120 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GYMC61_1254 on replicon NC_013411
Organism: Geobacillus sp. Y412MC61



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013411  GYMC61_1254  Saccharopine dehydrogenase  100 
 
 		 385 aa  778    Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0384  Saccharopine dehydrogenase  76.76 
 
 		 384 aa  607  9.999999999999999e-173  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0854083  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1791  saccharopine dehydrogenase  38.18 
 
 		 392 aa  245  9.999999999999999e-64  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.493672  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2611  Saccharopine dehydrogenase  33.68 
 
 		 413 aa  218  2e-55  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1622  saccharopine dehydrogenase  34.9 
 
 		 348 aa  147  3e-34  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.871276  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1254  hypothetical protein  32.21 
 
 		 376 aa  146  7.0000000000000006e-34  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.413052  normal  0.0375347 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3712  saccharopine dehydrogenase  32.78 
 
 		 367 aa  146  7.0000000000000006e-34  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0633  hypothetical protein  32.51 
 
 		 367 aa  143  4e-33  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.419888  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1243  saccharopine dehydrogenase  31.32 
 
 		 365 aa  144  4e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1645  saccharopine dehydrogenase  32.61 
 
 		 366 aa  138  1e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1645  saccharopine dehydrogenase  32.61 
 
 		 366 aa  138  1e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.733408 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6355  saccharopine dehydrogenase  32.61 
 
 		 366 aa  138  2e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1723  saccharopine dehydrogenase  32.61 
 
 		 366 aa  138  2e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1737  saccharopine dehydrogenase  32.61 
 
 		 366 aa  138  2e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.406485 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5016  saccharopine dehydrogenase  32.05 
 
 		 366 aa  136  6.0000000000000005e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.288707  normal  0.105633 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1992  putative saccharopine dehydrogenase, NAD-binding  31.52 
 
 		 365 aa  135  9.999999999999999e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.899138  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1835  Saccharopine dehydrogenase  27.39 
 
 		 398 aa  135  9.999999999999999e-31  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.257501  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1536  saccharopine dehydrogenase  31.78 
 
 		 366 aa  135  1.9999999999999998e-30  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.938044 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2656  saccharopine dehydrogenase  29.75 
 
 		 373 aa  134  3.9999999999999996e-30  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3947  Saccharopine dehydrogenase  31.51 
 
 		 379 aa  133  6e-30  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.35469  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3251  dehydrogenase  30.58 
 
 		 373 aa  133  6e-30  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.976387  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0976  hypothetical protein  32.05 
 
 		 366 aa  131  2.0000000000000002e-29  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.175424  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2269  saccharopine dehydrogenase  32.05 
 
 		 366 aa  131  2.0000000000000002e-29  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.044171  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2080  saccharopine dehydrogenase  32.05 
 
 		 366 aa  131  2.0000000000000002e-29  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.599315  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2136  saccharopine dehydrogenase  32.05 
 
 		 366 aa  131  2.0000000000000002e-29  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.112826  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4331  saccharopine dehydrogenase  30.79 
 
 		 379 aa  130  3e-29  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2308  hypothetical protein  31.87 
 
 		 366 aa  130  5.0000000000000004e-29  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1846  Saccharopine dehydrogenase  29.97 
 
 		 389 aa  130  5.0000000000000004e-29  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2268  Saccharopine dehydrogenase  30.22 
 
 		 365 aa  129  7.000000000000001e-29  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.87049  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1936  saccharopine dehydrogenase  31.02 
 
 		 392 aa  129  9.000000000000001e-29  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1035  saccharopine dehydrogenase  27.99 
 
 		 369 aa  129  1.0000000000000001e-28  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.002622 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2920  saccharopine dehydrogenase  31.49 
 
 		 367 aa  128  2.0000000000000002e-28  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0566  saccharopine dehydrogenase  31.37 
 
 		 385 aa  125  1e-27  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.411174 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2420  Saccharopine dehydrogenase  29.55 
 
 		 354 aa  124  2e-27  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.870969  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2037  saccharopine dehydrogenase  29.71 
 
 		 389 aa  124  2e-27  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1836  Saccharopine dehydrogenase  27.48 
 
 		 387 aa  124  4e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.973025 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0647  saccharopine dehydrogenase  35.14 
 
 		 348 aa  123  5e-27  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0657  saccharopine dehydrogenase  33.15 
 
 		 346 aa  122  9.999999999999999e-27  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0527  saccharopine dehydrogenase  33.33 
 
 		 347 aa  120  4.9999999999999996e-26  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5587  Saccharopine dehydrogenase  30.33 
 
 		 376 aa  119  7.999999999999999e-26  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0890714  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5033  Saccharopine dehydrogenase  27.57 
 
 		 354 aa  117  3e-25  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0572  saccharopine dehydrogenase  28.13 
 
 		 388 aa  115  1.0000000000000001e-24  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.20382 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1441  hypothetical protein  27.5 
 
 		 394 aa  115  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3051  TrkA-N:saccharopine dehydrogenase  29 
 
 		 393 aa  114  2.0000000000000002e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.995368  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1241  hypothetical protein  28 
 
 		 394 aa  114  4.0000000000000004e-24  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1217  saccharopine dehydrogenase, NADP+, L-lysine forming; L-lysine dehydrogenase  28 
 
 		 394 aa  114  4.0000000000000004e-24  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1342  hypothetical protein  28 
 
 		 394 aa  114  4.0000000000000004e-24  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1416  hypothetical protein  28 
 
 		 394 aa  114  4.0000000000000004e-24  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.572078 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1242  saccharopine dehydrogenase  26.55 
 
