99 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Saro_0147 on replicon NC_007794
Organism: Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007794  Saro_0147  saccharopine dehydrogenase  100 
 
 
390 aa  790    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0761  saccharopine dehydrogenase  66.75 
 
 
390 aa  489  1e-137  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.092015  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0538  saccharopine dehydrogenase  60.82 
 
 
394 aa  469  1.0000000000000001e-131  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.028356 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2140  saccharopine dehydrogenase  60.51 
 
 
389 aa  461  1e-129  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.307672 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4609  hypothetical protein  60.47 
 
 
392 aa  451  1e-125  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.856643  normal  0.0914614 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0966  saccharopine dehydrogenase  56.88 
 
 
394 aa  446  1.0000000000000001e-124  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.287353  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4278  saccharopine dehydrogenase  60.42 
 
 
388 aa  444  1e-123  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.961267 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1410  saccharopine dehydrogenase  56.89 
 
 
393 aa  432  1e-120  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2468  saccharopine dehydrogenase  57.14 
 
 
392 aa  424  1e-117  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01040  Saccharopine dehydrogenase  54.01 
 
 
391 aa  416  9.999999999999999e-116  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1467  saccharopine dehydrogenase  42.86 
 
 
413 aa  317  3e-85  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.071229  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0129  hypothetical protein  40.69 
 
 
432 aa  310  2e-83  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.150233  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5529  saccharopine dehydrogenase (NAD(+), L-glutamate-forming)  43.95 
 
 
413 aa  309  5.9999999999999995e-83  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.317622 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0138  saccharopine dehydrogenase  39.81 
 
 
432 aa  307  3e-82  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6045  saccharopine dehydrogenase  43.14 
 
 
416 aa  306  5.0000000000000004e-82  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.233405 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5681  saccharopine dehydrogenase  43.14 
 
 
416 aa  306  5.0000000000000004e-82  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6531  saccharopine dehydrogenase (NAD(+), L-glutamate-forming)  43.28 
 
 
416 aa  304  2.0000000000000002e-81  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.429838  normal  0.0830191 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0528  Saccharopine dehydrogenase (NAD(+), L-glutamate-forming)  43.35 
 
 
414 aa  304  2.0000000000000002e-81  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7476  putative saccharopine dehydrogenase  42.79 
 
 
414 aa  303  3.0000000000000004e-81  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2123  saccharopine dehydrogenase (NAD(+), L-glutamate-forming)  40.29 
 
 
419 aa  300  2e-80  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.0383643 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0541  Saccharopine dehydrogenase (NAD(+), L-glutamate-forming)  43.1 
 
 
414 aa  300  2e-80  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5854  saccharopine dehydrogenase (NAD(+), L-glutamate-forming)  41.65 
 
 
419 aa  291  1e-77  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1758  Saccharopine dehydrogenase (NAD(+), L-glutamate-forming)  42.14 
 
 
407 aa  286  2.9999999999999996e-76  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.819467 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6092  saccharopine dehydrogenase  40.92 
 
 
419 aa  283  4.0000000000000003e-75  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.207649  normal 
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4088  Saccharopine dehydrogenase (NAD(+), L-glutamate-forming)  37.44 
 
 
422 aa  255  7e-67  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1105  Saccharopine dehydrogenase  39.41 
 
 
422 aa  242  1e-62  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3564  saccharopine dehydrogenase  41.38 
 
 
419 aa  233  3e-60  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.389675  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3559  saccharopine dehydrogenase  41.13 
 
 
419 aa  231  2e-59  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.924034  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3632  saccharopine dehydrogenase  41.13 
 
 
419 aa  231  2e-59  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.288883 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0612  Saccharopine dehydrogenase (NAD(+), L-glutamate- forming)  39.21 
 
 
404 aa  229  5e-59  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12475  hypothetical protein  39.07 
 
 
419 aa  228  2e-58  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.487465 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3626  saccharopine dehydrogenase  38.21 
 
