98 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MADE_03351 on replicon NC_011138
Organism: Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008228  Patl_0748  saccharopine dehydrogenase  89.5 
 
 		 400 aa  765    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03351  Carboxynorspermidine dehydrogenase  100 
 
 		 400 aa  839    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  decreased coverage  0.00142848  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2320  Saccharopine dehydrogenase  66.33 
 
 		 396 aa  550  1e-155  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6504  Saccharopine dehydrogenase  66.33 
 
 		 395 aa  545  1e-154  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.752719  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2888  Saccharopine dehydrogenase  66.24 
 
 		 403 aa  547  1e-154  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.120454 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0572  saccharopine dehydrogenase  63.61 
 
 		 398 aa  545  1e-154  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1597  Acyl carrier protein (ACP)  64.99 
 
 		 399 aa  538  9.999999999999999e-153  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.30891  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0677  saccharopine dehydrogenase  63.5 
 
 		 397 aa  537  1e-151  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.10466 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0999  saccharopine dehydrogenase  64.12 
 
 		 405 aa  533  1e-150  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0445398  hitchhiker  0.00533099 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1535  Saccharopine dehydrogenase  64.56 
 
 		 396 aa  530  1e-149  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.82797 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3519  Saccharopine dehydrogenase  64.19 
 
 		 405 aa  528  1e-149  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.368548  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1555  Saccharopine dehydrogenase  62.31 
 
 		 401 aa  526  1e-148  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000142738  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2516  saccharopine dehydrogenase  64.05 
 
 		 396 aa  522  1e-147  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.558897  normal  0.297438 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3052  saccharopine dehydrogenase  61.95 
 
 		 399 aa  520  1e-146  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1081  saccharopine dehydrogenase  61.65 
 
 		 399 aa  518  1e-146  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.706576  normal  0.0928318 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0148  Saccharopine dehydrogenase  61.01 
 
 		 409 aa  519  1e-146  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1922  saccharopine dehydrogenase  62.37 
 
 		 392 aa  511  1e-144  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00339893 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1790  saccharopine dehydrogenase  61.93 
 
 		 401 aa  512  1e-144  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1128  Saccharopine dehydrogenase  61.44 
 
 		 399 aa  514  1e-144  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.785881  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1201  saccharopine dehydrogenase  61.06 
 
 		 402 aa  509  1e-143  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.150944  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2095  saccharopine dehydrogenase-like protein  62.09 
 
 		 399 aa  506  9.999999999999999e-143  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0125  Saccharopine dehydrogenase  61.81 
 
 		 403 aa  506  9.999999999999999e-143  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4440  saccharopine dehydrogenase  62.16 
 
 		 401 aa  505  9.999999999999999e-143  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2607  saccharopine dehydrogenase  60.56 
 
 		 398 aa  504  1e-141  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2539  saccharopine dehydrogenase  61.32 
 
 		 398 aa  504  1e-141  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0902  saccharopine dehydrogenase  60.76 
 
 		 397 aa  498  1e-140  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000168136 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1676  Saccharopine dehydrogenase  60.81 
 
 		 398 aa  494  1e-139  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0203222  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1307  Saccharopine dehydrogenase  60.81 
 
 		 399 aa  488  1e-137  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000784986 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1181  saccharopine dehydrogenase  58.88 
 
 		 394 aa  489  1e-137  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.886294  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2918  Saccharopine dehydrogenase  60.81 
 
 		 398 aa  483  1e-135  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0458  saccharopine dehydrogenase  56.14 
 
 		 401 aa  481  1e-134  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2142  Saccharopine dehydrogenase  59.9 
 
 		 404 aa  480  1e-134  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0981  saccharopine dehydrogenase  59.8 
 
 		 398 aa  478  1e-133  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0620633  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0285  saccharopine dehydrogenase  56.2 
 
 		 404 aa  471  1e-132  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0208  saccharopine dehydrogenase  55 
 
 		 401 aa  471  1e-132  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.69447  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0165  saccharopine dehydrogenase  54.5 
 
 		 401 aa  466  9.999999999999999e-131  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0747  saccharopine dehydrogenase  55.95 
 
 		 403 aa  465  9.999999999999999e-131  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  unclonable  0.0000418334  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0186  saccharopine dehydrogenase  54.55 
 
 		 401 aa  463  1e-129  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0061  saccharopine dehydrogenase  54.8 
 
 		 403 aa  458  9.999999999999999e-129  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0415  saccharopine dehydrogenase  54.52 
 
 		 405 aa  451  1e-125  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02740  hypothetical protein  47.9 
 
 		 417 aa  376  1e-103  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003102  carboxynorspermidine dehydrogenase putative  46.78 
 
 		 414 aa  369  1e-101  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.185885  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2137  saccharopine dehydrogenase  45.02 
 
 		 414 aa  356  3.9999999999999996e-97  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0299628  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1231  hypothetical protein  45.54 
 
 		 414 aa  352  8e-96  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00001292  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2289  saccharopine dehydrogenase  44.8 
 
 		 405 aa  350  2e-95  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.772575  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1380  saccharopine dehydrogenase  43.63 
 
 		 412 aa  335  1e-90  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  decreased coverage  0.000104449  normal  0.291708 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2884  saccharopine dehydrogenase  42.21 
 
 		 412 aa  328  7e-89  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1475  saccharopine dehydrogenase family protein  42.96 
 
 		 412 aa  321  9.999999999999999e-87  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0126  saccharopine dehydrogenase  42.96 
 
 		 412 aa  321  9.999999999999999e-87  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.281282 
 
