45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyr_1797 on replicon NC_007005
Organism: Pseudomonas syringae pv. syringae B728a



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007005  Psyr_1797  hypothetical protein  100 
 
 		 375 aa  766    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0455083  normal  0.219568 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3682  hypothetical protein  81.18 
 
 		 375 aa  622  1e-177  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2221  saccharopine dehydrogenase  65.32 
 
 		 375 aa  490  1e-137  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000139161  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1424  potassium efflux system protein  37.4 
 
 		 371 aa  224  2e-57  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1138  putative transmembrane protein  38.94 
 
 		 375 aa  203  4e-51  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.972053 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2343  saccharopine dehydrogenase  32.45 
 
 		 376 aa  201  1.9999999999999998e-50  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03325  saccharopine dehydrogenase  34.15 
 
 		 457 aa  172  9e-42  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4996  Saccharopine dehydrogenase  32.97 
 
 		 554 aa  160  3e-38  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.693151  normal  0.884276 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0669  Saccharopine dehydrogenase  32.8 
 
 		 577 aa  160  4e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.986243  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5049  Saccharopine dehydrogenase  32.8 
 
 		 554 aa  155  7e-37  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.529688 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4536  saccharopine dehydrogenase  33.16 
 
 		 557 aa  155  9e-37  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.802227  normal  0.151907 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0108  saccharopine dehydrogenase  30.91 
 
 		 550 aa  143  4e-33  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.566304  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0723  Saccharopine dehydrogenase  32.01 
 
 		 574 aa  140  3e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.554623  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4779  saccharopine dehydrogenase  33.05 
 
 		 553 aa  129  9.000000000000001e-29  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3620  saccharopine dehydrogenase  35.51 
 
 		 527 aa  110  4.0000000000000004e-23  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00695172 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3651  Saccharopine dehydrogenase  26.28 
 
 		 367 aa  88.6  2e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5058  saccharopine dehydrogenase  26.82 
 
 		 369 aa  84  0.000000000000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1495  Saccharopine dehydrogenase  23.99 
 
 		 376 aa  74.7  0.000000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.0000691069  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4315  saccharopine dehydrogenase  26.38 
 
 		 378 aa  70.5  0.00000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.224112  normal  0.228939 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4394  saccharopine dehydrogenase  30.57 
 
 		 384 aa  69.7  0.00000000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000130212 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3635  Saccharopine dehydrogenase  25.87 
 
 		 363 aa  64.3  0.000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0020  Saccharopine dehydrogenase (NAD(+), L-glutamate- forming)  27.06 
 
 		 390 aa  57.8  0.0000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.947878 
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_34724  predicted protein  32.87 
 
 		 454 aa  55.8  0.000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0227294  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3084  Saccharopine dehydrogenase  30.28 
 
 		 352 aa  53.5  0.000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.413976  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3185  Saccharopine dehydrogenase  30.28 
 
 		 352 aa  53.9  0.000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.418477  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2986  saccharopine dehydrogenase  28.49 
 
 		 365 aa  53.5  0.000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0188424  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001157  putative integral membrane protein  28.79 
 
 		 360 aa  48.9  0.0002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1339  Saccharopine dehydrogenase  31.51 
 
 		 343 aa  47.8  0.0003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.072139  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3399  Saccharopine dehydrogenase  26.36 
 
 		 350 aa  47.8  0.0003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00148167  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3058  saccharopine dehydrogenase  30.1 
 
 		 348 aa  47.8  0.0003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011690  PHATRDRAFT_40135  predicted protein  32.94 
 
 		 461 aa  46.6  0.0007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2027  saccharopine dehydrogenase  23.35 
 
 		 351 aa  45.8  0.001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0488088  normal  0.664425 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0494  saccharopine dehydrogenase  30.15 
 
 		 371 aa  45.8  0.001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.961307  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0864  saccharopine dehydrogenase  28.57 
 
 		 380 aa  45.1  0.002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.109477  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15850  UbiD family decarboxylase  31.34 
 
 		 376 aa  45.1  0.002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.647693  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_7  hypothetical protein  23.03 
 
 		 387 aa  44.3  0.003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56730  hypothetical protein  27.8 
 
 		 352 aa  44.3  0.003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2611  Saccharopine dehydrogenase  26.05 
 
 		 413 aa  44.3  0.004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2976  saccharopine dehydrogenase  23.53 
 
 		 415 aa  43.9  0.005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.809568  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2316  Saccharopine dehydrogenase  31.52 
 
 		 413 aa  43.5  0.006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.385349  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2300  Saccharopine dehydrogenase  27.27 
 
 		 408 aa  43.1  0.008  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0134168  hitchhiker  0.00267876 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0007  saccharopine dehydrogenase  24.1 
 
 		 387 aa  43.1  0.008  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2140  saccharopine dehydrogenase  29.08 
 
 		 389 aa  43.1  0.008  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.307672 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4933  hypothetical protein  27.39 
 
 		 352 aa  42.7  0.009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.76632  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0007  hypothetical protein  23.03 
 
 		 387 aa  42.7  0.01  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.870936  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>