82 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pput_2764 on replicon NC_009512
Organism: Pseudomonas putida F1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_2928  saccharopine dehydrogenase  100 
 
 		 414 aa  857    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2125  saccharopine dehydrogenase  99.5 
 
 		 399 aa  825    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.530272  normal  0.238501 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2844  saccharopine dehydrogenase  99.5 
 
 		 399 aa  826    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.241943 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0438  saccharopine dehydrogenase  75.18 
 
 		 426 aa  651    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0417875  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1380  saccharopine dehydrogenase  78.05 
 
 		 412 aa  673    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  decreased coverage  0.000104449  normal  0.291708 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4157  saccharopine dehydrogenase  74.57 
 
 		 413 aa  652    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.152115  normal  0.83779 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2764  saccharopine dehydrogenase  100 
 
 		 414 aa  857    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.114818  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0352  hypothetical protein  76.16 
 
 		 413 aa  660    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0988  saccharopine dehydrogenase  92.46 
 
 		 413 aa  798    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000577497 
 
 
-
 
NC_004310  BR0335  hypothetical protein  76.16 
 
 		 413 aa  661    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5844  hypothetical protein  71.78 
 
 		 413 aa  628  1e-179  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2884  saccharopine dehydrogenase  71.78 
 
 		 412 aa  626  1e-178  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1475  saccharopine dehydrogenase family protein  71.81 
 
 		 412 aa  612  9.999999999999999e-175  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1715  saccharopine dehydrogenase  71.64 
 
 		 422 aa  613  9.999999999999999e-175  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  unclonable  0.000000000659439  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0914  putative saccharopine dehydrogenase family protein  71.32 
 
 		 424 aa  611  9.999999999999999e-175  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.867111  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0126  saccharopine dehydrogenase  71.81 
 
 		 412 aa  612  9.999999999999999e-175  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.281282 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1501  saccharopine dehydrogenase  71.32 
 
 		 424 aa  610  1e-173  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0028  saccharopine dehydrogenase  70.83 
 
 		 412 aa  598  1e-170  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2955  saccharopine dehydrogenase  70.66 
 
 		 407 aa  592  1e-168  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2289  saccharopine dehydrogenase  47.03 
 
 		 405 aa  379  1e-104  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.772575  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003102  carboxynorspermidine dehydrogenase putative  46.06 
 
 		 414 aa  375  1e-103  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.185885  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02740  hypothetical protein  47.25 
 
 		 417 aa  375  1e-103  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2137  saccharopine dehydrogenase  45.45 
 
 		 414 aa  372  1e-102  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0299628  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1231  hypothetical protein  44.47 
 
 		 414 aa  357  2.9999999999999997e-97  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00001292  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1128  Saccharopine dehydrogenase  44.67 
 
 		 399 aa  346  5e-94  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.785881  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1555  Saccharopine dehydrogenase  43.43 
 
 		 401 aa  343  4e-93  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000142738  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2320  Saccharopine dehydrogenase  43.14 
 
 		 396 aa  338  9.999999999999999e-92  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1181  saccharopine dehydrogenase  41.29 
 
 		 394 aa  333  2e-90  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.886294  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0208  saccharopine dehydrogenase  41.5 
 
 		 401 aa  333  3e-90  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.69447  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0902  saccharopine dehydrogenase  43.18 
 
 		 397 aa  333  4e-90  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000168136 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0165  saccharopine dehydrogenase  41.5 
 
 		 401 aa  332  7.000000000000001e-90  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2607  saccharopine dehydrogenase  41.77 
 
 		 398 aa  331  1e-89  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0186  saccharopine dehydrogenase  41 
 
 		 401 aa  330  3e-89  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2095  saccharopine dehydrogenase-like protein  41.79 
 
 		 399 aa  328  9e-89  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1676  Saccharopine dehydrogenase  41.79 
 
 		 398 aa  327  2.0000000000000001e-88  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0203222  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6504  Saccharopine dehydrogenase  43.64 
 
 		 395 aa  327  3e-88  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.752719  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2539  saccharopine dehydrogenase  42.18 
 
 		 398 aa  327  3e-88  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1922  saccharopine dehydrogenase  42.71 
 
 		 392 aa  327  3e-88  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00339893 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0458  saccharopine dehydrogenase  40.25 
 
 		 401 aa  325  7e-88  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3052  saccharopine dehydrogenase  42.89 
 
 		 399 aa  324  2e-87  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0572  saccharopine dehydrogenase  40.66 
 
 		 398 aa  323  2e-87  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1790  saccharopine dehydrogenase  40.94 
 
 		 401 aa  323  3e-87  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0747  saccharopine dehydrogenase  40.29 
 
