59 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene lpp1304 on replicon NC_006368
Organism: Legionella pneumophila str. Paris



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006368  lpp1304  hypothetical protein  100 
 
 
362 aa  750    Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1303  hypothetical protein  100 
 
 
362 aa  750    Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1243  saccharopine dehydrogenase  46.52 
 
 
365 aa  344  2e-93  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2656  saccharopine dehydrogenase  49.17 
 
 
373 aa  343  2e-93  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3712  saccharopine dehydrogenase  48.07 
 
 
367 aa  343  2.9999999999999997e-93  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0633  hypothetical protein  47.79 
 
 
367 aa  339  4e-92  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.419888  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3251  dehydrogenase  45.98 
 
 
373 aa  339  4e-92  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.976387  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1992  putative saccharopine dehydrogenase, NAD-binding  47.21 
 
 
365 aa  338  9.999999999999999e-92  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.899138  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2268  Saccharopine dehydrogenase  47.08 
 
 
365 aa  337  1.9999999999999998e-91  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.87049  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2920  saccharopine dehydrogenase  47.51 
 
 
367 aa  337  1.9999999999999998e-91  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1936  saccharopine dehydrogenase  46.41 
 
 
392 aa  333  3e-90  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1645  saccharopine dehydrogenase  46.26 
 
 
366 aa  323  2e-87  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.733408 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1645  saccharopine dehydrogenase  46.26 
 
 
366 aa  323  2e-87  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6355  saccharopine dehydrogenase  46.26 
 
 
366 aa  323  3e-87  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1723  saccharopine dehydrogenase  46.26 
 
 
366 aa  323  3e-87  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1536  saccharopine dehydrogenase  46.11 
 
 
366 aa  323  3e-87  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.938044 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1737  saccharopine dehydrogenase  46.26 
 
 
366 aa  323  3e-87  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.406485 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5016  saccharopine dehydrogenase  45.56 
 
 
366 aa  322  7e-87  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.288707  normal  0.105633 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2136  saccharopine dehydrogenase  46.52 
 
 
366 aa  319  3.9999999999999996e-86  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.112826  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0976  hypothetical protein  46.52 
 
 
366 aa  319  3.9999999999999996e-86  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.175424  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2269  saccharopine dehydrogenase  46.24 
 
 
366 aa  319  5e-86  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.044171  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2080  saccharopine dehydrogenase  46.24 
 
 
366 aa  319  5e-86  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.599315  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2308  hypothetical protein  45.68 
 
 
366 aa  318  7.999999999999999e-86  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3947  Saccharopine dehydrogenase  45.71 
 
 
379 aa  311  1e-83  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.35469  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2810  saccharopine dehydrogenase  44.04 
 
 
380 aa  310  2e-83  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.111095  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3051  TrkA-N:saccharopine dehydrogenase  43.9 
 
 
393 aa  300  3e-80  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.995368  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0269  saccharopine dehydrogenase  45.88 
 
 
385 aa  299  4e-80  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.901872  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1254  hypothetical protein  43.37 
 
 
376 aa  295  6e-79  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.413052  normal  0.0375347 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0566  saccharopine dehydrogenase  43.24 
 
 
385 aa  295  1e-78  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.411174 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1846  Saccharopine dehydrogenase  42.94 
 
 
389 aa  292  5e-78  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2037  saccharopine dehydrogenase  42.94 
 
 
389 aa  290  4e-77  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4331  saccharopine dehydrogenase  40.56 
 
 
379 aa  290  4e-77  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5587  Saccharopine dehydrogenase  40.83 
 
 
376 aa  280  2e-74  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0890714  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2155  saccharopine dehydrogenase  42.58 
 
 
367 aa  271  1e-71  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2420  Saccharopine dehydrogenase  38.5 
 
 
354 aa  271  1e-71  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.870969  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3208  saccharopine dehydrogenase  43.05 
 
 
397 aa  271  1e-71  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5033  Saccharopine dehydrogenase  39.61 
 
 
354 aa  265  1e-69  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0002  Saccharopine dehydrogenase  39.28 
 
 
360 aa  260  3e-68  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0292492 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0002  Saccharopine dehydrogenase  39 
 
 
360 aa  256  3e-67  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.717423  hitchhiker  0.0043893 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2611  Saccharopine dehydrogenase  30.07 
 
 
413 aa  129  6e-29  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1791  saccharopine dehydrogenase  26.29 
 
 
392 aa  129  1.0000000000000001e-28  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.493672  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1254  Saccharopine dehydrogenase  28.61 
 
 
385 aa  116  6e-25  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0384  Saccharopine dehydrogenase  27.91 
 
 
384 aa  115  8.999999999999998e-25  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0854083  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1622  saccharopine dehydrogenase  29.07 
 
 
348 aa  102  1e-20  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.871276  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0527  saccharopine dehydrogenase  29.69 
 
 
347 aa  95.1  1e-18  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0647  saccharopine dehydrogenase  27.78 
 
 
348 aa  92.4  1e-17  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0657  saccharopine dehydrogenase  27.2 
 
 
346 aa  90.5  4e-17  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1364  saccharopine dehydrogenase (NADP(+), L-lysine-forming)  24.71 
 
 
454 aa  60.8  0.00000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1035  saccharopine dehydrogenase  25.65 
 
 
369 aa  58.2  0.0000003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  hitchhiker  0.002622 
 
 
-
 
NC_006670  CNA02370  saccharopine dehydrogenase (NADP+, L-glutamate-forming), putative  23.81 
 
 
934 aa  54.3  0.000003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.840978  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_70210  seventh step in lysine biosynthesis pathway  24.24 
 
 
444 aa  52.8  0.000009  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.125717 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0007  saccharopine dehydrogenase  26.99 
 
 
387 aa  51.6  0.00002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1835  Saccharopine dehydrogenase  21.84 
 
 
398 aa  52  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.257501  normal 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05601  saccharopine dehydrogenase (NADP+, L-glutamate-forming) (Eurofung)  20.9 
 
 
450 aa  51.6  0.00002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.404414  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5447  Saccharopine dehydrogenase (NAD(+), L-glutamate- forming)  27.23 
 
 
441 aa  52  0.00002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.205449  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_7  hypothetical protein  28.83 
 
 
387 aa  47.8  0.0003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006692  CNG01150  spermidine synthase, putative  23.72 
 
 
748 aa  46.6  0.0007  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2707  saccharopine dehydrogenase  24.63 
 
 
439 aa  44.7  0.003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01665  saccharopine dehydrogenase, putative  22.28 
 
 
456 aa  43.9  0.004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  decreased coverage  0.000853832  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>