83 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oant_3712 on replicon NC_009668
Organism: Ochrobactrum anthropi ATCC 49188



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_004311  BRA0633  hypothetical protein  97.27 
 
 
367 aa  731    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.419888  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3712  saccharopine dehydrogenase  100 
 
 
367 aa  750    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2920  saccharopine dehydrogenase  74.93 
 
 
367 aa  559  1e-158  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3251  dehydrogenase  71.63 
 
 
373 aa  532  1e-150  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.976387  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1936  saccharopine dehydrogenase  71.15 
 
 
392 aa  523  1e-147  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3947  Saccharopine dehydrogenase  63.76 
 
 
379 aa  459  9.999999999999999e-129  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.35469  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1243  saccharopine dehydrogenase  53.39 
 
 
365 aa  400  9.999999999999999e-111  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2268  Saccharopine dehydrogenase  53.67 
 
 
365 aa  389  1e-107  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.87049  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1992  putative saccharopine dehydrogenase, NAD-binding  53.67 
 
 
365 aa  390  1e-107  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.899138  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1645  saccharopine dehydrogenase  55.37 
 
 
366 aa  383  1e-105  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6355  saccharopine dehydrogenase  55.37 
 
 
366 aa  383  1e-105  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2080  saccharopine dehydrogenase  54.8 
 
 
366 aa  384  1e-105  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.599315  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2656  saccharopine dehydrogenase  53.48 
 
 
373 aa  384  1e-105  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1645  saccharopine dehydrogenase  55.37 
 
 
366 aa  383  1e-105  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.733408 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1723  saccharopine dehydrogenase  55.37 
 
 
366 aa  383  1e-105  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2308  hypothetical protein  54.24 
 
 
366 aa  383  1e-105  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2810  saccharopine dehydrogenase  55.06 
 
 
380 aa  382  1e-105  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.111095  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2136  saccharopine dehydrogenase  54.52 
 
 
366 aa  384  1e-105  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.112826  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5016  saccharopine dehydrogenase  54.8 
 
 
366 aa  381  1e-105  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.288707  normal  0.105633 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2269  saccharopine dehydrogenase  54.8 
 
 
366 aa  384  1e-105  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.044171  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0976  hypothetical protein  54.52 
 
 
366 aa  384  1e-105  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.175424  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1737  saccharopine dehydrogenase  55.37 
 
 
366 aa  383  1e-105  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.406485 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1536  saccharopine dehydrogenase  54.24 
 
 
366 aa  379  1e-104  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.938044 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3051  TrkA-N:saccharopine dehydrogenase  52.3 
 
 
393 aa  378  1e-103  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.995368  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0269  saccharopine dehydrogenase  52.92 
 
 
385 aa  374  1e-102  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.901872  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1846  Saccharopine dehydrogenase  52.81 
 
 
389 aa  365  1e-100  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2155  saccharopine dehydrogenase  51.69 
 
 
367 aa  363  2e-99  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3208  saccharopine dehydrogenase  51.47 
 
 
397 aa  360  3e-98  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2037  saccharopine dehydrogenase  51.55 
 
 
389 aa  356  2.9999999999999997e-97  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4331  saccharopine dehydrogenase  48.6 
 
 
379 aa  355  5.999999999999999e-97  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1254  hypothetical protein  50.28 
 
 
376 aa  345  1e-93  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.413052  normal  0.0375347 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5587  Saccharopine dehydrogenase  47.75 
 
 
376 aa  340  2.9999999999999998e-92  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0890714  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0566  saccharopine dehydrogenase  47.37 
 
 
385 aa  338  9e-92  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.411174 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1303  hypothetical protein  48.07 
 
 
362 aa  336  5e-91  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1304  hypothetical protein  48.07 
 
 
362 aa  336  5e-91  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5033  Saccharopine dehydrogenase  43.89 
 
 
354 aa  313  3.9999999999999997e-84  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2420  Saccharopine dehydrogenase  41.27 
 
 
354 aa  290  3e-77  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.870969  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0002  Saccharopine dehydrogenase  42.98 
 
 
360 aa  288  9e-77  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0292492 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0002  Saccharopine dehydrogenase  42.42 
 
 
360 aa  286  5e-76  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.717423  hitchhiker  0.0043893 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1791  saccharopine dehydrogenase  30.91 
 
 
392 aa  160  4e-38  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.493672  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1254  Saccharopine dehydrogenase  32.78 
 
 
385 aa  146  6e-34  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2611  Saccharopine dehydrogenase  31.02 
 
 
413 aa  144  3e-33  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0384  Saccharopine dehydrogenase  30.77 
 
