105 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DvMF_1535 on replicon NC_011769
Organism: Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007519  Dde_0572  saccharopine dehydrogenase  80.82 
 
 
398 aa  686    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2516  saccharopine dehydrogenase  90.15 
 
 
396 aa  746    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.558897  normal  0.297438 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1535  Saccharopine dehydrogenase  100 
 
 
396 aa  828    Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.82797 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0125  Saccharopine dehydrogenase  78.89 
 
 
403 aa  635    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2320  Saccharopine dehydrogenase  80 
 
 
396 aa  694    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2607  saccharopine dehydrogenase  71.65 
 
 
398 aa  604  9.999999999999999e-173  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1597  Acyl carrier protein (ACP)  71.9 
 
 
399 aa  598  1e-170  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.30891  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2539  saccharopine dehydrogenase  70.38 
 
 
398 aa  588  1e-167  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2095  saccharopine dehydrogenase-like protein  69.37 
 
 
399 aa  588  1e-167  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0902  saccharopine dehydrogenase  70.89 
 
 
397 aa  588  1e-167  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000168136 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1128  Saccharopine dehydrogenase  68.03 
 
 
399 aa  585  1e-166  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.785881  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6504  Saccharopine dehydrogenase  70.84 
 
 
395 aa  586  1e-166  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.752719  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3052  saccharopine dehydrogenase  69.64 
 
 
399 aa  582  1.0000000000000001e-165  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1555  Saccharopine dehydrogenase  67.01 
 
 
401 aa  582  1.0000000000000001e-165  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000142738  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1676  Saccharopine dehydrogenase  69.37 
 
 
398 aa  580  1e-164  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0203222  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0148  Saccharopine dehydrogenase  66.58 
 
 
409 aa  570  1e-161  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0747  saccharopine dehydrogenase  66.08 
 
 
403 aa  565  1e-160  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  unclonable  0.0000418334  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1307  Saccharopine dehydrogenase  68.61 
 
 
399 aa  565  1e-160  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000784986 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1790  saccharopine dehydrogenase  66.33 
 
 
401 aa  563  1.0000000000000001e-159  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2918  Saccharopine dehydrogenase  68.86 
 
 
398 aa  562  1.0000000000000001e-159  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1922  saccharopine dehydrogenase  67.6 
 
 
392 aa  560  1e-158  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00339893 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2142  Saccharopine dehydrogenase  67.09 
 
 
404 aa  558  1e-158  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1201  saccharopine dehydrogenase  66.41 
 
 
402 aa  556  1e-157  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.150944  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0981  saccharopine dehydrogenase  68.61 
 
 
398 aa  552  1e-156  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0620633  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0415  saccharopine dehydrogenase  65.15 
 
 
405 aa  552  1e-156  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2888  Saccharopine dehydrogenase  66.33 
 
 
403 aa  553  1e-156  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.120454 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4440  saccharopine dehydrogenase  67.43 
 
 
401 aa  551  1e-155  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0748  saccharopine dehydrogenase  64.81 
 
 
400 aa  546  1e-154  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0061  saccharopine dehydrogenase  63.04 
 
 
403 aa  547  1e-154  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0285  saccharopine dehydrogenase  62.78 
 
 
404 aa  542  1e-153  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03351  Carboxynorspermidine dehydrogenase  64.56 
 
 
400 aa  542  1e-153  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  decreased coverage  0.00142848  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0458  saccharopine dehydrogenase  62.28 
 
 
401 aa  543  1e-153  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0999  saccharopine dehydrogenase  63.71 
 
 
405 aa  536  1e-151  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0445398  hitchhiker  0.00533099 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0208  saccharopine dehydrogenase  61.77 
 
 
401 aa  536  1e-151  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.69447  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3519  Saccharopine dehydrogenase  65.38 
 
 
405 aa  537  1e-151  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.368548  normal 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0165  saccharopine dehydrogenase  61.52 
 
 
401 aa  534  1e-150  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1081  saccharopine dehydrogenase  63.54 
 
 
399 aa  533  1e-150  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.706576  normal  0.0928318 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0186  saccharopine dehydrogenase  61.27 
 
 
401 aa  531  1e-150  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0677  saccharopine dehydrogenase  61.13 
 
 
397 aa  527  1e-148  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.10466 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1181  saccharopine dehydrogenase  60.76 
 
 
394 aa  519  1e-146  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.886294  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003102  carboxynorspermidine dehydrogenase putative  46.02 
 
 
414 aa  375  1e-103  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.185885  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02740  hypothetical protein  46.27 
 
 
417 aa  373  1e-102  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2289  saccharopine dehydrogenase  45.16 
 
 
405 aa  358  9.999999999999999e-98  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.772575  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1231  hypothetical protein  43.78 
 
 
414 aa  355  5.999999999999999e-97  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00001292  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2137  saccharopine dehydrogenase  43.03 
 
 
414 aa  354  1e-96  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0299628  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5844  hypothetical protein  43.83 
 
 
413 aa  337  2.9999999999999997e-91  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2884  saccharopine dehydrogenase  43.5 
 
 
412 aa  330  2e-89  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1380  saccharopine dehydrogenase  42.07 
 
 
412 aa  328  1.0000000000000001e-88  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  decreased coverage  0.000104449  normal  0.291708 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0352  hypothetical protein  42.32 
 
 
413 aa  325  6e-88  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1475  saccharopine dehydrogenase family protein  43.22 
 
 
412 aa  323  3e-87  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0126  saccharopine dehydrogenase  43.22 
 
