107 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GWCH70_0384 on replicon NC_012793
Organism: Geobacillus sp. WCH70



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012793  GWCH70_0384  Saccharopine dehydrogenase  100 
 
 		 384 aa  781    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0854083  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1254  Saccharopine dehydrogenase  76.76 
 
 		 385 aa  607  9.999999999999999e-173  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1791  saccharopine dehydrogenase  38.34 
 
 		 392 aa  238  2e-61  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.493672  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2611  Saccharopine dehydrogenase  32.55 
 
 		 413 aa  214  9.999999999999999e-55  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1254  hypothetical protein  29.48 
 
 		 376 aa  146  7.0000000000000006e-34  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.413052  normal  0.0375347 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1622  saccharopine dehydrogenase  33.24 
 
 		 348 aa  144  2e-33  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.871276  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1243  saccharopine dehydrogenase  27.64 
 
 		 365 aa  139  7e-32  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3712  saccharopine dehydrogenase  30.77 
 
 		 367 aa  134  3e-30  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2420  Saccharopine dehydrogenase  27.97 
 
 		 354 aa  133  3.9999999999999996e-30  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.870969  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0633  hypothetical protein  30.58 
 
 		 367 aa  132  1.0000000000000001e-29  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.419888  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4331  saccharopine dehydrogenase  29.6 
 
 		 379 aa  132  1.0000000000000001e-29  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0527  saccharopine dehydrogenase  30.28 
 
 		 347 aa  132  1.0000000000000001e-29  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2656  saccharopine dehydrogenase  29.03 
 
 		 373 aa  131  2.0000000000000002e-29  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6355  saccharopine dehydrogenase  28.69 
 
 		 366 aa  131  2.0000000000000002e-29  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1645  saccharopine dehydrogenase  28.69 
 
 		 366 aa  131  2.0000000000000002e-29  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1723  saccharopine dehydrogenase  28.69 
 
 		 366 aa  131  2.0000000000000002e-29  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1737  saccharopine dehydrogenase  28.69 
 
 		 366 aa  131  2.0000000000000002e-29  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.406485 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1645  saccharopine dehydrogenase  28.69 
 
 		 366 aa  131  2.0000000000000002e-29  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.733408 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1992  putative saccharopine dehydrogenase, NAD-binding  28.18 
 
 		 365 aa  130  3e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.899138  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1536  saccharopine dehydrogenase  28.42 
 
 		 366 aa  130  6e-29  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.938044 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5016  saccharopine dehydrogenase  28.14 
 
 		 366 aa  129  7.000000000000001e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.288707  normal  0.105633 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1835  Saccharopine dehydrogenase  26.89 
 
 		 398 aa  129  8.000000000000001e-29  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.257501  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1846  Saccharopine dehydrogenase  27.25 
 
 		 389 aa  126  6e-28  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2268  Saccharopine dehydrogenase  27.1 
 
 		 365 aa  126  7e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.87049  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0647  saccharopine dehydrogenase  28.33 
 
 		 348 aa  126  8.000000000000001e-28  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3251  dehydrogenase  28.81 
 
 		 373 aa  126  8.000000000000001e-28  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.976387  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0976  hypothetical protein  28.34 
 
 		 366 aa  125  1e-27  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.175424  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2269  saccharopine dehydrogenase  28.34 
 
 		 366 aa  125  1e-27  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.044171  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2080  saccharopine dehydrogenase  28.34 
 
 		 366 aa  125  1e-27  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.599315  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2136  saccharopine dehydrogenase  28.34 
 
 		 366 aa  125  1e-27  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.112826  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2308  hypothetical protein  27.6 
 
 		 366 aa  125  2e-27  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2920  saccharopine dehydrogenase  29.75 
 
 		 367 aa  124  2e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3947  Saccharopine dehydrogenase  28.8 
 
 		 379 aa  124  2e-27  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.35469  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5587  Saccharopine dehydrogenase  30.43 
 
 		 376 aa  124  3e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0890714  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1936  saccharopine dehydrogenase  27.47 
 
 		 392 aa  122  9.999999999999999e-27  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2037  saccharopine dehydrogenase  26.72 
 
 		 389 aa  122  9.999999999999999e-27  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0657  saccharopine dehydrogenase  31.58 
 
 		 346 aa  121  1.9999999999999998e-26  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3051  TrkA-N:saccharopine dehydrogenase  27.81 
 
 		 393 aa  120  3.9999999999999996e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.995368  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0566  saccharopine dehydrogenase  30.13 
 
 		 385 aa  120  3.9999999999999996e-26  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.411174 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5033  Saccharopine dehydrogenase  26.58 
 
 		 354 aa  119  7.999999999999999e-26  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3208  saccharopine dehydrogenase  33.85 
 
 		 397 aa  116  6.9999999999999995e-25  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1035  saccharopine dehydrogenase  26.83 
 
 		 369 aa  116  7.999999999999999e-25  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.002622 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1836  Saccharopine dehydrogenase  26.09 
 
 		 387 aa  113  7.000000000000001e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.973025 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0002  Saccharopine dehydrogenase  27.54 
 
 		 360 aa  112  2.0000000000000002e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0292492 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0002  Saccharopine dehydrogenase  27.54 
 
 		 360 aa  111  2.0000000000000002e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.717423  hitchhiker  0.0043893 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0269  saccharopine dehydrogenase  26.65 
 
 		 385 aa  110  4.0000000000000004e-23  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.901872  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0572  saccharopine dehydrogenase  26.4 
 
 		 388 aa  109  6e-23  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.20382 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1304  hypothetical protein  27.91 
 
 		 362 aa  107  2e-22  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1303  hypothetical protein  27.91 
 
