79 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BARBAKC583_0028 on replicon NC_008783
Organism: Bartonella bacilliformis KC583



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_004310  BR0335  hypothetical protein  72.82 
 
 
413 aa  636    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0352  hypothetical protein  72.82 
 
 
413 aa  636    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0028  saccharopine dehydrogenase  100 
 
 
412 aa  854    Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0438  saccharopine dehydrogenase  72.82 
 
 
426 aa  632  1e-180  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0417875  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4157  saccharopine dehydrogenase  71.84 
 
 
413 aa  632  1e-180  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.152115  normal  0.83779 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1380  saccharopine dehydrogenase  70.15 
 
 
412 aa  625  1e-178  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  decreased coverage  0.000104449  normal  0.291708 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5844  hypothetical protein  69.66 
 
 
413 aa  623  1e-177  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2884  saccharopine dehydrogenase  69.66 
 
 
412 aa  622  1e-177  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0988  saccharopine dehydrogenase  71.32 
 
 
413 aa  614  1e-175  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000577497 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2928  saccharopine dehydrogenase  70.83 
 
 
414 aa  612  9.999999999999999e-175  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2764  saccharopine dehydrogenase  70.83 
 
 
414 aa  612  9.999999999999999e-175  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.114818  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0126  saccharopine dehydrogenase  69.66 
 
 
412 aa  612  9.999999999999999e-175  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.281282 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1475  saccharopine dehydrogenase family protein  69.66 
 
 
412 aa  612  9.999999999999999e-175  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1715  saccharopine dehydrogenase  67.07 
 
 
422 aa  588  1e-167  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  unclonable  0.000000000659439  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0914  putative saccharopine dehydrogenase family protein  66.02 
 
 
424 aa  586  1e-166  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.867111  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2844  saccharopine dehydrogenase  69.72 
 
 
399 aa  584  1e-166  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.241943 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1501  saccharopine dehydrogenase  65.78 
 
 
424 aa  584  1.0000000000000001e-165  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2125  saccharopine dehydrogenase  69.72 
 
 
399 aa  584  1.0000000000000001e-165  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.530272  normal  0.238501 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2955  saccharopine dehydrogenase  68.05 
 
 
407 aa  573  1.0000000000000001e-162  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003102  carboxynorspermidine dehydrogenase putative  47.75 
 
 
414 aa  387  1e-106  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.185885  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02740  hypothetical protein  48.25 
 
 
417 aa  388  1e-106  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2289  saccharopine dehydrogenase  47.13 
 
 
405 aa  383  1e-105  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.772575  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2137  saccharopine dehydrogenase  46.88 
 
 
414 aa  378  1e-103  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0299628  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1231  hypothetical protein  47.38 
 
 
414 aa  375  1e-102  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00001292  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0208  saccharopine dehydrogenase  43.43 
 
 
401 aa  355  1e-96  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.69447  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1128  Saccharopine dehydrogenase  46.06 
 
 
399 aa  353  2.9999999999999997e-96  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.785881  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0165  saccharopine dehydrogenase  43.43 
 
 
401 aa  349  5e-95  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0186  saccharopine dehydrogenase  42.93 
 
 
401 aa  347  2e-94  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0458  saccharopine dehydrogenase  42.93 
 
 
401 aa  343  2.9999999999999997e-93  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1555  Saccharopine dehydrogenase  43.77 
 
 
401 aa  343  2.9999999999999997e-93  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000142738  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3052  saccharopine dehydrogenase  45.04 
 
 
399 aa  343  4e-93  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0061  saccharopine dehydrogenase  41.81 
 
 
403 aa  340  2e-92  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2320  Saccharopine dehydrogenase  42.53 
 
 
396 aa  340  2.9999999999999998e-92  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0747  saccharopine dehydrogenase  40.83 
 
 
403 aa  336  3.9999999999999995e-91  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  unclonable  0.0000418334  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2607  saccharopine dehydrogenase  41.54 
 
 
398 aa  336  3.9999999999999995e-91  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0902  saccharopine dehydrogenase  42.43 
 
 
397 aa  335  1e-90  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000168136 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0572  saccharopine dehydrogenase  41.27 
 
 
398 aa  334  2e-90  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1181  saccharopine dehydrogenase  42.04 
 
 
394 aa  333  3e-90  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.886294  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1676  Saccharopine dehydrogenase  41.69 
 
 
398 aa  332  6e-90  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0203222  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2539  saccharopine dehydrogenase  41.79 
 