 
412 aa  323  3e-87  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.281282 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4157  saccharopine dehydrogenase  41.67 
 
 
413 aa  323  4e-87  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.152115  normal  0.83779 
 
 
-
 
NC_004310  BR0335  hypothetical protein  42.07 
 
 
413 aa  322  9.999999999999999e-87  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0028  saccharopine dehydrogenase  40.8 
 
 
412 aa  320  1.9999999999999998e-86  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0438  saccharopine dehydrogenase  41.31 
 
 
426 aa  319  3.9999999999999996e-86  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0417875  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2928  saccharopine dehydrogenase  40.3 
 
 
414 aa  313  3.9999999999999997e-84  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2764  saccharopine dehydrogenase  40.3 
 
 
414 aa  313  3.9999999999999997e-84  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.114818  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0988  saccharopine dehydrogenase  40.55 
 
 
413 aa  311  1e-83  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000577497 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1715  saccharopine dehydrogenase  41.1 
 
 
422 aa  304  2.0000000000000002e-81  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  unclonable  0.000000000659439  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0914  putative saccharopine dehydrogenase family protein  40.45 
 
 
424 aa  303  3.0000000000000004e-81  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.867111  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1501  saccharopine dehydrogenase  40.45 
 
 
424 aa  302  7.000000000000001e-81  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2955  saccharopine dehydrogenase  40.9 
 
 
407 aa  298  1e-79  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2844  saccharopine dehydrogenase  38.96 
 
 
399 aa  296  5e-79  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.241943 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2125  saccharopine dehydrogenase  38.96 
 
 
399 aa  296  6e-79  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.530272  normal  0.238501 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1950  hypothetical protein  34.25 
 
 
408 aa  221  9.999999999999999e-57  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.275408  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3221  saccharopine dehydrogenase  32.28 
 
 
407 aa  201  3e-50  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3295  Saccharopine dehydrogenase  33.59 
 
 
403 aa  197  2.0000000000000003e-49  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.886794  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4946  saccharopine dehydrogenase  32.03 
 
 
407 aa  194  2e-48  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5034  saccharopine dehydrogenase  32.03 
 
 
407 aa  194  2e-48  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5327  saccharopine dehydrogenase  31.78 
 
 
407 aa  192  1e-47  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0356987  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4677  Saccharopine dehydrogenase  33.71 
 
 
401 aa  189  9e-47  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1835  Saccharopine dehydrogenase  23.86 
 
 
398 aa  108  2e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.257501  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2976  saccharopine dehydrogenase  24.29 
 
 
415 aa  95.9  1e-18  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.809568  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1202  saccharopine dehydrogenase  23.38 
 
 
403 aa  67.4  0.0000000004  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3651  Saccharopine dehydrogenase  23.25 
 
 
367 aa  67  0.0000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1254  Saccharopine dehydrogenase  25.37 
 
 
385 aa  67  0.0000000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3399  Saccharopine dehydrogenase  24.35 
 
 
350 aa  64.3  0.000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00148167  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2611  Saccharopine dehydrogenase  21.5 
 
 
413 aa  63.9  0.000000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1941  Saccharopine dehydrogenase  26.01 
 
 
446 aa  63.5  0.000000007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4315  saccharopine dehydrogenase  24.83 
 
 
378 aa  62.8  0.00000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.224112  normal  0.228939 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1495  Saccharopine dehydrogenase  27.51 
 
 
376 aa  57.4  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.0000691069  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001157  putative integral membrane protein  25.78 
 
 
360 aa  54.3  0.000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_34724  predicted protein  23.39 
 
 
454 aa  53.9  0.000005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0227294  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2027  saccharopine dehydrogenase  28.81 
 
 
351 aa  53.1  0.000008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0488088  normal  0.664425 
 
 
-
 
NC_006692  CNG01150  spermidine synthase, putative  21.36 
 
 
748 aa  50.8  0.00004  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4394  saccharopine dehydrogenase  22.81 
 
 
384 aa  50.8  0.00004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000130212 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0384  Saccharopine dehydrogenase  22.71 
 
 
384 aa  50.8  0.00004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0854083  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1219  saccharopine dehydrogenase, NADP+, L-lysine forming; L-lysine dehydrogenase  21.3 
 
 
394 aa  50.4  0.00005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.182404  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2986  saccharopine dehydrogenase  37.63 
 
 
365 aa  49.7  0.00008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0188424  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5058  saccharopine dehydrogenase  21.27 
 
 
369 aa  48.9  0.0001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1441  hypothetical protein  20.49 
 
 
394 aa  48.1  0.0002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3185  Saccharopine dehydrogenase  37.63 
 
 
352 aa  48.1  0.0002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.418477  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1241  hypothetical protein  19.88 
 
 
394 aa  48.1  0.0003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1217  saccharopine dehydrogenase, NADP+, L-lysine forming; L-lysine dehydrogenase  19.88 
 
 
394 aa  48.1  0.0003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1342  hypothetical protein  19.88 
 
 
394 aa  48.1  0.0003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3084  Saccharopine dehydrogenase  37.63 
 
 
352 aa  48.1  0.0003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.413976  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1416  hypothetical protein  19.88 
 
 
394 aa  48.1  0.0003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.572078 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1482  hypothetical protein  20.22 
 
 
394 aa  46.6  0.0008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1242  saccharopine dehydrogenase  21.35 
 
 
394 aa  45.8  0.001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1424  potassium efflux system protein  30.63 
 
 
371 aa  45.4  0.002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>