 		 394 aa  112  1.0000000000000001e-23  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1219  saccharopine dehydrogenase, NADP+, L-lysine forming; L-lysine dehydrogenase  28.22 
 
 		 394 aa  111  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.182404  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1482  hypothetical protein  27 
 
 		 394 aa  110  4.0000000000000004e-23  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3208  saccharopine dehydrogenase  29.02 
 
 		 397 aa  109  7.000000000000001e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0269  saccharopine dehydrogenase  29.07 
 
 		 385 aa  108  2e-22  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.901872  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1304  hypothetical protein  28.61 
 
 		 362 aa  107  4e-22  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1303  hypothetical protein  28.61 
 
 		 362 aa  107  4e-22  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0002  Saccharopine dehydrogenase  27.44 
 
 		 360 aa  107  4e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.717423  hitchhiker  0.0043893 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0002  Saccharopine dehydrogenase  27.67 
 
 		 360 aa  103  4e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0292492 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1379  hypothetical protein  24.19 
 
 		 394 aa  100  3e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2810  saccharopine dehydrogenase  30.04 
 
 		 380 aa  99  1e-19  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.111095  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2155  saccharopine dehydrogenase  27.75 
 
 		 367 aa  99  1e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3965  hypothetical protein  25.25 
 
 		 394 aa  99  1e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05601  saccharopine dehydrogenase (NADP+, L-glutamate-forming) (Eurofung)  28.41 
 
 		 450 aa  87.4  3e-16  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.404414  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2976  saccharopine dehydrogenase  25 
 
 		 415 aa  85.1  0.000000000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.809568  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_70210  seventh step in lysine biosynthesis pathway  25.3 
 
 		 444 aa  82.4  0.00000000000001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.125717 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3519  Saccharopine dehydrogenase  23.3 
 
 		 405 aa  80.9  0.00000000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.368548  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2095  saccharopine dehydrogenase-like protein  24.37 
 
 		 399 aa  79  0.0000000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003102  carboxynorspermidine dehydrogenase putative  25.43 
 
 		 414 aa  77.8  0.0000000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.185885  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1231  hypothetical protein  25.06 
 
 		 414 aa  77  0.0000000000006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00001292  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1950  hypothetical protein  22.77 
 
 		 408 aa  75.9  0.000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.275408  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02740  hypothetical protein  25.43 
 
 		 417 aa  75.5  0.000000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0902  saccharopine dehydrogenase  25.06 
 
 		 397 aa  72.8  0.00000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000168136 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1597  Acyl carrier protein (ACP)  25.31 
 
 		 399 aa  72.8  0.00000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.30891  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2539  saccharopine dehydrogenase  25.19 
 
 		 398 aa  72  0.00000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006692  CNG01150  spermidine synthase, putative  23.9 
 
 		 748 aa  71.6  0.00000000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0677  saccharopine dehydrogenase  22.14 
 
 		 397 aa  70.5  0.00000000005  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.10466 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1922  saccharopine dehydrogenase  25.56 
 
 		 392 aa  70.5  0.00000000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00339893 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2888  Saccharopine dehydrogenase  24.07 
 
 		 403 aa  69.7  0.00000000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.120454 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4440  saccharopine dehydrogenase  25.06 
 
 		 401 aa  68.6  0.0000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3651  Saccharopine dehydrogenase  23.47 
 
 		 367 aa  67.4  0.0000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03351  Carboxynorspermidine dehydrogenase  22.84 
 
 		 400 aa  65.9  0.000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  decreased coverage  0.00142848  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0572  saccharopine dehydrogenase  23.41 
 
 		 398 aa  65.1  0.000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2607  saccharopine dehydrogenase  24.69 
 
 		 398 aa  65.1  0.000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1676  Saccharopine dehydrogenase  25.45 
 
 		 398 aa  65.5  0.000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0203222  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4394  saccharopine dehydrogenase  24.12 
 
 		 384 aa  63.9  0.000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000130212 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4677  Saccharopine dehydrogenase  23.4 
 
 		 401 aa  64.3  0.000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4315  saccharopine dehydrogenase  24.87 
 
 		 378 aa  62.8  0.000000009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.224112  normal  0.228939 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1202  saccharopine dehydrogenase  24.76 
 
 		 403 aa  62.8  0.000000009  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1535  Saccharopine dehydrogenase  25.37 
 
 		 396 aa  63.2  0.000000009  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.82797 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1790  saccharopine dehydrogenase  25.25 
 
 		 401 aa  62.4  0.00000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1201  saccharopine dehydrogenase  23.69 
 
 		 402 aa  62.4  0.00000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.150944  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2289  saccharopine dehydrogenase  24.55 
 
 		 405 aa  62.8  0.00000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.772575  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2137  saccharopine dehydrogenase  23.72 
 
 		 414 aa  62.4  0.00000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0299628  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0999  saccharopine dehydrogenase  23.76 
 
 		 405 aa  60.1  0.00000006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0445398  hitchhiker  0.00533099 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5327  saccharopine dehydrogenase  22.9 
 
 		 407 aa  60.1  0.00000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0356987  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0748  saccharopine dehydrogenase  23.1 
 
 		 400 aa  59.3  0.0000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2918  Saccharopine dehydrogenase  24.69 
 
 		 398 aa  59.3  0.0000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1555  Saccharopine dehydrogenase  24.57 
 
 		 401 aa  59.3  0.0000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000142738  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1128  Saccharopine dehydrogenase  22.17 
 
 		 399 aa  59.3  0.0000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.785881  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5034  saccharopine dehydrogenase  22.9 
 
 		 407 aa  58.9  0.0000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0981  saccharopine dehydrogenase  24.56 
 
 		 398 aa  58.2  0.0000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0620633  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>