100 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sdel_2142 on replicon NC_013512
Organism: Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009714  CHAB381_0061  saccharopine dehydrogenase  73.45 
 
 
403 aa  637    Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0208  saccharopine dehydrogenase  77.58 
 
 
401 aa  669    Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.69447  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0415  saccharopine dehydrogenase  76.85 
 
 
405 aa  663    Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0165  saccharopine dehydrogenase  77.08 
 
 
401 aa  663    Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2142  Saccharopine dehydrogenase  100 
 
 
404 aa  843    Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0186  saccharopine dehydrogenase  76.83 
 
 
401 aa  659    Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0458  saccharopine dehydrogenase  77.08 
 
 
401 aa  666    Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0747  saccharopine dehydrogenase  77.67 
 
 
403 aa  671    Campylobacter concisus 13826  Bacteria  unclonable  0.0000418334  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0285  saccharopine dehydrogenase  73.76 
 
 
404 aa  650    Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1181  saccharopine dehydrogenase  72.22 
 
 
394 aa  615  1e-175  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.886294  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2516  saccharopine dehydrogenase  68.86 
 
 
396 aa  572  1.0000000000000001e-162  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.558897  normal  0.297438 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2320  Saccharopine dehydrogenase  66.16 
 
 
396 aa  567  1e-160  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1535  Saccharopine dehydrogenase  67.09 
 
 
396 aa  560  1e-158  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.82797 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3052  saccharopine dehydrogenase  64.45 
 
 
399 aa  543  1e-153  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0572  saccharopine dehydrogenase  63.22 
 
 
398 aa  542  1e-153  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1128  Saccharopine dehydrogenase  62.4 
 
 
399 aa  534  1e-150  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.785881  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6504  Saccharopine dehydrogenase  63.29 
 
 
395 aa  526  1e-148  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.752719  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1555  Saccharopine dehydrogenase  60.36 
 
 
401 aa  521  1e-147  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000142738  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1790  saccharopine dehydrogenase  60 
 
 
401 aa  519  1e-146  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0677  saccharopine dehydrogenase  60.26 
 
 
397 aa  511  1e-144  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.10466 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3519  Saccharopine dehydrogenase  61.44 
 
 
405 aa  511  1e-144  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.368548  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2607  saccharopine dehydrogenase  60.51 
 
 
398 aa  509  1e-143  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1922  saccharopine dehydrogenase  61.79 
 
 
392 aa  508  1e-143  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00339893 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2539  saccharopine dehydrogenase  60.25 
 
 
398 aa  506  9.999999999999999e-143  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4440  saccharopine dehydrogenase  63.29 
 
 
401 aa  507  9.999999999999999e-143  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2095  saccharopine dehydrogenase-like protein  61.01 
 
 
399 aa  506  9.999999999999999e-143  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2888  Saccharopine dehydrogenase  60.36 
 
 
403 aa  503  1e-141  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.120454 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1201  saccharopine dehydrogenase  58.84 
 
 
402 aa  500  1e-140  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.150944  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1081  saccharopine dehydrogenase  58.19 
 
 
399 aa  498  1e-140  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.706576  normal  0.0928318 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0125  Saccharopine dehydrogenase  60.65 
 
 
403 aa  500  1e-140  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1597  Acyl carrier protein (ACP)  59.09 
 
 
399 aa  498  1e-140  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.30891  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0902  saccharopine dehydrogenase  59.49 
 
 
397 aa  496  1e-139  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000168136 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03351  Carboxynorspermidine dehydrogenase  59.9 
 
 
400 aa  492  9.999999999999999e-139  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  decreased coverage  0.00142848  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0748  saccharopine dehydrogenase  59.14 
 
 
400 aa  488  1e-137  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1676  Saccharopine dehydrogenase  58.48 
 
 
398 aa  490  1e-137  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0203222  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0148  Saccharopine dehydrogenase  55.8 
 
 
409 aa  488  1e-137  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1307  Saccharopine dehydrogenase  58.23 
 
 
399 aa  482  1e-135  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000784986 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2918  Saccharopine dehydrogenase  57.72 
 
 
398 aa  472  1e-132  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0999  saccharopine dehydrogenase  56.74 
 
 
405 aa  470  1.0000000000000001e-131  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0445398  hitchhiker  0.00533099 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0981  saccharopine dehydrogenase  57.97 
 
 
398 aa  467  9.999999999999999e-131  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0620633  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02740  hypothetical protein  44.36 
 
 
417 aa  354  1e-96  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003102  carboxynorspermidine dehydrogenase putative  43.95 
 
 
414 aa  353  2e-96  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.185885  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2137  saccharopine dehydrogenase  41.99 
 
 
414 aa  343  4e-93  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0299628  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1231  hypothetical protein  42.93 
 
 
414 aa  341  1e-92  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00001292  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1380  saccharopine dehydrogenase  42.89 
 
 
412 aa  340  4e-92  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  decreased coverage  0.000104449  normal  0.291708 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2289  saccharopine dehydrogenase  43.92 
 
 
405 aa  337  2.9999999999999997e-91  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.772575  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0028  saccharopine dehydrogenase  40.34 
 
 
412 aa  321  9.999999999999999e-87  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2764  saccharopine dehydrogenase  40.63 
 
 
414 aa  322  9.999999999999999e-87  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.114818  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2928  saccharopine dehydrogenase  40.63 
 