 
410 aa  221  1.9999999999999999e-56  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3953  saccharopine dehydrogenase  39.66 
 
 
421 aa  220  3e-56  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0682928  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2300  Saccharopine dehydrogenase  38.38 
 
 
408 aa  216  5.9999999999999996e-55  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0134168  hitchhiker  0.00267876 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2628  saccharopine dehydrogenase  37.68 
 
 
420 aa  216  7e-55  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1088  Saccharopine dehydrogenase (NAD(+), L-glutamate- forming)  38.46 
 
 
430 aa  208  1e-52  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.147664  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2039  Saccharopine dehydrogenase  38.67 
 
 
409 aa  204  2e-51  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.823725  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0726  Saccharopine dehydrogenase  36.32 
 
 
421 aa  202  6e-51  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.945634  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3229  Saccharopine dehydrogenase  33 
 
 
405 aa  197  2.0000000000000003e-49  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.0356215 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2098  Saccharopine dehydrogenase  36.96 
 
 
406 aa  196  4.0000000000000005e-49  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.176484  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12967  hypothetical protein  37.25 
 
 
418 aa  196  4.0000000000000005e-49  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0020  Saccharopine dehydrogenase (NAD(+), L-glutamate- forming)  37.91 
 
 
390 aa  194  2e-48  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.947878 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3887  Saccharopine dehydrogenase (NAD(+), L-glutamate- forming)  38.75 
 
 
386 aa  192  7e-48  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.011216  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4764  Saccharopine dehydrogenase (NAD(+), L-glutamate- forming)  38.93 
 
 
410 aa  188  2e-46  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3396  saccharopine dehydrogenase (NAD(+), L-glutamate-forming)  38.4 
 
 
389 aa  186  4e-46  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.705544  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2873  saccharopine dehydrogenase  35.4 
 
 
404 aa  184  2.0000000000000003e-45  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.183761 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_32292  predicted protein  35.01 
 
 
502 aa  183  4.0000000000000006e-45  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0355171  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1653  Saccharopine dehydrogenase (NAD(+), L-glutamate- forming)  36.89 
 
 
398 aa  181  1e-44  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0173557  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3639  saccharopine dehydrogenase (NAD(+), L-glutamate-forming)  37.72 
 
 
389 aa  178  1e-43  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000739402 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0783  saccharopine dehydrogenase  36.05 
 
 
388 aa  173  3.9999999999999995e-42  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12850  hypothetical protein  36.59 
 
 
391 aa  167  2.9999999999999998e-40  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.971112  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0514  saccharopine dehydrogenase  30.59 
 
 
377 aa  156  7e-37  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.895808  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3008  Saccharopine dehydrogenase (NAD(+), L-glutamate-forming)  36.79 
 
 
402 aa  151  2e-35  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.762164  normal  0.0490762 
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_89710  predicted protein  33.49 
 
 
436 aa  137  3.0000000000000003e-31  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.332936 
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_16272  predicted protein  28.22 
 
 
498 aa  128  2.0000000000000002e-28  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006692  CNG03750  conserved hypothetical protein  28.27 
 
 
427 aa  125  2e-27  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07293  conserved hypothetical protein  29.57 
 
 
430 aa  111  2.0000000000000002e-23  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.087222 
 
 
-
 
NC_011698  PHATRDRAFT_41409  predicted protein  27.66 
 
 
1506 aa  111  2.0000000000000002e-23  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.974379  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3455  saccharopine dehydrogenase  40.58 
 
 
378 aa  96.7  7e-19  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.750747  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1643  saccharopine dehydrogenase  34.39 
 
 
382 aa  89.4  1e-16  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0176  hypothetical protein  37.5 
 
 
376 aa  75.9  0.000000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.668245 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56730  hypothetical protein  37.75 
 
 
352 aa  75.1  0.000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4206  saccharopine dehydrogenase  38.02 
 
