94 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sde_1424 on replicon NC_007912
Organism: Saccharophagus degradans 2-40



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007912  Sde_1424  potassium efflux system protein  100 
 
 		 371 aa  764    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2343  saccharopine dehydrogenase  39.52 
 
 		 376 aa  275  1.0000000000000001e-72  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1138  putative transmembrane protein  37.23 
 
 		 375 aa  256  5e-67  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.972053 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03325  saccharopine dehydrogenase  39.94 
 
 		 457 aa  245  9.999999999999999e-64  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3682  hypothetical protein  37.29 
 
 		 375 aa  229  8e-59  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1797  hypothetical protein  37.4 
 
 		 375 aa  224  2e-57  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0455083  normal  0.219568 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2221  saccharopine dehydrogenase  35.85 
 
 		 375 aa  223  3e-57  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000139161  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4996  Saccharopine dehydrogenase  34.19 
 
 		 554 aa  195  1e-48  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.693151  normal  0.884276 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5049  Saccharopine dehydrogenase  32.86 
 
 		 554 aa  194  2e-48  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.529688 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4536  saccharopine dehydrogenase  34.28 
 
 		 557 aa  190  2.9999999999999997e-47  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.802227  normal  0.151907 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0669  Saccharopine dehydrogenase  32.88 
 
 		 577 aa  187  3e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.986243  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4779  saccharopine dehydrogenase  32.07 
 
 		 553 aa  181  1e-44  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0723  Saccharopine dehydrogenase  31.76 
 
 		 574 aa  171  1e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.554623  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0108  saccharopine dehydrogenase  32.43 
 
 		 550 aa  162  1e-38  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.566304  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3620  saccharopine dehydrogenase  30.6 
 
 		 527 aa  116  7.999999999999999e-25  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00695172 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3651  Saccharopine dehydrogenase  23.31 
 
 		 367 aa  77.4  0.0000000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4315  saccharopine dehydrogenase  27.5 
 
 		 378 aa  75.9  0.000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.224112  normal  0.228939 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5058  saccharopine dehydrogenase  21.67 
 
 		 369 aa  73.2  0.000000000006  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1495  Saccharopine dehydrogenase  25.15 
 
 		 376 aa  71.2  0.00000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.0000691069  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4394  saccharopine dehydrogenase  20.58 
 
 		 384 aa  69.3  0.0000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000130212 
 
 
-
 
NC_002936  DET0007  hypothetical protein  22.92 
 
 		 387 aa  63.5  0.000000006  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.870936  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0007  saccharopine dehydrogenase  21.37 
 
 		 387 aa  63.2  0.000000008  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_7  hypothetical protein  22.53 
 
 		 387 aa  62.4  0.00000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2976  saccharopine dehydrogenase  26.54 
 
 		 415 aa  58.9  0.0000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.809568  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0494  saccharopine dehydrogenase  31.06 
 
 		 371 aa  58.9  0.0000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.961307  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2027  saccharopine dehydrogenase  28.15 
 
 		 351 aa  58.5  0.0000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0488088  normal  0.664425 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3626  saccharopine dehydrogenase  30.41 
 
 		 410 aa  56.2  0.0000009  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp3010  hypothetical protein  41.89 
 
 		 87 aa  55.1  0.000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2142  Saccharopine dehydrogenase  27.49 
 
 		 404 aa  55.1  0.000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5762  Saccharopine dehydrogenase  27.61 
 
 		 355 aa  54.3  0.000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.353531 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3399  Saccharopine dehydrogenase  28.57 
 
 		 350 aa  53.9  0.000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00148167  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4933  hypothetical protein  27.41 
 
 		 352 aa  53.1  0.000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.76632  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3084  Saccharopine dehydrogenase  26.56 
 
 		 352 aa  52.4  0.00001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.413976  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2986  saccharopine dehydrogenase  26.43 
 
 		 365 aa  51.6  0.00002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0188424  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3185  Saccharopine dehydrogenase  26.56 
 
 		 352 aa  52  0.00002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.418477  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3058  saccharopine dehydrogenase  29.25 
 
 		 348 aa  51.2  0.00003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_34724  predicted protein  26.47 
 
 		 454 aa  50.8  0.00004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0227294  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56730  hypothetical protein  27.41 
 
 		 352 aa  50.4  0.00005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2140  saccharopine dehydrogenase  32.87 
 
 		 389 aa  50.4  0.00005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.307672 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1676  Saccharopine dehydrogenase  33.63 
 
 		 398 aa  50.1  0.00006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0203222  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0020  Saccharopine dehydrogenase (NAD(+), L-glutamate- forming)  24.82 
 
 		 390 aa  50.1  0.00006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.947878 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1149  hypothetical protein  25.93 
 
 		 351 aa  49.7  0.00007  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1054  hypothetical protein  25.93 
 
 		 351 aa  50.1  0.00007  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.380877  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4206  saccharopine dehydrogenase  25.38 
 
 		 371 aa  49.7  0.00008  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3519  Saccharopine dehydrogenase  25.69 
 
 		 405 aa  48.9  0.0001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.368548  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3635  Saccharopine dehydrogenase  25.9 
 
 		 363 aa  48.1  0.0002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2095  saccharopine dehydrogenase-like protein  25.26 
 
 		 399 aa  48.1  0.0002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15850  UbiD family decarboxylase  28.78 
 
