91 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dbac_2320 on replicon NC_013173
Organism: Desulfomicrobium baculatum DSM 4028



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008751  Dvul_2516  saccharopine dehydrogenase  84.05 
 
 
396 aa  699    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.558897  normal  0.297438 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1535  Saccharopine dehydrogenase  80 
 
 
396 aa  680    Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.82797 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0572  saccharopine dehydrogenase  79.29 
 
 
398 aa  675    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2320  Saccharopine dehydrogenase  100 
 
 
396 aa  830    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0125  Saccharopine dehydrogenase  72.68 
 
 
403 aa  604  9.999999999999999e-173  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2095  saccharopine dehydrogenase-like protein  71.9 
 
 
399 aa  601  1.0000000000000001e-171  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1597  Acyl carrier protein (ACP)  72.73 
 
 
399 aa  600  1e-170  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.30891  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2607  saccharopine dehydrogenase  70.38 
 
 
398 aa  599  1e-170  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2539  saccharopine dehydrogenase  70.89 
 
 
398 aa  595  1e-169  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6504  Saccharopine dehydrogenase  71.21 
 
 
395 aa  596  1e-169  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.752719  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0902  saccharopine dehydrogenase  69.87 
 
 
397 aa  585  1e-166  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000168136 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1307  Saccharopine dehydrogenase  71.39 
 
 
399 aa  581  1.0000000000000001e-165  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000784986 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1676  Saccharopine dehydrogenase  69.37 
 
 
398 aa  583  1.0000000000000001e-165  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0203222  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1128  Saccharopine dehydrogenase  68.8 
 
 
399 aa  580  1e-164  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.785881  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2888  Saccharopine dehydrogenase  69.9 
 
 
403 aa  576  1.0000000000000001e-163  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.120454 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2918  Saccharopine dehydrogenase  70.63 
 
 
398 aa  573  1.0000000000000001e-162  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1555  Saccharopine dehydrogenase  67.26 
 
 
401 aa  573  1.0000000000000001e-162  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000142738  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0148  Saccharopine dehydrogenase  66.67 
 
 
409 aa  573  1.0000000000000001e-162  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1922  saccharopine dehydrogenase  68.62 
 
 
392 aa  568  1e-161  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00339893 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3052  saccharopine dehydrogenase  67.09 
 
 
399 aa  566  1e-160  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1790  saccharopine dehydrogenase  66.41 
 
 
401 aa  566  1e-160  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0747  saccharopine dehydrogenase  64.65 
 
 
403 aa  558  1e-158  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  unclonable  0.0000418334  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0981  saccharopine dehydrogenase  68.86 
 
 
398 aa  559  1e-158  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0620633  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4440  saccharopine dehydrogenase  67.42 
 
 
401 aa  553  1e-156  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1201  saccharopine dehydrogenase  65.49 
 
 
402 aa  552  1e-156  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.150944  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2142  Saccharopine dehydrogenase  66.16 
 
 
404 aa  552  1e-156  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0748  saccharopine dehydrogenase  66.58 
 
 
400 aa  552  1e-156  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0677  saccharopine dehydrogenase  65.47 
 
 
397 aa  551  1e-156  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.10466 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0208  saccharopine dehydrogenase  62.63 
 
 
401 aa  551  1e-156  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.69447  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0458  saccharopine dehydrogenase  62.63 
 
 
401 aa  553  1e-156  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0165  saccharopine dehydrogenase  62.37 
 
 
401 aa  550  1e-155  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03351  Carboxynorspermidine dehydrogenase  66.33 
 
 
400 aa  550  1e-155  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  decreased coverage  0.00142848  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0415  saccharopine dehydrogenase  63.48 
 
 
405 aa  545  1e-154  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0186  saccharopine dehydrogenase  62.12 
 
 
401 aa  547  1e-154  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3519  Saccharopine dehydrogenase  66.15 
 
 
405 aa  543  1e-153  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.368548  normal 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0061  saccharopine dehydrogenase  61.87 
 
 
403 aa  543  1e-153  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0285  saccharopine dehydrogenase  61.87 
 
 
404 aa  534  1e-150  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0999  saccharopine dehydrogenase  62.94 
 
 
405 aa  530  1e-149  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0445398  hitchhiker  0.00533099 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1181  saccharopine dehydrogenase  61.11 
 
 
394 aa  524  1e-147  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.886294  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1081  saccharopine dehydrogenase  61.87 
 
 
399 aa  518  1e-146  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.706576  normal  0.0928318 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02740  hypothetical protein  47.39 
 
 
417 aa  375  1e-103  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003102  carboxynorspermidine dehydrogenase putative  46.9 
 
 
414 aa  374  1e-102  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.185885  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1231  hypothetical protein  45.66 
 
 
414 aa  360  3e-98  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00001292  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2289  saccharopine dehydrogenase  45.79 
 
 
405 aa  358  9e-98  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.772575  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2137  saccharopine dehydrogenase  44.67 
 
 
414 aa  357  1.9999999999999998e-97  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0299628  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1380  saccharopine dehydrogenase  45.41 
 