 
384 aa  134  3e-30  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0854083  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1622  saccharopine dehydrogenase  32.93 
 
 
348 aa  130  4.0000000000000003e-29  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.871276  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0527  saccharopine dehydrogenase  30.12 
 
 
347 aa  107  3e-22  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0647  saccharopine dehydrogenase  27.86 
 
 
348 aa  106  8e-22  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0657  saccharopine dehydrogenase  32 
 
 
346 aa  105  1e-21  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1035  saccharopine dehydrogenase  26.37 
 
 
369 aa  89  1e-16  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  hitchhiker  0.002622 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1835  Saccharopine dehydrogenase  26.02 
 
 
398 aa  62  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.257501  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0572  saccharopine dehydrogenase  26.25 
 
 
388 aa  60.1  0.00000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.20382 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3651  Saccharopine dehydrogenase  27.56 
 
 
367 aa  56.6  0.0000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006692  CNG01150  spermidine synthase, putative  25.51 
 
 
748 aa  56.6  0.0000006  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2888  Saccharopine dehydrogenase  27.39 
 
 
403 aa  53.1  0.000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.120454 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_70210  seventh step in lysine biosynthesis pathway  21.94 
 
 
444 aa  52.8  0.00001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.125717 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1495  Saccharopine dehydrogenase  27.74 
 
 
376 aa  52.8  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.0000691069  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5058  saccharopine dehydrogenase  24.16 
 
 
369 aa  51.6  0.00002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4394  saccharopine dehydrogenase  26.32 
 
 
384 aa  51.2  0.00003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000130212 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1364  saccharopine dehydrogenase (NADP(+), L-lysine-forming)  24.1 
 
 
454 aa  50.4  0.00005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0106  saccharopine dehydrogenase (NADP+, L-glutamate forming)  22.42 
 
 
380 aa  50.4  0.00005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1676  Saccharopine dehydrogenase  25.34 
 
 
398 aa  50.1  0.00006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0203222  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1790  saccharopine dehydrogenase  25.97 
 
 
401 aa  50.1  0.00007  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2707  saccharopine dehydrogenase  22.3 
 
 
439 aa  50.1  0.00007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3519  Saccharopine dehydrogenase  23.85 
 
 
405 aa  49.7  0.00009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.368548  normal 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05601  saccharopine dehydrogenase (NADP+, L-glutamate-forming) (Eurofung)  23.16 
 
 
450 aa  48.9  0.0001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.404414  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1201  saccharopine dehydrogenase  25 
 
 
402 aa  49.3  0.0001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.150944  normal 
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_34724  predicted protein  31.51 
 
 
454 aa  49.3  0.0001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0227294  normal 
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_54394  saccharopine dehydrogenase  27.87 
 
 
682 aa  48.9  0.0002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2539  saccharopine dehydrogenase  24.43 
 
 
398 aa  47.8  0.0003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2095  saccharopine dehydrogenase-like protein  24.44 
 
 
399 aa  47.8  0.0003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1836  Saccharopine dehydrogenase  24.76 
 
 
387 aa  47.8  0.0003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.973025 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2343  saccharopine dehydrogenase  25.31 
 
 
376 aa  47.4  0.0004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006670  CNA02370  saccharopine dehydrogenase (NADP+, L-glutamate-forming), putative  22 
 
 
934 aa  46.6  0.0007  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.840978  n/a   
 
 
-
 
NC_011690  PHATRDRAFT_40135  predicted protein  31.19 
 
 
461 aa  46.6  0.0008  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4315  saccharopine dehydrogenase  23.72 
 
 
378 aa  45.8  0.001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.224112  normal  0.228939 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3682  hypothetical protein  22.6 
 
 
375 aa  45.4  0.001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2221  saccharopine dehydrogenase  23.53 
 
 
375 aa  44.3  0.003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000139161  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3544  putative integral membrane protein  28.5 
 
 
324 aa  43.5  0.006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.0710897 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1217  saccharopine dehydrogenase, NADP+, L-lysine forming; L-lysine dehydrogenase  23.41 
 
 
394 aa  43.1  0.007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1241  hypothetical protein  23.41 
 
 
394 aa  43.1  0.007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1342  hypothetical protein  23.41 
 
 
394 aa  43.1  0.007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1424  potassium efflux system protein  25.81 
 
 
371 aa  43.1  0.007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1416  hypothetical protein  23.41 
 
 
394 aa  43.1  0.007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.572078 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1482  hypothetical protein  23.46 
 
 
394 aa  43.1  0.007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>