 		 376 aa  48.5  0.0002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.647693  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2359  Saccharopine dehydrogenase  27.27 
 
 		 345 aa  48.1  0.0003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0263338  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0999  saccharopine dehydrogenase  26.79 
 
 		 405 aa  48.1  0.0003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0445398  hitchhiker  0.00533099 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4494  saccharopine dehydrogenase  28.17 
 
 		 343 aa  48.1  0.0003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.802239  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001157  putative integral membrane protein  26.15 
 
 		 360 aa  47.8  0.0003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_16272  predicted protein  28.57 
 
 		 498 aa  47.8  0.0004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0125  Saccharopine dehydrogenase  26.09 
 
 		 403 aa  47.4  0.0004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1081  saccharopine dehydrogenase  32.56 
 
 		 399 aa  47  0.0005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.706576  normal  0.0928318 
 
 
-
 
NC_002950  PG0677  saccharopine dehydrogenase  27.78 
 
 		 397 aa  47  0.0005  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.10466 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0902  saccharopine dehydrogenase  27.37 
 
 		 397 aa  47  0.0006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000168136 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2539  saccharopine dehydrogenase  27.37 
 
 		 398 aa  47  0.0006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1339  Saccharopine dehydrogenase  28.49 
 
 		 343 aa  47  0.0006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.072139  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12850  hypothetical protein  25.29 
 
 		 391 aa  46.6  0.0007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.971112  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2300  Saccharopine dehydrogenase  23.7 
 
 		 408 aa  46.6  0.0008  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0134168  hitchhiker  0.00267876 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07293  conserved hypothetical protein  23.31 
 
 		 430 aa  46.6  0.0008  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.087222 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2928  saccharopine dehydrogenase  33.04 
 
 		 414 aa  45.8  0.001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2764  saccharopine dehydrogenase  33.04 
 
 		 414 aa  45.8  0.001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.114818  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1361  Saccharopine dehydrogenase  28.04 
 
 		 376 aa  46.2  0.001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2607  saccharopine dehydrogenase  31.48 
 
 		 398 aa  45.4  0.002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2918  Saccharopine dehydrogenase  27.67 
 
 		 398 aa  45.4  0.002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3544  putative integral membrane protein  30.56 
 
 		 324 aa  45.4  0.002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0710897 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1128  Saccharopine dehydrogenase  27.45 
 
 		 399 aa  45.4  0.002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.785881  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0864  saccharopine dehydrogenase  24.24 
 
 		 380 aa  45.1  0.002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.109477  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1148  saccharopine dehydrogenase  23.78 
 
 		 325 aa  45.1  0.002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1038  saccharopine dehydrogenase  24.48 
 
 		 325 aa  45.4  0.002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.264702 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0061  saccharopine dehydrogenase  23.08 
 
 		 403 aa  44.3  0.003  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3396  saccharopine dehydrogenase (NAD(+), L-glutamate-forming)  25.66 
 
 		 389 aa  44.7  0.003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.705544  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0176  hypothetical protein  32.69 
 
 		 376 aa  44.3  0.003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.668245 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0514  saccharopine dehydrogenase  26.76 
 
 		 377 aa  44.7  0.003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.895808  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0148  Saccharopine dehydrogenase  26.36 
 
 		 409 aa  44.7  0.003  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4764  Saccharopine dehydrogenase (NAD(+), L-glutamate- forming)  25.35 
 
 		 410 aa  44.3  0.004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2081  saccharopine dehydrogenase  26.17 
 
 		 371 aa  43.9  0.004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.484567  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2039  Saccharopine dehydrogenase  28.29 
 
 		 409 aa  44.3  0.004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.823725  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2888  Saccharopine dehydrogenase  25.93 
 
 		 403 aa  43.9  0.004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.120454 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1105  Saccharopine dehydrogenase  24.49 
 
 		 422 aa  44.3  0.004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2320  Saccharopine dehydrogenase  24.74 
 
 		 396 aa  43.5  0.005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0612  Saccharopine dehydrogenase (NAD(+), L-glutamate- forming)  26.57 
 
 		 404 aa  43.9  0.005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6504  Saccharopine dehydrogenase  21.99 
 
 		 395 aa  43.5  0.006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.752719  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1135  Saccharopine dehydrogenase  25.44 
 
 		 368 aa  43.5  0.006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3712  saccharopine dehydrogenase  25.81 
 
 		 367 aa  43.1  0.007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3008  Saccharopine dehydrogenase (NAD(+), L-glutamate-forming)  25.55 
 
 		 402 aa  43.5  0.007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.762164  normal  0.0490762 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6607  saccharopine dehydrogenase  28.18 
 
 		 340 aa  43.1  0.007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1597  Acyl carrier protein (ACP)  31.71 
 
 		 399 aa  43.1  0.007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.30891  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0988  saccharopine dehydrogenase  32.17 
 
 		 413 aa  43.1  0.008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000577497 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_32292  predicted protein  26.85 
 
 		 502 aa  43.1  0.008  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0355171  n/a   
 
 
-
 
NC_011698  PHATRDRAFT_41409  predicted protein  22.58 
 
 		 1506 aa  42.7  0.009  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.974379  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1307  Saccharopine dehydrogenase  26.19 
 
 		 399 aa  42.7  0.009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000784986 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>