 
412 aa  356  5e-97  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  decreased coverage  0.000104449  normal  0.291708 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5844  hypothetical protein  45.64 
 
 
413 aa  353  2e-96  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4157  saccharopine dehydrogenase  44.64 
 
 
413 aa  347  2e-94  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.152115  normal  0.83779 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0352  hypothetical protein  43.64 
 
 
413 aa  338  7e-92  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2928  saccharopine dehydrogenase  43.14 
 
 
414 aa  338  9.999999999999999e-92  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2764  saccharopine dehydrogenase  43.14 
 
 
414 aa  338  9.999999999999999e-92  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.114818  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR0335  hypothetical protein  43.64 
 
 
413 aa  338  9.999999999999999e-92  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0988  saccharopine dehydrogenase  43.64 
 
 
413 aa  337  1.9999999999999998e-91  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000577497 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2884  saccharopine dehydrogenase  43.95 
 
 
412 aa  336  2.9999999999999997e-91  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0438  saccharopine dehydrogenase  43.14 
 
 
426 aa  334  1e-90  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0417875  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0028  saccharopine dehydrogenase  42.53 
 
 
412 aa  332  6e-90  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1475  saccharopine dehydrogenase family protein  43.81 
 
 
412 aa  326  4.0000000000000003e-88  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0126  saccharopine dehydrogenase  43.81 
 
 
412 aa  326  4.0000000000000003e-88  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.281282 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2125  saccharopine dehydrogenase  42.05 
 
 
399 aa  322  8e-87  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.530272  normal  0.238501 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1715  saccharopine dehydrogenase  42.57 
 
 
422 aa  322  9.999999999999999e-87  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  unclonable  0.000000000659439  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2844  saccharopine dehydrogenase  41.79 
 
 
399 aa  321  1.9999999999999998e-86  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.241943 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0914  putative saccharopine dehydrogenase family protein  41.29 
 
 
424 aa  318  1e-85  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.867111  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1501  saccharopine dehydrogenase  41.29 
 
 
424 aa  317  2e-85  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2955  saccharopine dehydrogenase  42.04 
 
 
407 aa  308  1.0000000000000001e-82  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1950  hypothetical protein  32.67 
 
 
408 aa  211  2e-53  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.275408  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3221  saccharopine dehydrogenase  31.96 
 
 
407 aa  197  2.0000000000000003e-49  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3295  Saccharopine dehydrogenase  30.59 
 
 
403 aa  191  1e-47  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.886794  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5034  saccharopine dehydrogenase  30.07 
 
 
407 aa  186  8e-46  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4946  saccharopine dehydrogenase  30.07 
 
 
407 aa  186  8e-46  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5327  saccharopine dehydrogenase  30.07 
 
 
407 aa  185  1.0000000000000001e-45  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0356987  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4677  Saccharopine dehydrogenase  32.46 
 
 
401 aa  175  1.9999999999999998e-42  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1835  Saccharopine dehydrogenase  23.68 
 
 
398 aa  103  5e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.257501  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2976  saccharopine dehydrogenase  25.06 
 
 
415 aa  99.8  7e-20  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.809568  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1202  saccharopine dehydrogenase  23.06 
 
 
403 aa  71.6  0.00000000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3651  Saccharopine dehydrogenase  22.42 
 
 
367 aa  67.8  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4315  saccharopine dehydrogenase  25.33 
 
 
378 aa  63.5  0.000000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.224112  normal  0.228939 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2611  Saccharopine dehydrogenase  20 
 
 
413 aa  62.4  0.00000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1495  Saccharopine dehydrogenase  29.44 
 
 
376 aa  60.1  0.00000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.0000691069  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4394  saccharopine dehydrogenase  23.2 
 
 
384 aa  59.7  0.0000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000130212 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1941  Saccharopine dehydrogenase  24.86 
 
 
446 aa  55.5  0.000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006692  CNG01150  spermidine synthase, putative  21.68 
 
 
748 aa  53.9  0.000005  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5058  saccharopine dehydrogenase  21.65 
 
 
369 aa  52.8  0.00001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3399  Saccharopine dehydrogenase  24.24 
 
 
350 aa  52.4  0.00001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00148167  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001157  putative integral membrane protein  27.23 
 
 
360 aa  52  0.00002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_34724  predicted protein  23.77 
 
 
454 aa  50.8  0.00004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0227294  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1219  saccharopine dehydrogenase, NADP+, L-lysine forming; L-lysine dehydrogenase  18.77 
 
 
394 aa  45.1  0.002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.182404  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2343  saccharopine dehydrogenase  24.59 
 
 
376 aa  44.7  0.003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5049  Saccharopine dehydrogenase  25.85 
 
 
554 aa  44.3  0.004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.529688 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1054  hypothetical protein  23.72 
 
 
351 aa  44.3  0.004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.380877  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1424  potassium efflux system protein  24.74 
 
 
371 aa  43.5  0.006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1149  hypothetical protein  23.72 
 
 
351 aa  43.1  0.008  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>