54 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TM1040_2656 on replicon NC_008044
Organism: Ruegeria sp. TM1040



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008044  TM1040_2656  saccharopine dehydrogenase  100 
 
 		 373 aa  768    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1243  saccharopine dehydrogenase  51.8 
 
 		 365 aa  392  1e-108  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0633  hypothetical protein  53.78 
 
 		 367 aa  385  1e-106  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.419888  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3712  saccharopine dehydrogenase  53.48 
 
 		 367 aa  384  1e-105  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3251  dehydrogenase  53.37 
 
 		 373 aa  383  1e-105  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.976387  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2269  saccharopine dehydrogenase  51.8 
 
 		 366 aa  378  1e-104  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.044171  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2268  Saccharopine dehydrogenase  51.25 
 
 		 365 aa  378  1e-104  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.87049  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2080  saccharopine dehydrogenase  51.8 
 
 		 366 aa  378  1e-104  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.599315  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1992  putative saccharopine dehydrogenase, NAD-binding  51.25 
 
 		 365 aa  380  1e-104  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.899138  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0976  hypothetical protein  51.8 
 
 		 366 aa  378  1e-103  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.175424  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2136  saccharopine dehydrogenase  51.8 
 
 		 366 aa  378  1e-103  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.112826  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2308  hypothetical protein  51.25 
 
 		 366 aa  375  1e-103  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1536  saccharopine dehydrogenase  50.69 
 
 		 366 aa  372  1e-102  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.938044 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1645  saccharopine dehydrogenase  49.73 
 
 		 366 aa  369  1e-101  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1645  saccharopine dehydrogenase  49.73 
 
 		 366 aa  369  1e-101  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.733408 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0269  saccharopine dehydrogenase  53.93 
 
 		 385 aa  369  1e-101  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.901872  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5016  saccharopine dehydrogenase  50.42 
 
 		 366 aa  370  1e-101  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.288707  normal  0.105633 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1737  saccharopine dehydrogenase  50.14 
 
 		 366 aa  367  1e-100  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.406485 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6355  saccharopine dehydrogenase  50.14 
 
 		 366 aa  367  1e-100  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1723  saccharopine dehydrogenase  50.14 
 
 		 366 aa  367  1e-100  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1936  saccharopine dehydrogenase  52.1 
 
 		 392 aa  361  1e-98  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2810  saccharopine dehydrogenase  53.67 
 
 		 380 aa  354  2e-96  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.111095  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2920  saccharopine dehydrogenase  50.28 
 
 		 367 aa  350  2e-95  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2155  saccharopine dehydrogenase  50.43 
 
 		 367 aa  348  6e-95  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3947  Saccharopine dehydrogenase  52.96 
 
 		 379 aa  348  7e-95  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.35469  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3208  saccharopine dehydrogenase  51.77 
 
 		 397 aa  347  3e-94  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3051  TrkA-N:saccharopine dehydrogenase  50.41 
 
 		 393 aa  346  5e-94  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.995368  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4331  saccharopine dehydrogenase  45.63 
 
 		 379 aa  338  8e-92  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1846  Saccharopine dehydrogenase  49.15 
 
 		 389 aa  334  2e-90  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5587  Saccharopine dehydrogenase  47.65 
 
 		 376 aa  333  2e-90  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0890714  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1303  hypothetical protein  49.17 
 
 		 362 aa  332  8e-90  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1304  hypothetical protein  49.17 
 
 		 362 aa  332  8e-90  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2037  saccharopine dehydrogenase  49.15 
 
 		 389 aa  332  9e-90  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1254  hypothetical protein  48.43 
 
 		 376 aa  328  1.0000000000000001e-88  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.413052  normal  0.0375347 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0566  saccharopine dehydrogenase  46.8 
 
 		 385 aa  323  3e-87  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.411174 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0002  Saccharopine dehydrogenase  41.67 
 
 		 360 aa  289  6e-77  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0292492 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5033  Saccharopine dehydrogenase  42.25 
 
 		 354 aa  287  2e-76  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0002  Saccharopine dehydrogenase  41.39 
 
 		 360 aa  286  4e-76  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.717423  hitchhiker  0.0043893 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2420  Saccharopine dehydrogenase  38.31 
 
 		 354 aa  286  5.999999999999999e-76  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.870969  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1254  Saccharopine dehydrogenase  29.75 
 
 		 385 aa  134  3.9999999999999996e-30  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1791  saccharopine dehydrogenase  29.22 
 
 		 392 aa  133  3.9999999999999996e-30  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.493672  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0384  Saccharopine dehydrogenase  29.03 
 
 		 384 aa  131  2.0000000000000002e-29  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0854083  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2611  Saccharopine dehydrogenase  30.25 
 
 		 413 aa  128  1.0000000000000001e-28  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1622  saccharopine dehydrogenase  28.36 
 
 		 348 aa  113  5e-24  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.871276  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1035  saccharopine dehydrogenase  28.86 
 
 		 369 aa  111  2.0000000000000002e-23  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.002622 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0527  saccharopine dehydrogenase  28.25 
 
 		 347 aa  102  2e-20  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0647  saccharopine dehydrogenase  30.4 
 
 		 348 aa  97.4  3e-19  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0657  saccharopine dehydrogenase  29.29 
 
 		 346 aa  93.2  7e-18  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1835  Saccharopine dehydrogenase  23.36 
 
 		 398 aa  50.4  0.00005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.257501  normal  1 
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_54394  saccharopine dehydrogenase  24.86 
 
 		 682 aa  46.2  0.001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2976  saccharopine dehydrogenase  23.65 
 
 		 415 aa  43.5  0.006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.809568  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0572  saccharopine dehydrogenase  25.79 
 
 		 388 aa  43.5  0.006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.20382 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3141  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.14 
 
 		 252 aa  43.1  0.008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.13414  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0106  saccharopine dehydrogenase (NADP+, L-glutamate forming)  25.95 
 
 		 380 aa  42.7  0.009  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>