94 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccel_1128 on replicon NC_011898
Organism: Clostridium cellulolyticum H10



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010001  Cphy_3052  saccharopine dehydrogenase  77.69 
 
 		 399 aa  662    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1555  Saccharopine dehydrogenase  79.95 
 
 		 401 aa  693    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000142738  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1128  Saccharopine dehydrogenase  100 
 
 		 399 aa  828    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.785881  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2320  Saccharopine dehydrogenase  68.8 
 
 		 396 aa  580  1e-164  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0572  saccharopine dehydrogenase  66.08 
 
 		 398 aa  577  1.0000000000000001e-163  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1535  Saccharopine dehydrogenase  68.03 
 
 		 396 aa  573  1.0000000000000001e-162  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.82797 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2516  saccharopine dehydrogenase  68.29 
 
 		 396 aa  560  1e-158  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.558897  normal  0.297438 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1181  saccharopine dehydrogenase  65.64 
 
 		 394 aa  551  1e-156  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.886294  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1597  Acyl carrier protein (ACP)  66.08 
 
 		 399 aa  549  1e-155  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.30891  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0458  saccharopine dehydrogenase  64.19 
 
 		 401 aa  546  1e-154  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6504  Saccharopine dehydrogenase  64.87 
 
 		 395 aa  543  1e-153  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.752719  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0677  saccharopine dehydrogenase  63.68 
 
 		 397 aa  544  1e-153  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.10466 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0747  saccharopine dehydrogenase  63.68 
 
 		 403 aa  542  1e-153  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  unclonable  0.0000418334  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0165  saccharopine dehydrogenase  63.68 
 
 		 401 aa  540  9.999999999999999e-153  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0208  saccharopine dehydrogenase  63.68 
 
 		 401 aa  540  9.999999999999999e-153  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.69447  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0415  saccharopine dehydrogenase  63.78 
 
 		 405 aa  538  9.999999999999999e-153  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0186  saccharopine dehydrogenase  63.17 
 
 		 401 aa  534  1e-151  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1922  saccharopine dehydrogenase  62.34 
 
 		 392 aa  530  1e-149  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00339893 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0061  saccharopine dehydrogenase  61.64 
 
 		 403 aa  525  1e-148  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0748  saccharopine dehydrogenase  62.47 
 
 		 400 aa  524  1e-148  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1790  saccharopine dehydrogenase  60.87 
 
 		 401 aa  520  1e-146  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0125  Saccharopine dehydrogenase  62.03 
 
 		 403 aa  520  1e-146  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2539  saccharopine dehydrogenase  63.5 
 
 		 398 aa  521  1e-146  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2142  Saccharopine dehydrogenase  62.4 
 
 		 404 aa  519  1e-146  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2607  saccharopine dehydrogenase  62.47 
 
 		 398 aa  519  1e-146  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0902  saccharopine dehydrogenase  62.72 
 
 		 397 aa  515  1.0000000000000001e-145  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000168136 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2888  Saccharopine dehydrogenase  62.69 
 
 		 403 aa  517  1.0000000000000001e-145  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.120454 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1201  saccharopine dehydrogenase  60.4 
 
 		 402 aa  513  1e-144  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.150944  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03351  Carboxynorspermidine dehydrogenase  61.44 
 
 		 400 aa  514  1e-144  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  decreased coverage  0.00142848  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0999  saccharopine dehydrogenase  61.36 
 
 		 405 aa  514  1e-144  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0445398  hitchhiker  0.00533099 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0285  saccharopine dehydrogenase  59.34 
 
 		 404 aa  509  1e-143  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3519  Saccharopine dehydrogenase  60.97 
 
 		 405 aa  508  1e-143  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.368548  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2095  saccharopine dehydrogenase-like protein  62.21 
 
 		 399 aa  511  1e-143  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4440  saccharopine dehydrogenase  60.87 
 
 		 401 aa  505  9.999999999999999e-143  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1081  saccharopine dehydrogenase  60.15 
 
 		 399 aa  507  9.999999999999999e-143  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.706576  normal  0.0928318 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1676  Saccharopine dehydrogenase  61.7 
 
 		 398 aa  501  1e-141  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0203222  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1307  Saccharopine dehydrogenase  63.24 
 
 		 399 aa  503  1e-141  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000784986 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0148  Saccharopine dehydrogenase  60.1 
 
 		 409 aa  502  1e-141  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2918  Saccharopine dehydrogenase  62.21 
 
 		 398 aa  493  9.999999999999999e-139  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0981  saccharopine dehydrogenase  62.47 
 
 		 398 aa  489  1e-137  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0620633  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003102  carboxynorspermidine dehydrogenase putative  46.91 
 
 		 414 aa  370  1e-101  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.185885  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02740  hypothetical protein  47.61 
 
 		 417 aa  370  1e-101  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1231  hypothetical protein  47.1 
 
 		 414 aa  365  1e-100  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00001292  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2137  saccharopine dehydrogenase  45.34 
 
 		 414 aa  353  4e-96  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0299628  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2289  saccharopine dehydrogenase  44.84 
 
 		 405 aa  351  1e-95  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.772575  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2884  saccharopine dehydrogenase  45.66 
 
 		 412 aa  351  1e-95  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2764  saccharopine dehydrogenase  44.67 
 
