97 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_3396 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009380  Strop_3396  saccharopine dehydrogenase (NAD(+), L-glutamate-forming)  100 
 
 		 389 aa  769    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.705544  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3639  saccharopine dehydrogenase (NAD(+), L-glutamate-forming)  88.4 
 
 		 389 aa  689    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000739402 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3887  Saccharopine dehydrogenase (NAD(+), L-glutamate- forming)  64.19 
 
 		 386 aa  478  1e-134  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.011216  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1653  Saccharopine dehydrogenase (NAD(+), L-glutamate- forming)  63.04 
 
 		 398 aa  462  1e-129  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0173557  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0783  saccharopine dehydrogenase  62.34 
 
 		 388 aa  452  1.0000000000000001e-126  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12850  hypothetical protein  62.18 
 
 		 391 aa  439  9.999999999999999e-123  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.971112  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4764  Saccharopine dehydrogenase (NAD(+), L-glutamate- forming)  59.22 
 
 		 410 aa  439  9.999999999999999e-123  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3008  Saccharopine dehydrogenase (NAD(+), L-glutamate-forming)  58.15 
 
 		 402 aa  422  1e-117  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.762164  normal  0.0490762 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0020  Saccharopine dehydrogenase (NAD(+), L-glutamate- forming)  48.34 
 
 		 390 aa  349  4e-95  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.947878 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2123  saccharopine dehydrogenase (NAD(+), L-glutamate-forming)  41.77 
 
 		 419 aa  256  5e-67  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0383643 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1088  Saccharopine dehydrogenase (NAD(+), L-glutamate- forming)  41.77 
 
 		 430 aa  247  3e-64  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.147664  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0138  saccharopine dehydrogenase  35.48 
 
 		 432 aa  235  1.0000000000000001e-60  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0129  hypothetical protein  35.48 
 
 		 432 aa  231  1e-59  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.150233  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1467  saccharopine dehydrogenase  38.41 
 
 		 413 aa  226  7e-58  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.071229  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2300  Saccharopine dehydrogenase  43.31 
 
 		 408 aa  224  3e-57  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0134168  hitchhiker  0.00267876 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2039  Saccharopine dehydrogenase  43.28 
 
 		 409 aa  221  9.999999999999999e-57  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.823725  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2140  saccharopine dehydrogenase  39.4 
 
 		 389 aa  218  2e-55  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.307672 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4609  hypothetical protein  38.13 
 
 		 392 aa  217  2.9999999999999998e-55  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.856643  normal  0.0914614 
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4088  Saccharopine dehydrogenase (NAD(+), L-glutamate-forming)  38.2 
 
 		 422 aa  215  9.999999999999999e-55  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4278  saccharopine dehydrogenase  40.2 
 
 		 388 aa  214  1.9999999999999998e-54  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.961267 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1758  Saccharopine dehydrogenase (NAD(+), L-glutamate-forming)  36.8 
 
 		 407 aa  214  1.9999999999999998e-54  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.819467 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2468  saccharopine dehydrogenase  38.97 
 
 		 392 aa  213  3.9999999999999995e-54  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3229  Saccharopine dehydrogenase  36.63 
 
 		 405 aa  212  9e-54  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.0356215 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3564  saccharopine dehydrogenase  40.28 
 
 		 419 aa  211  2e-53  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.389675  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1410  saccharopine dehydrogenase  39.7 
 
 		 393 aa  210  3e-53  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5529  saccharopine dehydrogenase (NAD(+), L-glutamate-forming)  38.7 
 
 		 413 aa  208  1e-52  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.317622 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3559  saccharopine dehydrogenase  39.81 
 
 		 419 aa  208  2e-52  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.924034  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3632  saccharopine dehydrogenase  39.81 
 
 		 419 aa  208  2e-52  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.288883 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12475  hypothetical protein  39.53 
 
 		 419 aa  206  5e-52  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.487465 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0966  saccharopine dehydrogenase  33.65 
 
 		 394 aa  206  7e-52  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.287353  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01040  Saccharopine dehydrogenase  35.45 
 
 		 391 aa  204  2e-51  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0726  Saccharopine dehydrogenase  37.91 
 
 		 421 aa  204  2e-51  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.945634  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3626  saccharopine dehydrogenase  38.5 
 
 		 410 aa  204  2e-51  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0538  saccharopine dehydrogenase  39 
 
 		 394 aa  201  1.9999999999999998e-50  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.028356 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0528  Saccharopine dehydrogenase (NAD(+), L-glutamate-forming)  36.47 
 
 		 414 aa  199  6e-50  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0612  Saccharopine dehydrogenase (NAD(+), L-glutamate- forming)  39.9 
 
 		 404 aa  199  1.0000000000000001e-49  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2628  saccharopine dehydrogenase  39.01 
 
 		 420 aa  197  2.0000000000000003e-49  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6531  saccharopine dehydrogenase (NAD(+), L-glutamate-forming)  38.12 
 
 		 416 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.429838  normal  0.0830191 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2098  Saccharopine dehydrogenase  40.34 
 
 		 406 aa  197  3e-49  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.176484  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7476  putative saccharopine dehydrogenase  35.89 
 
 		 414 aa  195  1e-48  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6045  saccharopine dehydrogenase  37.44 
 
 		 416 aa  195  1e-48  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.233405 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5681  saccharopine dehydrogenase  37.44 
 
 		 416 aa  195  1e-48  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0147  saccharopine dehydrogenase  38.4 
 
 		 390 aa  192  7e-48  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5854  saccharopine dehydrogenase (NAD(+), L-glutamate-forming)  37.74 
 
 		 419 aa  191  2e-47  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0761  saccharopine dehydrogenase  37.74 
 