 
371 aa  74.7  0.000000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15850  UbiD family decarboxylase  34.06 
 
 
376 aa  73.2  0.000000000007  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.647693  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5762  Saccharopine dehydrogenase  30.2 
 
 
355 aa  70.1  0.00000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.353531 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4124  Saccharopine dehydrogenase  35.81 
 
 
361 aa  70.1  0.00000000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1135  Saccharopine dehydrogenase  34.75 
 
 
368 aa  69.7  0.00000000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3399  Saccharopine dehydrogenase  29.02 
 
 
350 aa  69.3  0.0000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00148167  normal 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6392  saccharopine dehydrogenase:NmrA-like  28.48 
 
 
377 aa  68.2  0.0000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.370059  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4933  hypothetical protein  35.1 
 
 
352 aa  67.4  0.0000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.76632  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001157  putative integral membrane protein  29.68 
 
 
360 aa  66.6  0.0000000007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5825  saccharopine dehydrogenase  32.35 
 
 
376 aa  65.1  0.000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.382888  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5035  saccharopine dehydrogenase  32.35 
 
 
376 aa  65.1  0.000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4354  saccharopine dehydrogenase  32.35 
 
 
376 aa  64.7  0.000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2027  saccharopine dehydrogenase  24.61 
 
 
351 aa  62  0.00000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0488088  normal  0.664425 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3544  putative integral membrane protein  31.43 
 
 
324 aa  61.6  0.00000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.0710897 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2746  saccharopine dehydrogenase  33.33 
 
 
377 aa  62  0.00000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000611807  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2986  saccharopine dehydrogenase  34.51 
 
 
365 aa  60.5  0.00000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0188424  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0316  saccharopine dehydrogenase  34.23 
 
 
395 aa  59.7  0.00000008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.424303  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3185  Saccharopine dehydrogenase  33.8 
 
 
352 aa  59.3  0.0000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.418477  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3084  Saccharopine dehydrogenase  33.8 
 
 
352 aa  59.3  0.0000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.413976  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2359  Saccharopine dehydrogenase  33.15 
 
 
345 aa  58.5  0.0000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0263338  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3474  saccharopine dehydrogenase  34.33 
 
 
351 aa  58.2  0.0000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.103531  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3635  Saccharopine dehydrogenase  28.37 
 
 
363 aa  57  0.0000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5296  saccharopine dehydrogenase  33.58 
 
 
351 aa  54.7  0.000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.813788  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3058  saccharopine dehydrogenase  30.71 
 
 
348 aa  53.5  0.000007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1339  Saccharopine dehydrogenase  31.08 
 
 
343 aa  53.1  0.000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.072139  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1149  hypothetical protein  25.17 
 
 
351 aa  52.4  0.00001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1361  Saccharopine dehydrogenase  33.02 
 
 
376 aa  52.4  0.00001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1054  hypothetical protein  25.17 
 
 
351 aa  52.4  0.00001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.380877  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3672  saccharopine dehydrogenase  32.14 
 
 
353 aa  52.4  0.00001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.420648 
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_34724  predicted protein  32.38 
 
 
454 aa  47.4  0.0004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0227294  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1404  saccharopine dehydrogenase  30.6 
 
 
344 aa  46.2  0.0009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.581965 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2316  Saccharopine dehydrogenase  26.04 
 
 
413 aa  45.1  0.002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.385349  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0753  saccharopine dehydrogenase  29.66 
 
 
356 aa  45.1  0.002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4494  saccharopine dehydrogenase  28.36 
 
 
343 aa  44.7  0.003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.802239  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6607  saccharopine dehydrogenase  30.97 
 
 
340 aa  44.3  0.003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0981  saccharopine dehydrogenase  30.77 
 
 
398 aa  43.5  0.006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0620633  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0685  saccharopine dehydrogenase  28.81 
 
 
356 aa  43.1  0.008  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>