 		 403 aa  321  1.9999999999999998e-86  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  unclonable  0.0000418334  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0061  saccharopine dehydrogenase  40.29 
 
 		 403 aa  320  3e-86  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0415  saccharopine dehydrogenase  39.71 
 
 		 405 aa  317  2e-85  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0148  Saccharopine dehydrogenase  41.46 
 
 		 409 aa  317  4e-85  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1201  saccharopine dehydrogenase  40.59 
 
 		 402 aa  316  5e-85  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.150944  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1597  Acyl carrier protein (ACP)  41.35 
 
 		 399 aa  314  1.9999999999999998e-84  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.30891  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2142  Saccharopine dehydrogenase  40.63 
 
 		 404 aa  312  9e-84  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0999  saccharopine dehydrogenase  40.1 
 
 		 405 aa  310  2.9999999999999997e-83  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0445398  hitchhiker  0.00533099 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1307  Saccharopine dehydrogenase  41.9 
 
 		 399 aa  309  5e-83  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000784986 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4440  saccharopine dehydrogenase  40.69 
 
 		 401 aa  308  1.0000000000000001e-82  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0981  saccharopine dehydrogenase  41.65 
 
 		 398 aa  307  2.0000000000000002e-82  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0620633  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2888  Saccharopine dehydrogenase  39.65 
 
 		 403 aa  305  1.0000000000000001e-81  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.120454 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3519  Saccharopine dehydrogenase  39.95 
 
 		 405 aa  305  1.0000000000000001e-81  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.368548  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2918  Saccharopine dehydrogenase  41.9 
 
 		 398 aa  304  2.0000000000000002e-81  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0748  saccharopine dehydrogenase  39.85 
 
 		 400 aa  303  3.0000000000000004e-81  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03351  Carboxynorspermidine dehydrogenase  40.9 
 
 		 400 aa  303  3.0000000000000004e-81  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  decreased coverage  0.00142848  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0677  saccharopine dehydrogenase  39.75 
 
 		 397 aa  303  3.0000000000000004e-81  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.10466 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1535  Saccharopine dehydrogenase  40.3 
 
 		 396 aa  301  1e-80  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.82797 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0125  Saccharopine dehydrogenase  40.44 
 
 		 403 aa  300  2e-80  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1081  saccharopine dehydrogenase  39.51 
 
 		 399 aa  300  3e-80  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.706576  normal  0.0928318 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0285  saccharopine dehydrogenase  37.47 
 
 		 404 aa  300  4e-80  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2516  saccharopine dehydrogenase  39.9 
 
 		 396 aa  297  2e-79  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.558897  normal  0.297438 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1950  hypothetical protein  30.73 
 
 		 408 aa  175  9.999999999999999e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.275408  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3295  Saccharopine dehydrogenase  28.97 
 
 		 403 aa  160  3e-38  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.886794  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4677  Saccharopine dehydrogenase  30.86 
 
 		 401 aa  156  6e-37  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3221  saccharopine dehydrogenase  28.23 
 
 		 407 aa  145  2e-33  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4946  saccharopine dehydrogenase  27.75 
 
 		 407 aa  140  4.999999999999999e-32  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5034  saccharopine dehydrogenase  27.75 
 
 		 407 aa  140  4.999999999999999e-32  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5327  saccharopine dehydrogenase  27.75 
 
 		 407 aa  140  6e-32  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0356987  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2976  saccharopine dehydrogenase  23.78 
 
 		 415 aa  84.3  0.000000000000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.809568  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1835  Saccharopine dehydrogenase  21.72 
 
 		 398 aa  73.6  0.000000000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.257501  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3651  Saccharopine dehydrogenase  22.48 
 
 		 367 aa  55.8  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4394  saccharopine dehydrogenase  27.66 
 
 		 384 aa  53.1  0.00001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000130212 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1202  saccharopine dehydrogenase  21.31 
 
 		 403 aa  49.3  0.0001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4315  saccharopine dehydrogenase  24.17 
 
 		 378 aa  48.5  0.0002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.224112  normal  0.228939 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5058  saccharopine dehydrogenase  25.11 
 
 		 369 aa  45.1  0.002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1424  potassium efflux system protein  33.04 
 
 		 371 aa  45.8  0.002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4609  hypothetical protein  25.81 
 
 		 392 aa  45.4  0.002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.856643  normal  0.0914614 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1495  Saccharopine dehydrogenase  25.53 
 
 		 376 aa  44.7  0.003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.0000691069  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4278  saccharopine dehydrogenase  25.83 
 
 		 388 aa  44.3  0.004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.961267 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>