102 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PG0677 on replicon NC_002950
Organism: Porphyromonas gingivalis W83



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002950  PG0677  saccharopine dehydrogenase  100 
 
 		 397 aa  832    Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.10466 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2888  Saccharopine dehydrogenase  70.43 
 
 		 403 aa  609  1e-173  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.120454 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3519  Saccharopine dehydrogenase  70.35 
 
 		 405 aa  607  9.999999999999999e-173  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.368548  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0999  saccharopine dehydrogenase  65.35 
 
 		 405 aa  565  1e-160  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0445398  hitchhiker  0.00533099 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2320  Saccharopine dehydrogenase  65.47 
 
 		 396 aa  551  1e-156  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0748  saccharopine dehydrogenase  64.27 
 
 		 400 aa  546  1e-154  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3052  saccharopine dehydrogenase  62.66 
 
 		 399 aa  545  1e-154  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1128  Saccharopine dehydrogenase  63.68 
 
 		 399 aa  544  1e-153  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.785881  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03351  Carboxynorspermidine dehydrogenase  63.5 
 
 		 400 aa  537  1e-151  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  decreased coverage  0.00142848  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0572  saccharopine dehydrogenase  61.32 
 
 		 398 aa  532  1e-150  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1597  Acyl carrier protein (ACP)  63.75 
 
 		 399 aa  531  1e-150  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.30891  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0148  Saccharopine dehydrogenase  62.76 
 
 		 409 aa  529  1e-149  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1790  saccharopine dehydrogenase  60.56 
 
 		 401 aa  523  1e-147  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1922  saccharopine dehydrogenase  63.33 
 
 		 392 aa  524  1e-147  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00339893 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2095  saccharopine dehydrogenase-like protein  64.08 
 
 		 399 aa  520  1e-146  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2516  saccharopine dehydrogenase  63.68 
 
 		 396 aa  520  1e-146  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.558897  normal  0.297438 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6504  Saccharopine dehydrogenase  62.6 
 
 		 395 aa  521  1e-146  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.752719  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2539  saccharopine dehydrogenase  62.53 
 
 		 398 aa  515  1.0000000000000001e-145  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0902  saccharopine dehydrogenase  62.27 
 
 		 397 aa  511  1e-144  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000168136 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0285  saccharopine dehydrogenase  60.26 
 
 		 404 aa  511  1e-144  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0747  saccharopine dehydrogenase  60.51 
 
 		 403 aa  511  1e-144  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  unclonable  0.0000418334  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1535  Saccharopine dehydrogenase  61.13 
 
 		 396 aa  513  1e-144  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.82797 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1201  saccharopine dehydrogenase  59.39 
 
 		 402 aa  508  1e-143  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.150944  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2607  saccharopine dehydrogenase  61.24 
 
 		 398 aa  509  1e-143  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0415  saccharopine dehydrogenase  61.22 
 
 		 405 aa  509  1e-143  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1555  Saccharopine dehydrogenase  60.1 
 
 		 401 aa  511  1e-143  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000142738  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0458  saccharopine dehydrogenase  58.97 
 
 		 401 aa  508  1e-143  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4440  saccharopine dehydrogenase  60.75 
 
 		 401 aa  505  9.999999999999999e-143  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0125  Saccharopine dehydrogenase  61.07 
 
 		 403 aa  506  9.999999999999999e-143  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0208  saccharopine dehydrogenase  58.72 
 
 		 401 aa  503  1e-141  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.69447  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1676  Saccharopine dehydrogenase  61.76 
 
 		 398 aa  503  1e-141  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0203222  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0165  saccharopine dehydrogenase  58.21 
 
 		 401 aa  501  1e-140  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0186  saccharopine dehydrogenase  58.21 
 
 		 401 aa  498  1e-140  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0061  saccharopine dehydrogenase  58.57 
 
 		 403 aa  499  1e-140  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1081  saccharopine dehydrogenase  58.61 
 
 		 399 aa  496  1e-139  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.706576  normal  0.0928318 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2142  Saccharopine dehydrogenase  60.26 
 
 		 404 aa  496  1e-139  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1307  Saccharopine dehydrogenase  62.53 
 
 		 399 aa  491  9.999999999999999e-139  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000784986 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1181  saccharopine dehydrogenase  57.44 
 
 		 394 aa  486  1e-136  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.886294  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0981  saccharopine dehydrogenase  61.76 
 
 		 398 aa  482  1e-135  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0620633  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2918  Saccharopine dehydrogenase  62.27 
 
 		 398 aa  484  1e-135  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02740  hypothetical protein  46.73 
 
 		 417 aa  375  1e-103  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003102  carboxynorspermidine dehydrogenase putative  45.73 
 
 		 414 aa  373  1e-102  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.185885  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1231  hypothetical protein  45.09 
 
 		 414 aa  358  6e-98  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00001292  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2137  saccharopine dehydrogenase  44.11 
 
 		 414 aa  359  6e-98  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0299628  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2289  saccharopine dehydrogenase  41.85 
 
 		 405 aa  332  7.000000000000001e-90  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.772575  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1380  saccharopine dehydrogenase  40.51 
 
 		 412 aa  319  5e-86  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  decreased coverage  0.000104449  normal  0.291708 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0352  hypothetical protein  40.51 
 
 		 413 aa  317  2e-85  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0335  hypothetical protein  40.51 
 
 		 413 aa  317  3e-85  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4157  saccharopine dehydrogenase  41.27 
 
 		 413 aa  315  6e-85  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.152115  normal  0.83779 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0438  saccharopine dehydrogenase  40 
 