 		 362 aa  107  2e-22  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2810  saccharopine dehydrogenase  31 
 
 		 380 aa  105  1e-21  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.111095  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2155  saccharopine dehydrogenase  27.65 
 
 		 367 aa  105  1e-21  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1242  saccharopine dehydrogenase  24.34 
 
 		 394 aa  99  1e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1441  hypothetical protein  24.07 
 
 		 394 aa  97.4  3e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1482  hypothetical protein  24.07 
 
 		 394 aa  97.1  5e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1379  hypothetical protein  24.31 
 
 		 394 aa  90.9  4e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3965  hypothetical protein  25.37 
 
 		 394 aa  89.4  9e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1241  hypothetical protein  22.81 
 
 		 394 aa  88.6  2e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1217  saccharopine dehydrogenase, NADP+, L-lysine forming; L-lysine dehydrogenase  22.81 
 
 		 394 aa  88.6  2e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1342  hypothetical protein  22.81 
 
 		 394 aa  88.6  2e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1416  hypothetical protein  22.81 
 
 		 394 aa  88.6  2e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.572078 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_70210  seventh step in lysine biosynthesis pathway  23.18 
 
 		 444 aa  87.8  3e-16  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.125717 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1219  saccharopine dehydrogenase, NADP+, L-lysine forming; L-lysine dehydrogenase  22.56 
 
 		 394 aa  85.1  0.000000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.182404  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05601  saccharopine dehydrogenase (NADP+, L-glutamate-forming) (Eurofung)  25 
 
 		 450 aa  82.8  0.00000000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.404414  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2095  saccharopine dehydrogenase-like protein  23.48 
 
 		 399 aa  75.5  0.000000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1950  hypothetical protein  22.8 
 
 		 408 aa  70.5  0.00000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.275408  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2976  saccharopine dehydrogenase  21.96 
 
 		 415 aa  67  0.0000000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.809568  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2539  saccharopine dehydrogenase  23.88 
 
 		 398 aa  66.2  0.0000000008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5327  saccharopine dehydrogenase  24.87 
 
 		 407 aa  65.9  0.000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0356987  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4946  saccharopine dehydrogenase  24.87 
 
 		 407 aa  64.7  0.000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5034  saccharopine dehydrogenase  24.87 
 
 		 407 aa  64.7  0.000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4677  Saccharopine dehydrogenase  25.41 
 
 		 401 aa  65.1  0.000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0902  saccharopine dehydrogenase  23.1 
 
 		 397 aa  63.5  0.000000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000168136 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2707  saccharopine dehydrogenase  23.03 
 
 		 439 aa  63.2  0.000000008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1081  saccharopine dehydrogenase  22.16 
 
 		 399 aa  61.6  0.00000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.706576  normal  0.0928318 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1231  hypothetical protein  29.71 
 
 		 414 aa  60.5  0.00000005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00001292  n/a   
 
 
-
 
NC_006692  CNG01150  spermidine synthase, putative  23.38 
 
 		 748 aa  58.9  0.0000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4394  saccharopine dehydrogenase  23.08 
 
 		 384 aa  59.3  0.0000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000130212 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3519  Saccharopine dehydrogenase  20.49 
 
 		 405 aa  59.3  0.0000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.368548  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3295  Saccharopine dehydrogenase  25.81 
 
 		 403 aa  58.9  0.0000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.886794  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0677  saccharopine dehydrogenase  20.75 
 
 		 397 aa  58.5  0.0000002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.10466 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3651  Saccharopine dehydrogenase  29.49 
 
 		 367 aa  57.4  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0106  saccharopine dehydrogenase (NADP+, L-glutamate forming)  24.03 
 
 		 380 aa  56.6  0.0000006  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4315  saccharopine dehydrogenase  29.11 
 
 		 378 aa  55.8  0.000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.224112  normal  0.228939 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2607  saccharopine dehydrogenase  22.43 
 
 		 398 aa  55.8  0.000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1202  saccharopine dehydrogenase  24.24 
 
 		 403 aa  55.1  0.000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1676  Saccharopine dehydrogenase  23.08 
 
 		 398 aa  55.5  0.000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0203222  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0572  saccharopine dehydrogenase  21.41 
 
 		 398 aa  53.9  0.000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1555  Saccharopine dehydrogenase  21.61 
 
 		 401 aa  54.3  0.000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000142738  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3052  saccharopine dehydrogenase  22.2 
 
 		 399 aa  53.5  0.000006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1922  saccharopine dehydrogenase  22.38 
 
 		 392 aa  52.8  0.00001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00339893 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15850  UbiD family decarboxylase  34.83 
 
 		 376 aa  52.8  0.00001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.647693  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003102  carboxynorspermidine dehydrogenase putative  22.42 
 
 		 414 aa  52.4  0.00001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.185885  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03351  Carboxynorspermidine dehydrogenase  20.9 
 
 		 400 aa  52  0.00002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  decreased coverage  0.00142848  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5058  saccharopine dehydrogenase  26.92 
 
 		 369 aa  51.2  0.00003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1495  Saccharopine dehydrogenase  28.1 
 
 		 376 aa  50.4  0.00005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.0000691069  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3221  saccharopine dehydrogenase  25 
 
 		 407 aa  50.1  0.00007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02740  hypothetical protein  23.68 
 
 		 417 aa  49.7  0.00008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2137  saccharopine dehydrogenase  26.86 
 
 		 414 aa  49.7  0.00008  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0299628  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2289  saccharopine dehydrogenase  24.42 
 
 		 405 aa  47  0.0005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.772575  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1535  Saccharopine dehydrogenase  22.93 
 
 		 396 aa  47  0.0005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.82797 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>