 
414 aa  322  9.999999999999999e-87  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4157  saccharopine dehydrogenase  41.6 
 
 
413 aa  320  3e-86  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.152115  normal  0.83779 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0352  hypothetical protein  41.6 
 
 
413 aa  319  7e-86  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0988  saccharopine dehydrogenase  41.35 
 
 
413 aa  318  7e-86  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000577497 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5844  hypothetical protein  41.6 
 
 
413 aa  316  5e-85  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0335  hypothetical protein  41.35 
 
 
413 aa  315  9.999999999999999e-85  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0438  saccharopine dehydrogenase  40.6 
 
 
426 aa  313  3.9999999999999997e-84  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0417875  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2884  saccharopine dehydrogenase  39.95 
 
 
412 aa  309  5e-83  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2955  saccharopine dehydrogenase  40.81 
 
 
407 aa  306  5.0000000000000004e-82  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1715  saccharopine dehydrogenase  40.49 
 
 
422 aa  306  5.0000000000000004e-82  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  unclonable  0.000000000659439  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2125  saccharopine dehydrogenase  39.6 
 
 
399 aa  304  1.0000000000000001e-81  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.530272  normal  0.238501 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2844  saccharopine dehydrogenase  39.35 
 
 
399 aa  303  4.0000000000000003e-81  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.241943 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1501  saccharopine dehydrogenase  38.39 
 
 
424 aa  301  1e-80  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0914  putative saccharopine dehydrogenase family protein  38.39 
 
 
424 aa  301  1e-80  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.867111  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0126  saccharopine dehydrogenase  39.61 
 
 
412 aa  299  5e-80  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.281282 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1475  saccharopine dehydrogenase family protein  39.61 
 
 
412 aa  299  5e-80  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1950  hypothetical protein  33.75 
 
 
408 aa  209  6e-53  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.275408  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3295  Saccharopine dehydrogenase  31.32 
 
 
403 aa  192  1e-47  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.886794  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5327  saccharopine dehydrogenase  31.14 
 
 
407 aa  184  3e-45  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0356987  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5034  saccharopine dehydrogenase  30.9 
 
 
407 aa  182  1e-44  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4946  saccharopine dehydrogenase  30.9 
 
 
407 aa  182  1e-44  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3221  saccharopine dehydrogenase  30.75 
 
 
407 aa  177  4e-43  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4677  Saccharopine dehydrogenase  30.95 
 
 
401 aa  166  5.9999999999999996e-40  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1835  Saccharopine dehydrogenase  24.44 
 
 
398 aa  102  1e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.257501  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2976  saccharopine dehydrogenase  25.32 
 
 
415 aa  84  0.000000000000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.809568  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1202  saccharopine dehydrogenase  24.58 
 
 
403 aa  63.2  0.000000008  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1424  potassium efflux system protein  27.49 
 
 
371 aa  57.4  0.0000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1242  saccharopine dehydrogenase  23.34 
 
 
394 aa  57.8  0.0000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1441  hypothetical protein  24.04 
 
 
394 aa  57.4  0.0000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1495  Saccharopine dehydrogenase  26.82 
 
 
376 aa  57.4  0.0000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.0000691069  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3651  Saccharopine dehydrogenase  23.32 
 
 
367 aa  56.2  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3399  Saccharopine dehydrogenase  22.68 
 
 
350 aa  55.1  0.000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00148167  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1219  saccharopine dehydrogenase, NADP+, L-lysine forming; L-lysine dehydrogenase  23.78 
 
 
394 aa  54.7  0.000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.182404  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1241  hypothetical protein  24.14 
 
 
394 aa  54.7  0.000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5762  Saccharopine dehydrogenase  29.45 
 
 
355 aa  54.3  0.000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.353531 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2027  saccharopine dehydrogenase  28.81 
 
 
351 aa  54.7  0.000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0488088  normal  0.664425 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1217  saccharopine dehydrogenase, NADP+, L-lysine forming; L-lysine dehydrogenase  24.14 
 
 
394 aa  54.7  0.000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1342  hypothetical protein  24.14 
 
 
394 aa  54.7  0.000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1416  hypothetical protein  24.14 
 
 
394 aa  54.7  0.000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.572078 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1482  hypothetical protein  23.69 
 
 
394 aa  53.9  0.000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4315  saccharopine dehydrogenase  26.32 
 
 
378 aa  53.5  0.000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.224112  normal  0.228939 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1836  Saccharopine dehydrogenase  23.34 
 
 
387 aa  50.4  0.00005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.973025 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1941  Saccharopine dehydrogenase  25 
 
 
446 aa  50.4  0.00005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3965  hypothetical protein  22.96 
 
 
394 aa  48.9  0.0001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006692  CNG01150  spermidine synthase, putative  18.75 
 
 
748 aa  49.7  0.0001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1379  hypothetical protein  23.44 
 
 
394 aa  48.9  0.0002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1149  hypothetical protein  26.44 
 
 
351 aa  45.1  0.002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4394  saccharopine dehydrogenase  23.18 
 
 
384 aa  45.1  0.002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000130212 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1054  hypothetical protein  26.44 
 
 
351 aa  45.1  0.002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.380877  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5058  saccharopine dehydrogenase  23.1 
 
 
369 aa  43.9  0.005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4779  saccharopine dehydrogenase  25.85 
 
 
553 aa  43.5  0.007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001157  putative integral membrane protein  24.19 
 
 
360 aa  43.1  0.008  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>