 		 414 aa  346  4e-94  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.114818  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2928  saccharopine dehydrogenase  44.67 
 
 		 414 aa  346  4e-94  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4157  saccharopine dehydrogenase  44.28 
 
 		 413 aa  345  1e-93  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.152115  normal  0.83779 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0028  saccharopine dehydrogenase  46.06 
 
 		 412 aa  344  1e-93  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0988  saccharopine dehydrogenase  43.18 
 
 		 413 aa  343  2e-93  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000577497 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1380  saccharopine dehydrogenase  43.94 
 
 		 412 aa  343  2.9999999999999997e-93  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  decreased coverage  0.000104449  normal  0.291708 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5844  hypothetical protein  44.84 
 
 		 413 aa  342  8e-93  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1475  saccharopine dehydrogenase family protein  45.27 
 
 		 412 aa  341  1e-92  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0126  saccharopine dehydrogenase  45.27 
 
 		 412 aa  341  1e-92  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.281282 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0352  hypothetical protein  43.91 
 
 		 413 aa  340  2e-92  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0335  hypothetical protein  43.65 
 
 		 413 aa  337  1.9999999999999998e-91  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0438  saccharopine dehydrogenase  43.65 
 
 		 426 aa  337  2.9999999999999997e-91  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0417875  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2844  saccharopine dehydrogenase  43.23 
 
 		 399 aa  329  5.0000000000000004e-89  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.241943 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2125  saccharopine dehydrogenase  43.23 
 
 		 399 aa  329  6e-89  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.530272  normal  0.238501 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1501  saccharopine dehydrogenase  43.5 
 
 		 424 aa  325  8.000000000000001e-88  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0914  putative saccharopine dehydrogenase family protein  43.5 
 
 		 424 aa  325  1e-87  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.867111  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2955  saccharopine dehydrogenase  43.04 
 
 		 407 aa  321  1.9999999999999998e-86  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1715  saccharopine dehydrogenase  43.64 
 
 		 422 aa  318  1e-85  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  unclonable  0.000000000659439  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1950  hypothetical protein  32.41 
 
 		 408 aa  200  5e-50  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.275408  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3295  Saccharopine dehydrogenase  31.23 
 
 		 403 aa  193  6e-48  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.886794  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5327  saccharopine dehydrogenase  29.78 
 
 		 407 aa  175  9.999999999999999e-43  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0356987  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5034  saccharopine dehydrogenase  29.53 
 
 		 407 aa  173  3.9999999999999995e-42  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4946  saccharopine dehydrogenase  29.53 
 
 		 407 aa  173  3.9999999999999995e-42  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3221  saccharopine dehydrogenase  30.71 
 
 		 407 aa  173  5.999999999999999e-42  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4677  Saccharopine dehydrogenase  32.17 
 
 		 401 aa  170  3e-41  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1835  Saccharopine dehydrogenase  22.98 
 
 		 398 aa  95.5  1e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.257501  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2976  saccharopine dehydrogenase  23.56 
 
 		 415 aa  95.1  2e-18  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.809568  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3651  Saccharopine dehydrogenase  23.56 
 
 		 367 aa  64.3  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1254  Saccharopine dehydrogenase  22.17 
 
 		 385 aa  59.3  0.0000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2611  Saccharopine dehydrogenase  21.84 
 
 		 413 aa  58.9  0.0000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4315  saccharopine dehydrogenase  22.77 
 
 		 378 aa  57.8  0.0000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.224112  normal  0.228939 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1202  saccharopine dehydrogenase  21.26 
 
 		 403 aa  57  0.0000006  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1242  saccharopine dehydrogenase  24.38 
 
 		 394 aa  55.1  0.000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3399  Saccharopine dehydrogenase  22.63 
 
 		 350 aa  53.9  0.000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00148167  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1138  putative transmembrane protein  32.5 
 
 		 375 aa  50.8  0.00004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.972053 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5058  saccharopine dehydrogenase  22.19 
 
 		 369 aa  50.8  0.00004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4394  saccharopine dehydrogenase  22.61 
 
 		 384 aa  49.7  0.00009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000130212 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1482  hypothetical protein  22.78 
 
 		 394 aa  48.1  0.0002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1441  hypothetical protein  23.13 
 
 		 394 aa  48.5  0.0002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1941  Saccharopine dehydrogenase  25.13 
 
 		 446 aa  47.8  0.0003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006692  CNG01150  spermidine synthase, putative  21.54 
 
 		 748 aa  47.8  0.0003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0384  Saccharopine dehydrogenase  21.38 
 
 		 384 aa  47  0.0006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0854083  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2359  Saccharopine dehydrogenase  31.79 
 
 		 345 aa  46.6  0.0008  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0263338  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1424  potassium efflux system protein  27.45 
 
 		 371 aa  45.4  0.002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1495  Saccharopine dehydrogenase  22.4 
 
 		 376 aa  44.7  0.003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.0000691069  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001157  putative integral membrane protein  24.48 
 
 		 360 aa  43.5  0.007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1829  shikimate 5-dehydrogenase  27.54 
 
 		 282 aa  43.1  0.008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.037769 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2027  saccharopine dehydrogenase  32.58 
 
 		 351 aa  42.7  0.01  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0488088  normal  0.664425 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>