 		 426 aa  312  5.999999999999999e-84  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0417875  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0028  saccharopine dehydrogenase  41.37 
 
 		 412 aa  310  2.9999999999999997e-83  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2884  saccharopine dehydrogenase  39.55 
 
 		 412 aa  308  1.0000000000000001e-82  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5844  hypothetical protein  41.01 
 
 		 413 aa  306  6e-82  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0988  saccharopine dehydrogenase  39.75 
 
 		 413 aa  303  2.0000000000000002e-81  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000577497 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2928  saccharopine dehydrogenase  39.75 
 
 		 414 aa  303  3.0000000000000004e-81  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2764  saccharopine dehydrogenase  39.75 
 
 		 414 aa  303  3.0000000000000004e-81  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.114818  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1475  saccharopine dehydrogenase family protein  40.3 
 
 		 412 aa  302  6.000000000000001e-81  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0126  saccharopine dehydrogenase  40.3 
 
 		 412 aa  302  6.000000000000001e-81  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.281282 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0914  putative saccharopine dehydrogenase family protein  40.25 
 
 		 424 aa  300  3e-80  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.867111  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1501  saccharopine dehydrogenase  40 
 
 		 424 aa  299  6e-80  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1715  saccharopine dehydrogenase  40.1 
 
 		 422 aa  297  2e-79  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  unclonable  0.000000000659439  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2844  saccharopine dehydrogenase  38.02 
 
 		 399 aa  286  2.9999999999999996e-76  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.241943 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2125  saccharopine dehydrogenase  38.02 
 
 		 399 aa  286  4e-76  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.530272  normal  0.238501 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2955  saccharopine dehydrogenase  39.06 
 
 		 407 aa  282  8.000000000000001e-75  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1950  hypothetical protein  30.3 
 
 		 408 aa  182  9.000000000000001e-45  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.275408  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4946  saccharopine dehydrogenase  30.71 
 
 		 407 aa  172  7.999999999999999e-42  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5034  saccharopine dehydrogenase  30.71 
 
 		 407 aa  172  7.999999999999999e-42  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5327  saccharopine dehydrogenase  30.54 
 
 		 407 aa  171  3e-41  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0356987  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3295  Saccharopine dehydrogenase  28.42 
 
 		 403 aa  168  1e-40  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.886794  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3221  saccharopine dehydrogenase  28.89 
 
 		 407 aa  166  5.9999999999999996e-40  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4677  Saccharopine dehydrogenase  28.42 
 
 		 401 aa  154  4e-36  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1835  Saccharopine dehydrogenase  23.1 
 
 		 398 aa  105  1e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.257501  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2976  saccharopine dehydrogenase  23.96 
 
 		 415 aa  94.7  2e-18  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.809568  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4315  saccharopine dehydrogenase  25.32 
 
 		 378 aa  87  5e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.224112  normal  0.228939 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4394  saccharopine dehydrogenase  25.25 
 
 		 384 aa  80.9  0.00000000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000130212 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1495  Saccharopine dehydrogenase  24.94 
 
 		 376 aa  76.6  0.0000000000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.0000691069  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3651  Saccharopine dehydrogenase  24.06 
 
 		 367 aa  71.6  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1254  Saccharopine dehydrogenase  22.14 
 
 		 385 aa  70.5  0.00000000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5058  saccharopine dehydrogenase  23.66 
 
 		 369 aa  65.9  0.000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1202  saccharopine dehydrogenase  20.74 
 
 		 403 aa  59.3  0.0000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1242  saccharopine dehydrogenase  19.51 
 
 		 394 aa  58.9  0.0000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1941  Saccharopine dehydrogenase  26.14 
 
 		 446 aa  58.2  0.0000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0384  Saccharopine dehydrogenase  20.75 
 
 		 384 aa  58.5  0.0000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0854083  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1441  hypothetical protein  20.05 
 
 		 394 aa  56.6  0.0000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2611  Saccharopine dehydrogenase  20.87 
 
 		 413 aa  56.6  0.0000008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1482  hypothetical protein  19.8 
 
 		 394 aa  56.2  0.0000009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006692  CNG01150  spermidine synthase, putative  22.87 
 
 		 748 aa  53.5  0.000007  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3965  hypothetical protein  18.81 
 
 		 394 aa  50.4  0.00005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3399  Saccharopine dehydrogenase  23.51 
 
 		 350 aa  49.3  0.0001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00148167  normal  1 
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_34724  predicted protein  24.44 
 
 		 454 aa  48.5  0.0002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0227294  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1424  potassium efflux system protein  27.78 
 
 		 371 aa  47  0.0005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4331  saccharopine dehydrogenase  25.58 
 
 		 379 aa  46.2  0.001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0073  homospermidine synthase  23.78 
 
 		 476 aa  45.8  0.001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.124838  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0451  homospermidine synthase  23.95 
 
 		 476 aa  46.2  0.001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.045579 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1836  Saccharopine dehydrogenase  22.91 
 
 		 387 aa  46.2  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.973025 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1700  homospermidine synthase  23.93 
 
 		 486 aa  45.1  0.002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.914151  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0078  homospermidine synthase  24.73 
 
 		 481 aa  44.7  0.003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2727  homospermidine synthase  23.95 
 
 		 481 aa  45.1  0.003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1646  homospermidine synthase  22.16 
 
 		 476 aa  44.3  0.004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.322403  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1054  hypothetical protein  24.59 
 
 		 351 aa  43.9  0.005  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.380877  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>