 		 390 aa  188  2e-46  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.092015  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0514  saccharopine dehydrogenase  35.34 
 
 		 377 aa  187  4e-46  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.895808  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1105  Saccharopine dehydrogenase  36.85 
 
 		 422 aa  186  6e-46  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0541  Saccharopine dehydrogenase (NAD(+), L-glutamate-forming)  34.22 
 
 		 414 aa  185  1.0000000000000001e-45  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6092  saccharopine dehydrogenase  36.36 
 
 		 419 aa  183  4.0000000000000006e-45  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.207649  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12967  hypothetical protein  37 
 
 		 418 aa  183  5.0000000000000004e-45  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2873  saccharopine dehydrogenase  38.61 
 
 		 404 aa  181  2e-44  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.183761 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3953  saccharopine dehydrogenase  36.07 
 
 		 421 aa  179  4.999999999999999e-44  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0682928  normal  1 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_32292  predicted protein  31.99 
 
 		 502 aa  171  2e-41  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0355171  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07293  conserved hypothetical protein  29.27 
 
 		 430 aa  145  2e-33  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.087222 
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_89710  predicted protein  32.63 
 
 		 436 aa  129  1.0000000000000001e-28  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.332936 
 
 
-
 
NC_006692  CNG03750  conserved hypothetical protein  28.76 
 
 		 427 aa  122  1.9999999999999998e-26  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011698  PHATRDRAFT_41409  predicted protein  29.57 
 
 		 1506 aa  121  1.9999999999999998e-26  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.974379  n/a   
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_16272  predicted protein  30.62 
 
 		 498 aa  107  3e-22  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3455  saccharopine dehydrogenase  41.27 
 
 		 378 aa  107  5e-22  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.750747  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1643  saccharopine dehydrogenase  28.61 
 
 		 382 aa  99.4  9e-20  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4124  Saccharopine dehydrogenase  39.61 
 
 		 361 aa  92.8  1e-17  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15850  UbiD family decarboxylase  41.26 
 
 		 376 aa  85.9  0.000000000000001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.647693  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5762  Saccharopine dehydrogenase  27.91 
 
 		 355 aa  84.3  0.000000000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.353531 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56730  hypothetical protein  34.22 
 
 		 352 aa  80.9  0.00000000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3185  Saccharopine dehydrogenase  32.49 
 
 		 352 aa  79.3  0.00000000000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.418477  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3084  Saccharopine dehydrogenase  32.08 
 
 		 352 aa  78.6  0.0000000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.413976  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1135  Saccharopine dehydrogenase  29.8 
 
 		 368 aa  77.8  0.0000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2986  saccharopine dehydrogenase  32.49 
 
 		 365 aa  77  0.0000000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0188424  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3399  Saccharopine dehydrogenase  30.77 
 
 		 350 aa  74.7  0.000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00148167  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2359  Saccharopine dehydrogenase  30.45 
 
 		 345 aa  74.7  0.000000000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0263338  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4933  hypothetical protein  32.98 
 
 		 352 aa  73.2  0.000000000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.76632  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3058  saccharopine dehydrogenase  35.33 
 
 		 348 aa  72.4  0.00000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2027  saccharopine dehydrogenase  29.19 
 
 		 351 aa  71.6  0.00000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0488088  normal  0.664425 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3635  Saccharopine dehydrogenase  26.58 
 
 		 363 aa  70.5  0.00000000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4206  saccharopine dehydrogenase  35.34 
 
 		 371 aa  65.5  0.000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0176  hypothetical protein  35.96 
 
 		 376 aa  63.2  0.000000007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.668245 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3544  putative integral membrane protein  32.17 
 
 		 324 aa  62.8  0.00000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0710897 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1361  Saccharopine dehydrogenase  32.39 
 
 		 376 aa  60.5  0.00000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001157  putative integral membrane protein  28.18 
 
 		 360 aa  60.5  0.00000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1339  Saccharopine dehydrogenase  29.07 
 
 		 343 aa  60.1  0.00000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.072139  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6607  saccharopine dehydrogenase  32.1 
 
 		 340 aa  57  0.0000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1054  hypothetical protein  27.75 
 
 		 351 aa  53.9  0.000004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.380877  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1149  hypothetical protein  27.75 
 
 		 351 aa  53.9  0.000005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0316  saccharopine dehydrogenase  35.06 
 
 		 395 aa  53.5  0.000007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.424303  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2746  saccharopine dehydrogenase  34.82 
 
 		 377 aa  52.4  0.00001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000611807  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2316  Saccharopine dehydrogenase  30.49 
 
 		 413 aa  51.2  0.00003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.385349  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3672  saccharopine dehydrogenase  29.58 
 
 		 353 aa  51.2  0.00003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.420648 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6392  saccharopine dehydrogenase:NmrA-like  30.7 
 
 		 377 aa  47  0.0006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.370059  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6680  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  26.79 
 
 		 258 aa  45.8  0.001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4354  saccharopine dehydrogenase  29.82 
 
 		 376 aa  45.8  0.001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3474  saccharopine dehydrogenase  29.93 
 
 		 351 aa  45.4  0.002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.103531  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5825  saccharopine dehydrogenase  29.82 
 
 		 376 aa  45.1  0.002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.382888  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5035  saccharopine dehydrogenase  29.82 
 
 		 376 aa  45.1  0.002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_34724  predicted protein  31.3 
 
 		 454 aa  44.7  0.003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0227294  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1424  potassium efflux system protein  25.66 
 
 		 371 aa  44.7  0.003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2859  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.33 
 
 		 293 aa  43.5  0.006  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.725607  normal  0.816114 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5296  saccharopine dehydrogenase  29.2 
 
 		 351 aa  43.5  0.006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.813788  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>