 
-
 
NC_004310  BR0335  hypothetical protein  41.46 
 
 		 413 aa  321  9.999999999999999e-87  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4157  saccharopine dehydrogenase  40.8 
 
 		 413 aa  320  3e-86  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.152115  normal  0.83779 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0352  hypothetical protein  41.46 
 
 		 413 aa  320  3.9999999999999996e-86  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5844  hypothetical protein  41.96 
 
 		 413 aa  317  2e-85  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0438  saccharopine dehydrogenase  41.21 
 
 		 426 aa  315  7e-85  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0417875  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0988  saccharopine dehydrogenase  40.7 
 
 		 413 aa  307  2.0000000000000002e-82  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000577497 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2764  saccharopine dehydrogenase  40.9 
 
 		 414 aa  303  3.0000000000000004e-81  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.114818  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2928  saccharopine dehydrogenase  40.9 
 
 		 414 aa  303  3.0000000000000004e-81  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0028  saccharopine dehydrogenase  39.5 
 
 		 412 aa  301  1e-80  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2955  saccharopine dehydrogenase  40.65 
 
 		 407 aa  293  3e-78  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1715  saccharopine dehydrogenase  38.9 
 
 		 422 aa  286  2.9999999999999996e-76  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  unclonable  0.000000000659439  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2844  saccharopine dehydrogenase  39.64 
 
 		 399 aa  285  1.0000000000000001e-75  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.241943 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2125  saccharopine dehydrogenase  39.64 
 
 		 399 aa  285  1.0000000000000001e-75  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.530272  normal  0.238501 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0914  putative saccharopine dehydrogenase family protein  37.35 
 
 		 424 aa  284  2.0000000000000002e-75  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.867111  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1501  saccharopine dehydrogenase  37.35 
 
 		 424 aa  283  4.0000000000000003e-75  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1950  hypothetical protein  31.23 
 
 		 408 aa  197  4.0000000000000005e-49  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.275408  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3295  Saccharopine dehydrogenase  29.71 
 
 		 403 aa  177  2e-43  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.886794  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3221  saccharopine dehydrogenase  30.73 
 
 		 407 aa  176  9e-43  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5034  saccharopine dehydrogenase  30.3 
 
 		 407 aa  170  4e-41  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4946  saccharopine dehydrogenase  30.3 
 
 		 407 aa  170  4e-41  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5327  saccharopine dehydrogenase  30.3 
 
 		 407 aa  169  7e-41  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0356987  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4677  Saccharopine dehydrogenase  31.12 
 
 		 401 aa  162  1e-38  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2976  saccharopine dehydrogenase  23.97 
 
 		 415 aa  94.7  3e-18  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.809568  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1835  Saccharopine dehydrogenase  23.37 
 
 		 398 aa  94.4  3e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.257501  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4315  saccharopine dehydrogenase  26.18 
 
 		 378 aa  74.7  0.000000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.224112  normal  0.228939 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3651  Saccharopine dehydrogenase  24.37 
 
 		 367 aa  68.2  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5058  saccharopine dehydrogenase  24.68 
 
 		 369 aa  67.8  0.0000000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1254  Saccharopine dehydrogenase  22.84 
 
 		 385 aa  65.9  0.000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4394  saccharopine dehydrogenase  23.44 
 
 		 384 aa  65.9  0.000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000130212 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1495  Saccharopine dehydrogenase  29.26 
 
 		 376 aa  61.6  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.0000691069  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1941  Saccharopine dehydrogenase  23.22 
 
 		 446 aa  56.6  0.0000007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1202  saccharopine dehydrogenase  21.19 
 
 		 403 aa  53.9  0.000004  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001157  putative integral membrane protein  25.91 
 
 		 360 aa  54.3  0.000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3399  Saccharopine dehydrogenase  24.28 
 
 		 350 aa  52.8  0.00001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00148167  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0384  Saccharopine dehydrogenase  20.9 
 
 		 384 aa  52  0.00002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0854083  n/a   
 
 
-
 
NC_006692  CNG01150  spermidine synthase, putative  24.88 
 
 		 748 aa  50.8  0.00004  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1482  hypothetical protein  22.07 
 
 		 394 aa  49.7  0.00009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5762  Saccharopine dehydrogenase  31.01 
 
 		 355 aa  48.9  0.0001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.353531 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_70210  seventh step in lysine biosynthesis pathway  27.78 
 
 		 444 aa  48.9  0.0001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.125717 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2359  Saccharopine dehydrogenase  29.94 
 
 		 345 aa  48.9  0.0002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0263338  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2027  saccharopine dehydrogenase  25.99 
 
 		 351 aa  47.8  0.0004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0488088  normal  0.664425 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1242  saccharopine dehydrogenase  22.07 
 
 		 394 aa  47  0.0006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1339  Saccharopine dehydrogenase  27.98 
 
 		 343 aa  47  0.0006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.072139  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1441  hypothetical protein  21 
 
 		 394 aa  46.2  0.001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05601  saccharopine dehydrogenase (NADP+, L-glutamate-forming) (Eurofung)  27.95 
 
 		 450 aa  44.3  0.004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.404414  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1054  hypothetical protein  27.43 
 
 		 351 aa  43.9  0.005  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.380877  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56730  hypothetical protein  24.06 
 
 		 352 aa  43.5  0.007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3965  hypothetical protein  21.38 
 
 		 394 aa  43.1  0.009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1149  hypothetical protein  27.43 
 
 		 351 aa  42.7  0.01  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>