64 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPTO_3682 on replicon NC_004578
Organism: Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004578  PSPTO_3682  hypothetical protein  100 
 
 		 375 aa  763    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1797  hypothetical protein  81.18 
 
 		 375 aa  622  1e-177  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0455083  normal  0.219568 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2221  saccharopine dehydrogenase  68.72 
 
 		 375 aa  510  1e-143  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000139161  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1424  potassium efflux system protein  37.29 
 
 		 371 aa  229  8e-59  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2343  saccharopine dehydrogenase  34.43 
 
 		 376 aa  212  1e-53  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1138  putative transmembrane protein  38.1 
 
 		 375 aa  196  8.000000000000001e-49  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.972053 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0669  Saccharopine dehydrogenase  34.29 
 
 		 577 aa  166  8e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.986243  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03325  saccharopine dehydrogenase  34.15 
 
 		 457 aa  163  4.0000000000000004e-39  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4996  Saccharopine dehydrogenase  31.28 
 
 		 554 aa  156  6e-37  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.693151  normal  0.884276 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0723  Saccharopine dehydrogenase  32.01 
 
 		 574 aa  153  4e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.554623  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0108  saccharopine dehydrogenase  32.1 
 
 		 550 aa  152  1e-35  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.566304  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4536  saccharopine dehydrogenase  31.86 
 
 		 557 aa  150  4e-35  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.802227  normal  0.151907 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5049  Saccharopine dehydrogenase  32.68 
 
 		 554 aa  149  9e-35  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.529688 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4779  saccharopine dehydrogenase  33.33 
 
 		 553 aa  140  3e-32  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3620  saccharopine dehydrogenase  31.85 
 
 		 527 aa  95.5  1e-18  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00695172 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3651  Saccharopine dehydrogenase  23.97 
 
 		 367 aa  88.6  2e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5058  saccharopine dehydrogenase  31.48 
 
 		 369 aa  75.1  0.000000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4315  saccharopine dehydrogenase  30.59 
 
 		 378 aa  74.7  0.000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.224112  normal  0.228939 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1495  Saccharopine dehydrogenase  25.14 
 
 		 376 aa  73.2  0.000000000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.0000691069  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4394  saccharopine dehydrogenase  30.97 
 
 		 384 aa  72.4  0.00000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000130212 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3635  Saccharopine dehydrogenase  25.37 
 
 		 363 aa  58.2  0.0000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0020  Saccharopine dehydrogenase (NAD(+), L-glutamate- forming)  26.81 
 
 		 390 aa  57.8  0.0000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.947878 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2140  saccharopine dehydrogenase  33.8 
 
 		 389 aa  55.8  0.000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.307672 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2986  saccharopine dehydrogenase  33.33 
 
 		 365 aa  54.7  0.000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0188424  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3084  Saccharopine dehydrogenase  33.33 
 
 		 352 aa  54.7  0.000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.413976  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3185  Saccharopine dehydrogenase  33.33 
 
 		 352 aa  54.7  0.000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.418477  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2027  saccharopine dehydrogenase  24.74 
 
 		 351 aa  54.3  0.000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0488088  normal  0.664425 
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_34724  predicted protein  25.91 
 
 		 454 aa  52  0.00002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0227294  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15850  UbiD family decarboxylase  33.58 
 
 		 376 aa  50.4  0.00005  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.647693  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07293  conserved hypothetical protein  25.57 
 
 		 430 aa  48.9  0.0001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.087222 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3399  Saccharopine dehydrogenase  27.91 
 
 		 350 aa  48.5  0.0002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00148167  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3626  saccharopine dehydrogenase  27.27 
 
 		 410 aa  47.8  0.0003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54890  hypothetical protein  24.52 
 
 		 634 aa  47.4  0.0004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000000285931  unclonable  1.9973799999999998e-21 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1339  Saccharopine dehydrogenase  31.51 
 
 		 343 aa  47.8  0.0004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.072139  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2719  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  39.02 
 
 		 358 aa  47.4  0.0005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.719616  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0494  saccharopine dehydrogenase  32.82 
 
 		 371 aa  47  0.0005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.961307  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12475  hypothetical protein  27.08 
 
 		 419 aa  47  0.0005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.487465 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0541  Saccharopine dehydrogenase (NAD(+), L-glutamate-forming)  23.63 
 
 		 414 aa  45.8  0.001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3564  saccharopine dehydrogenase  28.47 
 
 		 419 aa  45.4  0.001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.389675  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3672  saccharopine dehydrogenase  26.79 
 
 		 353 aa  45.4  0.001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.420648 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2300  Saccharopine dehydrogenase  26.62 
 
 		 408 aa  45.8  0.001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0134168  hitchhiker  0.00267876 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2605  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.93 
 
 		 338 aa  45.1  0.002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2359  Saccharopine dehydrogenase  27.72 
 
 		 345 aa  45.4  0.002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0263338  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3632  saccharopine dehydrogenase  28.47 
 
 		 419 aa  45.4  0.002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.288883 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001157  putative integral membrane protein  28.03 
 
 		 360 aa  45.4  0.002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3712  saccharopine dehydrogenase  22.6 
 
 		 367 aa  45.4  0.002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3559  saccharopine dehydrogenase  28.47 
 
 		 419 aa  45.4  0.002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.924034  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5529  saccharopine dehydrogenase (NAD(+), L-glutamate-forming)  24.69 
 
 		 413 aa  45.4  0.002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.317622 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3058  saccharopine dehydrogenase  28.44 
 
 		 348 aa  44.7  0.003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_89710  predicted protein  28.17 
 
 		 436 aa  44.7  0.003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.332936 
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4088  Saccharopine dehydrogenase (NAD(+), L-glutamate-forming)  27.67 
 
 		 422 aa  44.3  0.003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2976  saccharopine dehydrogenase  25.71 
 
 		 415 aa  44.7  0.003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.809568  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4278  saccharopine dehydrogenase  28.48 
 
 		 388 aa  44.7  0.003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.961267 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01040  Saccharopine dehydrogenase  25.84 
 
 		 391 aa  44.7  0.003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0726  Saccharopine dehydrogenase  28.83 
 
 		 421 aa  43.5  0.005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.945634  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0633  hypothetical protein  22.6 
 
 		 367 aa  43.5  0.006  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.419888  n/a   
 
 
-
 
NC_011690  PHATRDRAFT_40135  predicted protein  25.34 
 
 		 461 aa  43.5  0.006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1846  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.6 
 
 		 287 aa  43.1  0.007  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0528  Saccharopine dehydrogenase (NAD(+), L-glutamate-forming)  23.63 
 
 		 414 aa  43.1  0.007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2098  Saccharopine dehydrogenase  26.89 
 
 		 406 aa  43.5  0.007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.176484  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4764  Saccharopine dehydrogenase (NAD(+), L-glutamate- forming)  28.57 
 
 		 410 aa  43.1  0.009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5854  saccharopine dehydrogenase (NAD(+), L-glutamate-forming)  24.53 
 
 		 419 aa  42.7  0.009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0138  saccharopine dehydrogenase  26.28 
 
 		 432 aa  43.1  0.009  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7476  putative saccharopine dehydrogenase  25.32 
 
 		 414 aa  42.7  0.01  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>