51 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpop_5049 on replicon NC_010725
Organism: Methylobacterium populi BJ001



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011757  Mchl_4996  Saccharopine dehydrogenase  88.27 
 
 		 554 aa  879    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.693151  normal  0.884276 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4536  saccharopine dehydrogenase  88.81 
 
 		 557 aa  884    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.802227  normal  0.151907 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5049  Saccharopine dehydrogenase  100 
 
 		 554 aa  1046    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.529688 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0108  saccharopine dehydrogenase  46.47 
 
 		 550 aa  323  5e-87  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.566304  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4779  saccharopine dehydrogenase  42.68 
 
 		 553 aa  306  9.000000000000001e-82  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0669  Saccharopine dehydrogenase  39.93 
 
 		 577 aa  280  4e-74  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.986243  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0723  Saccharopine dehydrogenase  39.13 
 
 		 574 aa  248  1e-64  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.554623  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3620  saccharopine dehydrogenase  40.94 
 
 		 527 aa  245  9.999999999999999e-64  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00695172 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1138  putative transmembrane protein  42.66 
 
 		 375 aa  225  2e-57  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.972053 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03325  saccharopine dehydrogenase  41.58 
 
 		 457 aa  221  3e-56  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2343  saccharopine dehydrogenase  31.52 
 
 		 376 aa  205  2e-51  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1424  potassium efflux system protein  32.86 
 
 		 371 aa  204  3e-51  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1797  hypothetical protein  32.8 
 
 		 375 aa  166  6.9999999999999995e-40  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0455083  normal  0.219568 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3682  hypothetical protein  32.49 
 
 		 375 aa  160  7e-38  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2221  saccharopine dehydrogenase  30.14 
 
 		 375 aa  144  3e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000139161  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1076  hypothetical protein  32.79 
 
 		 181 aa  79.3  0.0000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.376591  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0980  hypothetical protein  32.57 
 
 		 181 aa  79.3  0.0000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.213809  normal  0.0628695 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1137  hypothetical protein  33.33 
 
 		 180 aa  76.3  0.000000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04871  hypothetical protein  35.36 
 
 		 176 aa  76.3  0.000000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2884  hypothetical protein  34.09 
 
 		 176 aa  73.9  0.000000000006  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4394  saccharopine dehydrogenase  21.51 
 
 		 384 aa  73.6  0.000000000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000130212 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3157  hypothetical protein  33.9 
 
 		 174 aa  68.9  0.0000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3651  Saccharopine dehydrogenase  23.53 
 
 		 367 aa  68.6  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1495  Saccharopine dehydrogenase  27.75 
 
 		 376 aa  65.9  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.0000691069  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3456  hypothetical protein  32.78 
 
 		 174 aa  65.1  0.000000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.316596  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0007  hypothetical protein  24.86 
 
 		 387 aa  65.1  0.000000003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.870936  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5058  saccharopine dehydrogenase  21.67 
 
 		 369 aa  64.3  0.000000006  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2482  hypothetical protein  28.32 
 
 		 172 aa  63.5  0.000000009  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.470104  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_7  hypothetical protein  25 
 
 		 387 aa  60.5  0.00000007  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4315  saccharopine dehydrogenase  22.37 
 
 		 378 aa  60.8  0.00000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.224112  normal  0.228939 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4206  saccharopine dehydrogenase  28.77 
 
 		 371 aa  60.5  0.00000008  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0007  saccharopine dehydrogenase  24.29 
 
 		 387 aa  59.3  0.0000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_34724  predicted protein  36 
 
 		 454 aa  58.5  0.0000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0227294  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2976  saccharopine dehydrogenase  32.08 
 
 		 415 aa  54.7  0.000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.809568  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2888  Saccharopine dehydrogenase  22.49 
 
 		 403 aa  52  0.00003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.120454 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0770  saccharopine dehydrogenase  29.27 
 
 		 335 aa  47.8  0.0005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2027  saccharopine dehydrogenase  31.54 
 
 		 351 aa  47.8  0.0006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0488088  normal  0.664425 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5762  Saccharopine dehydrogenase  30.4 
 
 		 355 aa  47  0.0008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.353531 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001157  putative integral membrane protein  27.42 
 
 		 360 aa  47  0.001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2320  Saccharopine dehydrogenase  27.21 
 
 		 396 aa  47  0.001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3635  Saccharopine dehydrogenase  28.2 
 
 		 363 aa  46.2  0.001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6504  Saccharopine dehydrogenase  23.66 
 
 		 395 aa  45.8  0.002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.752719  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1215  hypothetical protein  24.89 
 
 		 233 aa  46.2  0.002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.932644  normal  0.206964 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1835  Saccharopine dehydrogenase  32.12 
 
 		 398 aa  44.7  0.004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.257501  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2095  saccharopine dehydrogenase-like protein  22.58 
 
 		 399 aa  44.7  0.004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0747  saccharopine dehydrogenase  20.8 
 
 		 403 aa  44.7  0.004  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  unclonable  0.0000418334  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5296  saccharopine dehydrogenase  38.2 
 
 		 351 aa  44.7  0.005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.813788  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1201  saccharopine dehydrogenase  22.62 
 
 		 402 aa  44.3  0.006  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.150944  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0572  saccharopine dehydrogenase  23.35 
 
 		 398 aa  43.5  0.009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2884  saccharopine dehydrogenase  25.3 
 
 		 412 aa  43.5  0.009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2316  Saccharopine dehydrogenase  32.5 
 
 		 413 aa  43.5  0.01  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.385349  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>