 
398 aa  332  1e-89  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1790  saccharopine dehydrogenase  41.5 
 
 
401 aa  331  2e-89  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6504  Saccharopine dehydrogenase  43.14 
 
 
395 aa  330  3e-89  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.752719  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0748  saccharopine dehydrogenase  41.29 
 
 
400 aa  330  4e-89  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0999  saccharopine dehydrogenase  43.29 
 
 
405 aa  329  7e-89  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0445398  hitchhiker  0.00533099 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2095  saccharopine dehydrogenase-like protein  41.29 
 
 
399 aa  328  2.0000000000000001e-88  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0415  saccharopine dehydrogenase  40.63 
 
 
405 aa  325  1e-87  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2142  Saccharopine dehydrogenase  40.34 
 
 
404 aa  320  1.9999999999999998e-86  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1922  saccharopine dehydrogenase  42.42 
 
 
392 aa  320  3.9999999999999996e-86  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00339893 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3519  Saccharopine dehydrogenase  41.5 
 
 
405 aa  320  3.9999999999999996e-86  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.368548  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG0677  saccharopine dehydrogenase  41.37 
 
 
397 aa  318  1e-85  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.10466 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1535  Saccharopine dehydrogenase  40.8 
 
 
396 aa  317  2e-85  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.82797 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2888  Saccharopine dehydrogenase  42.03 
 
 
403 aa  317  3e-85  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.120454 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0148  Saccharopine dehydrogenase  40.51 
 
 
409 aa  315  7e-85  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0285  saccharopine dehydrogenase  39.41 
 
 
404 aa  313  3.9999999999999997e-84  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1307  Saccharopine dehydrogenase  41.79 
 
 
399 aa  312  5.999999999999999e-84  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000784986 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1081  saccharopine dehydrogenase  40.29 
 
 
399 aa  312  7.999999999999999e-84  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.706576  normal  0.0928318 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1201  saccharopine dehydrogenase  39.4 
 
 
402 aa  311  1e-83  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.150944  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1597  Acyl carrier protein (ACP)  40.9 
 
 
399 aa  310  4e-83  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.30891  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2918  Saccharopine dehydrogenase  42.29 
 
 
398 aa  308  1.0000000000000001e-82  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03351  Carboxynorspermidine dehydrogenase  39.5 
 
 
400 aa  308  1.0000000000000001e-82  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  decreased coverage  0.00142848  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4440  saccharopine dehydrogenase  39.5 
 
 
401 aa  308  1.0000000000000001e-82  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2516  saccharopine dehydrogenase  40.15 
 
 
396 aa  304  2.0000000000000002e-81  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.558897  normal  0.297438 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0981  saccharopine dehydrogenase  40.55 
 
 
398 aa  300  2e-80  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0620633  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0125  Saccharopine dehydrogenase  40.85 
 
 
403 aa  300  4e-80  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1950  hypothetical protein  28.75 
 
 
408 aa  164  2.0000000000000002e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.275408  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4677  Saccharopine dehydrogenase  30.09 
 
 
401 aa  157  4e-37  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3295  Saccharopine dehydrogenase  27.06 
 
 
403 aa  146  7.0000000000000006e-34  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.886794  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3221  saccharopine dehydrogenase  25.6 
 
 
407 aa  136  7.000000000000001e-31  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4946  saccharopine dehydrogenase  23.97 
 
 
407 aa  128  2.0000000000000002e-28  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5034  saccharopine dehydrogenase  23.97 
 
 
407 aa  128  2.0000000000000002e-28  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5327  saccharopine dehydrogenase  23.97 
 
 
407 aa  127  3e-28  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0356987  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2976  saccharopine dehydrogenase  25.42 
 
 
415 aa  89.7  9e-17  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.809568  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1835  Saccharopine dehydrogenase  21.41 
 
 
398 aa  67.8  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.257501  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3651  Saccharopine dehydrogenase  27.78 
 
 
367 aa  48.5  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1202  saccharopine dehydrogenase  20 
 
 
403 aa  48.9  0.0002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4315  saccharopine dehydrogenase  29.07 
 
 
378 aa  47.4  0.0005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.224112  normal  0.228939 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4394  saccharopine dehydrogenase  26.18 
 
 
384 aa  45.1  0.003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000130212 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1495  Saccharopine dehydrogenase  24.61 
 
 
376 aa  43.9  0.005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.0000691069  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5058  saccharopine dehydrogenase  25.34 
 
 
369 aa  43.9  0.005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>