52 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_4779 on replicon NC_010505
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010505  Mrad2831_4779  saccharopine dehydrogenase  100 
 
 		 553 aa  1065    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5049  Saccharopine dehydrogenase  43.21 
 
 		 554 aa  308  1.0000000000000001e-82  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.529688 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4536  saccharopine dehydrogenase  42.32 
 
 		 557 aa  307  3e-82  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.802227  normal  0.151907 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4996  Saccharopine dehydrogenase  41.96 
 
 		 554 aa  292  9e-78  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.693151  normal  0.884276 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0669  Saccharopine dehydrogenase  39.69 
 
 		 577 aa  265  1e-69  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.986243  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0723  Saccharopine dehydrogenase  36.81 
 
 		 574 aa  243  7.999999999999999e-63  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.554623  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3620  saccharopine dehydrogenase  37.38 
 
 		 527 aa  219  7e-56  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00695172 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0108  saccharopine dehydrogenase  37.79 
 
 		 550 aa  219  1e-55  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.566304  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1138  putative transmembrane protein  41.49 
 
 		 375 aa  214  3.9999999999999995e-54  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.972053 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2343  saccharopine dehydrogenase  33.69 
 
 		 376 aa  196  1e-48  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1424  potassium efflux system protein  32.88 
 
 		 371 aa  194  3e-48  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03325  saccharopine dehydrogenase  35.53 
 
 		 457 aa  158  2e-37  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3682  hypothetical protein  33.7 
 
 		 375 aa  147  5e-34  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1797  hypothetical protein  33.33 
 
 		 375 aa  135  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0455083  normal  0.219568 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2221  saccharopine dehydrogenase  32.83 
 
 		 375 aa  125  1e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000139161  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04871  hypothetical protein  36.42 
 
 		 176 aa  89  2e-16  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3157  hypothetical protein  37.28 
 
 		 174 aa  84.3  0.000000000000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2884  hypothetical protein  34.68 
 
 		 176 aa  82.4  0.00000000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1076  hypothetical protein  32.24 
 
 		 181 aa  79.3  0.0000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.376591  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4394  saccharopine dehydrogenase  22.19 
 
 		 384 aa  78.2  0.0000000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000130212 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0980  hypothetical protein  30.39 
 
 		 181 aa  75.1  0.000000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.213809  normal  0.0628695 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3651  Saccharopine dehydrogenase  23.79 
 
 		 367 aa  75.1  0.000000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4315  saccharopine dehydrogenase  23.31 
 
 		 378 aa  74.7  0.000000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.224112  normal  0.228939 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1137  hypothetical protein  31.95 
 
 		 180 aa  72  0.00000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2482  hypothetical protein  29.34 
 
 		 172 aa  68.6  0.0000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.470104  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1495  Saccharopine dehydrogenase  27.22 
 
 		 376 aa  60.8  0.00000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.0000691069  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3456  hypothetical protein  30.59 
 
 		 174 aa  56.2  0.000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.316596  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5762  Saccharopine dehydrogenase  27.93 
 
 		 355 aa  54.3  0.000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.353531 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5058  saccharopine dehydrogenase  21.02 
 
 		 369 aa  53.1  0.00001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_34724  predicted protein  28.24 
 
 		 454 aa  53.1  0.00001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0227294  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2027  saccharopine dehydrogenase  25.89 
 
 		 351 aa  52.4  0.00002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0488088  normal  0.664425 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3635  Saccharopine dehydrogenase  24.79 
 
 		 363 aa  52.4  0.00002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001157  putative integral membrane protein  24.09 
 
 		 360 aa  51.6  0.00004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0494  saccharopine dehydrogenase  31.54 
 
 		 371 aa  49.7  0.0001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.961307  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2976  saccharopine dehydrogenase  26.71 
 
 		 415 aa  49.7  0.0001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.809568  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1215  hypothetical protein  29.5 
 
 		 233 aa  50.1  0.0001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.932644  normal  0.206964 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2095  saccharopine dehydrogenase-like protein  24.27 
 
 		 399 aa  48.9  0.0002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1922  saccharopine dehydrogenase  24 
 
 		 392 aa  46.2  0.001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00339893 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2359  Saccharopine dehydrogenase  27.75 
 
 		 345 aa  46.6  0.001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0263338  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03351  Carboxynorspermidine dehydrogenase  23.67 
 
 		 400 aa  46.2  0.002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  decreased coverage  0.00142848  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4494  saccharopine dehydrogenase  31.2 
 
 		 343 aa  46.2  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.802239  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3399  Saccharopine dehydrogenase  23.37 
 
 		 350 aa  45.4  0.002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00148167  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0677  saccharopine dehydrogenase  21.46 
 
 		 397 aa  45.1  0.003  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.10466 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2986  saccharopine dehydrogenase  31.69 
 
 		 365 aa  45.4  0.003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0188424  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0864  saccharopine dehydrogenase  31.1 
 
 		 380 aa  45.1  0.004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.109477  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2495  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.73 
 
 		 251 aa  44.7  0.004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1307  Saccharopine dehydrogenase  26.17 
 
 		 399 aa  44.3  0.005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000784986 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2140  saccharopine dehydrogenase  34.78 
 
 		 389 aa  44.7  0.005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.307672 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0572  saccharopine dehydrogenase  23.81 
 
 		 398 aa  43.9  0.007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0748  saccharopine dehydrogenase  29.63 
 
 		 400 aa  43.9  0.007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3185  Saccharopine dehydrogenase  29.14 
 
 		 352 aa  43.5  0.009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.418477  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1339  Saccharopine dehydrogenase  29.24 
 
 		 343 aa  43.5  0.01  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.072139  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>