54 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_0494 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010338  Caul_0494  saccharopine dehydrogenase  100 
 
 		 371 aa  727    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.961307  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2359  Saccharopine dehydrogenase  29.53 
 
 		 345 aa  99.4  1e-19  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0263338  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1339  Saccharopine dehydrogenase  31.56 
 
 		 343 aa  95.9  1e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.072139  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3185  Saccharopine dehydrogenase  30.14 
 
 		 352 aa  85.9  0.000000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.418477  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3058  saccharopine dehydrogenase  27.91 
 
 		 348 aa  84.7  0.000000000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2986  saccharopine dehydrogenase  29.83 
 
 		 365 aa  83.6  0.000000000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0188424  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3084  Saccharopine dehydrogenase  29.26 
 
 		 352 aa  82.4  0.00000000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.413976  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2027  saccharopine dehydrogenase  24.78 
 
 		 351 aa  80.1  0.00000000000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0488088  normal  0.664425 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001157  putative integral membrane protein  25.29 
 
 		 360 aa  77.8  0.0000000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56730  hypothetical protein  25.79 
 
 		 352 aa  77.8  0.0000000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5762  Saccharopine dehydrogenase  24.93 
 
 		 355 aa  77  0.0000000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.353531 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1149  hypothetical protein  26.05 
 
 		 351 aa  76.3  0.0000000000008  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4933  hypothetical protein  26.36 
 
 		 352 aa  75.9  0.000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.76632  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1054  hypothetical protein  25.77 
 
 		 351 aa  74.3  0.000000000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.380877  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1361  Saccharopine dehydrogenase  27.52 
 
 		 376 aa  69.7  0.00000000007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3635  Saccharopine dehydrogenase  25.21 
 
 		 363 aa  67.4  0.0000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3672  saccharopine dehydrogenase  29.33 
 
 		 353 aa  65.9  0.000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.420648 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3399  Saccharopine dehydrogenase  25.41 
 
 		 350 aa  64.7  0.000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00148167  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3544  putative integral membrane protein  25 
 
 		 324 aa  62  0.00000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0710897 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0612  Saccharopine dehydrogenase (NAD(+), L-glutamate- forming)  31.76 
 
 		 404 aa  58.5  0.0000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1424  potassium efflux system protein  30.6 
 
 		 371 aa  58.9  0.0000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2976  saccharopine dehydrogenase  28.51 
 
 		 415 aa  57.8  0.0000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.809568  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2628  saccharopine dehydrogenase  30.77 
 
 		 420 aa  56.6  0.0000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3474  saccharopine dehydrogenase  32.05 
 
 		 351 aa  53.5  0.000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.103531  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12967  hypothetical protein  29.73 
 
 		 418 aa  52.4  0.00001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15850  UbiD family decarboxylase  34.09 
 
 		 376 aa  50.8  0.00003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.647693  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1643  saccharopine dehydrogenase  24.88 
 
 		 382 aa  51.2  0.00003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5296  saccharopine dehydrogenase  31.41 
 
 		 351 aa  50.4  0.00004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.813788  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2140  saccharopine dehydrogenase  31.13 
 
 		 389 aa  50.4  0.00005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.307672 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2343  saccharopine dehydrogenase  30.37 
 
 		 376 aa  50.1  0.00006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1495  Saccharopine dehydrogenase  30.77 
 
 		 376 aa  49.7  0.00008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.0000691069  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2300  Saccharopine dehydrogenase  27.7 
 
 		 408 aa  49.7  0.00008  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0134168  hitchhiker  0.00267876 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1135  Saccharopine dehydrogenase  31.78 
 
 		 368 aa  48.1  0.0002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4206  saccharopine dehydrogenase  30.07 
 
 		 371 aa  47.4  0.0004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3682  hypothetical protein  32.82 
 
 		 375 aa  47  0.0005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3639  saccharopine dehydrogenase (NAD(+), L-glutamate-forming)  28.25 
 
 		 389 aa  46.6  0.0007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000739402 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3626  saccharopine dehydrogenase  30.82 
 
 		 410 aa  46.6  0.0007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2123  saccharopine dehydrogenase (NAD(+), L-glutamate-forming)  26.49 
 
 		 419 aa  46.6  0.0008  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0383643 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3632  saccharopine dehydrogenase  28.86 
 
 		 419 aa  46.2  0.0008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.288883 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3559  saccharopine dehydrogenase  28.86 
 
 		 419 aa  46.2  0.0008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.924034  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1797  hypothetical protein  30.15 
 
 		 375 aa  46.2  0.001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0455083  normal  0.219568 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3564  saccharopine dehydrogenase  28.86 
 
 		 419 aa  46.2  0.001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.389675  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4124  Saccharopine dehydrogenase  29.1 
 
 		 361 aa  45.8  0.001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4764  Saccharopine dehydrogenase (NAD(+), L-glutamate- forming)  28.99 
 
 		 410 aa  45.1  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0129  hypothetical protein  23.03 
 
 		 432 aa  45.1  0.002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.150233  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4394  saccharopine dehydrogenase  28.67 
 
 		 384 aa  45.4  0.002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000130212 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0138  saccharopine dehydrogenase  22.22 
 
 		 432 aa  44.3  0.003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12475  hypothetical protein  30.14 
 
 		 419 aa  44.7  0.003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.487465 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6531  saccharopine dehydrogenase (NAD(+), L-glutamate-forming)  28 
 
 		 416 aa  43.5  0.006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.429838  normal  0.0830191 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3620  saccharopine dehydrogenase  39.06 
 
 		 527 aa  43.1  0.008  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00695172 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5529  saccharopine dehydrogenase (NAD(+), L-glutamate-forming)  25.85 
 
 		 413 aa  43.1  0.008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.317622 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0783  saccharopine dehydrogenase  29.2 
 
 		 388 aa  42.7  0.009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2098  Saccharopine dehydrogenase  29.5 
 
 		 406 aa  42.7  0.009  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.176484  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5058  saccharopine dehydrogenase  24.56 
 
 		 369 aa  42.7  0.01  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>