 
 
 		 368 aa  94.4  2e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1054  hypothetical protein  35.14 
 
 		 351 aa  93.2  6e-18  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.380877  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1149  hypothetical protein  35.14 
 
 		 351 aa  92.8  7e-18  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3058  saccharopine dehydrogenase  38.38 
 
 		 348 aa  89  1e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4933  hypothetical protein  42.4 
 
 		 352 aa  87.8  3e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.76632  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56730  hypothetical protein  40.8 
 
 		 352 aa  87.4  4e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001157  putative integral membrane protein  33.33 
 
 		 360 aa  86.7  6e-16  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6607  saccharopine dehydrogenase  30.95 
 
 		 340 aa  86.7  6e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3635  Saccharopine dehydrogenase  35.36 
 
 		 363 aa  85.1  0.000000000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1339  Saccharopine dehydrogenase  37.95 
 
 		 343 aa  79  0.0000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.072139  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3672  saccharopine dehydrogenase  34.94 
 
 		 353 aa  76.6  0.0000000000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.420648 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1361  Saccharopine dehydrogenase  36.54 
 
 		 376 aa  75.5  0.000000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2986  saccharopine dehydrogenase  34.56 
 
 		 365 aa  73.2  0.000000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0188424  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2316  Saccharopine dehydrogenase  28.17 
 
 		 413 aa  72.4  0.00000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.385349  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3084  Saccharopine dehydrogenase  35.38 
 
 		 352 aa  70.5  0.00000000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.413976  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3185  Saccharopine dehydrogenase  35.38 
 
 		 352 aa  70.5  0.00000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.418477  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2359  Saccharopine dehydrogenase  28.46 
 
 		 345 aa  70.1  0.00000000005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0263338  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2976  saccharopine dehydrogenase  26 
 
 		 415 aa  68.6  0.0000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.809568  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1643  saccharopine dehydrogenase  32.31 
 
 		 382 aa  68.6  0.0000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0176  hypothetical protein  32 
 
 		 376 aa  67.4  0.0000000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.668245 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3399  Saccharopine dehydrogenase  31.2 
 
 		 350 aa  66.6  0.0000000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00148167  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5762  Saccharopine dehydrogenase  25.76 
 
 		 355 aa  65.9  0.000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.353531 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4206  saccharopine dehydrogenase  25.33 
 
 		 371 aa  62.4  0.00000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4124  Saccharopine dehydrogenase  24.93 
 
 		 361 aa  60.8  0.00000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3544  putative integral membrane protein  33.66 
 
 		 324 aa  58.5  0.0000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0710897 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2873  saccharopine dehydrogenase  33.94 
 
 		 404 aa  57  0.0000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.183761 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15850  UbiD family decarboxylase  30.71 
 
 		 376 aa  55.8  0.000001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.647693  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3887  Saccharopine dehydrogenase (NAD(+), L-glutamate- forming)  28.81 
 
 		 386 aa  54.3  0.000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.011216  normal  1 
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_34724  predicted protein  31.47 
 
 		 454 aa  53.5  0.000005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0227294  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0514  saccharopine dehydrogenase  29.81 
 
 		 377 aa  53.1  0.000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.895808  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3626  saccharopine dehydrogenase  27.86 
 
 		 410 aa  52  0.00001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4088  Saccharopine dehydrogenase (NAD(+), L-glutamate-forming)  28.47 
 
 		 422 aa  50.1  0.00006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1495  Saccharopine dehydrogenase  26.61 
 
 		 376 aa  49.3  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.0000691069  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0138  saccharopine dehydrogenase  24.82 
 
 		 432 aa  48.5  0.0002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6392  saccharopine dehydrogenase:NmrA-like  29.8 
 
 		 377 aa  47.4  0.0003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.370059  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2237  NmrA family protein  30.23 
 
 		 305 aa  47.4  0.0003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5825  saccharopine dehydrogenase  28.19 
 
 		 376 aa  47.8  0.0003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.382888  normal  1 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07293  conserved hypothetical protein  22.67 
 
 		 430 aa  47.8  0.0003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.087222 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5035  saccharopine dehydrogenase  28.19 
 
 		 376 aa  47.8  0.0003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3559  saccharopine dehydrogenase  27.82 
 
 		 419 aa  47.8  0.0003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.924034  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3632  saccharopine dehydrogenase  27.82 
 
 		 419 aa  47.8  0.0003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.288883 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3564  saccharopine dehydrogenase  27.82 
 
 		 419 aa  47.4  0.0003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.389675  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1002  NAD-dependent epimerase/dehydratase  40.21 
 
 		 200 aa  47  0.0004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0517555 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1972  NmrA family protein  32.71 
 
 		 295 aa  47  0.0005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0147  saccharopine dehydrogenase  30.6 
 
 		 390 aa  46.2  0.0007  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2575  NmrA family protein  38.16 
 
 		 295 aa  46.2  0.0007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2746  saccharopine dehydrogenase  28.19 
 
 		 377 aa  45.4  0.001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000611807  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4354  saccharopine dehydrogenase  27.52 
 
 		 376 aa  46.2  0.001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4278  saccharopine dehydrogenase  29.1 
 
 		 388 aa  44.7  0.002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.961267 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2182  NmrA family protein  36.05 
 
 		 213 aa  45.1  0.002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3651  Saccharopine dehydrogenase  20.51 
 
 		 367 aa  45.1  0.002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4764  Saccharopine dehydrogenase (NAD(+), L-glutamate- forming)  33.81 
 
 		 410 aa  44.3  0.003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3455  saccharopine dehydrogenase  32.04 
 
 		 378 aa  44.3  0.003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.750747  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12967  hypothetical protein  24.81 
 
 		 418 aa  44.3  0.003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1105  Saccharopine dehydrogenase  26.62 
 
 		 422 aa  44.7  0.003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0612  Saccharopine dehydrogenase (NAD(+), L-glutamate- forming)  26.95 
 
 		 404 aa  43.5  0.005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_16272  predicted protein  26.8 
 
 		 498 aa  43.9  0.005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4315  saccharopine dehydrogenase  21.25 
 
 		 378 aa  43.5  0.005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.224112  normal  0.228939 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1232  NmrA family protein  29.94 
 
 		 297 aa  43.9  0.005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00000395859  normal  0.0148086 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2414  NAD-dependent epimerase/dehydratase  46.15 
 
 		 223 aa  43.5  0.005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.596261  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0726  Saccharopine dehydrogenase  24.63 
 
 		 421 aa  43.1  0.006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.945634  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1679  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  27.91 
 
 		 294 aa  43.1  0.006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.165214  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1309  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.33 
 
 		 293 aa  43.5  0.006  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0538  saccharopine dehydrogenase  30.77 
 
 		 394 aa  43.1  0.006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.028356 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12475  hypothetical protein  25.9 
 
 		 419 aa  43.1  0.008  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.487465 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5058  saccharopine dehydrogenase  22.08 
 
 		 369 aa  42.7  0.009  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1653  Saccharopine dehydrogenase (NAD(+), L-glutamate- forming)  29.5 
 
 		 398 aa  42.7  0.01  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0173557  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0152  NADH dehydrogenase (ubiquinone)  33.72 
 
 		 335 aa  42.4  0.01  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.274944 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>