67 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TM1040_0106 on replicon NC_008044
Organism: Ruegeria sp. TM1040



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008044  TM1040_0106  saccharopine dehydrogenase (NADP+, L-glutamate forming)  100 
 
 		 380 aa  780    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1047  saccharopine dehydrogenase  42.08 
 
 		 411 aa  259  5.0000000000000005e-68  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.789456  normal  0.0319495 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3542  Saccharopine dehydrogenase  38.77 
 
 		 382 aa  259  5.0000000000000005e-68  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05601  saccharopine dehydrogenase (NADP+, L-glutamate-forming) (Eurofung)  30.95 
 
 		 450 aa  158  1e-37  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.404414  normal  1 
 
 
-
 
NC_006692  CNG01150  spermidine synthase, putative  30 
 
 		 748 aa  157  3e-37  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_70210  seventh step in lysine biosynthesis pathway  37.17 
 
 		 444 aa  157  4e-37  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.125717 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2707  saccharopine dehydrogenase  29.14 
 
 		 439 aa  122  8e-27  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006670  CNA02370  saccharopine dehydrogenase (NADP+, L-glutamate-forming), putative  35.41 
 
 		 934 aa  116  7.999999999999999e-25  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.840978  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1364  saccharopine dehydrogenase (NADP(+), L-lysine-forming)  28.18 
 
 		 454 aa  114  3e-24  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5447  Saccharopine dehydrogenase (NAD(+), L-glutamate- forming)  31.1 
 
 		 441 aa  108  2e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.205449  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01665  saccharopine dehydrogenase, putative  31.58 
 
 		 456 aa  107  3e-22  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  decreased coverage  0.000853832  n/a   
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_54394  saccharopine dehydrogenase  31.75 
 
 		 682 aa  85.1  0.000000000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1836  Saccharopine dehydrogenase  28.24 
 
 		 387 aa  85.1  0.000000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.973025 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0657  saccharopine dehydrogenase  28.19 
 
 		 346 aa  68.2  0.0000000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1622  saccharopine dehydrogenase  27.51 
 
 		 348 aa  66.2  0.0000000008  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.871276  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1791  saccharopine dehydrogenase  28.8 
 
 		 392 aa  66.2  0.000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.493672  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0527  saccharopine dehydrogenase  27.15 
 
 		 347 aa  63.9  0.000000004  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0647  saccharopine dehydrogenase  28.39 
 
 		 348 aa  61.6  0.00000002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0384  Saccharopine dehydrogenase  24.03 
 
 		 384 aa  56.6  0.0000006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0854083  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1254  Saccharopine dehydrogenase  24.37 
 
 		 385 aa  55.1  0.000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0633  hypothetical protein  22.06 
 
 		 367 aa  51.2  0.00003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.419888  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1936  saccharopine dehydrogenase  22.59 
 
 		 392 aa  51.2  0.00003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3712  saccharopine dehydrogenase  22.42 
 
 		 367 aa  50.4  0.00006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0565  6-phosphogluconate dehydrogenase NAD-binding  58.54 
 
 		 297 aa  49.7  0.00009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.426217  normal  0.340404 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1704  2-hydroxy-3-oxopropionate reductase  33.59 
 
 		 308 aa  49.3  0.0001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.542696  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3947  Saccharopine dehydrogenase  26.83 
 
 		 379 aa  49.7  0.0001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.35469  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3456  6-phosphogluconate dehydrogenase NAD-binding  28.92 
 
 		 291 aa  48.5  0.0002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.236209  normal  0.0188789 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5033  Saccharopine dehydrogenase  25.56 
 
 		 354 aa  48.1  0.0003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2420  Saccharopine dehydrogenase  22.22 
 
 		 354 aa  47.8  0.0003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.870969  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1992  putative saccharopine dehydrogenase, NAD-binding  28 
 
 		 365 aa  47.4  0.0004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.899138  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3760  2-hydroxy-3-oxopropionate reductase  36.63 
 
 		 293 aa  47.8  0.0004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.814396  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2611  Saccharopine dehydrogenase  25.14 
 
 		 413 aa  47.4  0.0004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6151  3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase and related beta-hydroxyacid dehydrogenase-like protein  38.38 
 
 		 402 aa  47.8  0.0004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0200858 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2268  Saccharopine dehydrogenase  25.79 
 
 		 365 aa  47  0.0005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.87049  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4331  saccharopine dehydrogenase  22.22 
 
 		 379 aa  46.6  0.0007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3094  2-hydroxy-3-oxopropionate reductase  34.53 
 
 		 303 aa  45.8  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0518605 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1286  2-hydroxy-3-oxopropionate reductase  53.33 
 
 		 297 aa  45.8  0.001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.648289  normal  0.934383 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3638  6-phosphogluconate dehydrogenase NAD-binding  36.11 
 
 		 294 aa  45.8  0.001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.18665 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3051  TrkA-N:saccharopine dehydrogenase  24.64 
 
 		 393 aa  45.8  0.001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.995368  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1251  6-phosphogluconate dehydrogenase, NAD-binding  39.71 
 
 		 298 aa  45.8  0.001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1712  2-hydroxy-3-oxopropionate reductase  30.87 
 
 		 298 aa  45.8  0.001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.032164  normal  0.768061 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0002  Saccharopine dehydrogenase  27.54 
 
 		 360 aa  45.8  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.717423  hitchhiker  0.0043893 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1953  2-hydroxy-3-oxopropionate reductase  50 
 
 		 297 aa  45.8  0.001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0002  Saccharopine dehydrogenase  27.54 
 
 		 360 aa  45.1  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0292492 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2316  6-phosphogluconate dehydrogenase NAD-binding  54.76 
 
 		 355 aa  45.4  0.002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.16521 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000370  3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase  29.17 
 
 		 298 aa  44.7  0.002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.81552  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1160  3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase  48.72 
 
 		 295 aa  45.1  0.002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.206524  normal  0.0135112 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6125  2-hydroxy-3-oxopropionate reductase  50 
 
 		 264 aa  45.4  0.002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3695  6-phosphogluconate dehydrogenase, NAD-binding protein  31.09 
 
 		 272 aa  45.1  0.002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1940  2-hydroxy-3-oxopropionate reductase  55.56 
 
 		 297 aa  45.1  0.002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.300274  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3768  6-phosphogluconate dehydrogenase, NAD-binding  31.09 
 
 		 272 aa  45.1  0.002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.921478 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1316  2-hydroxy-3-oxopropionate reductase  55.56 
 
 		 296 aa  45.4  0.002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.823499  normal  0.0105684 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1243  saccharopine dehydrogenase  27.2 
 
 		 365 aa  44.7  0.003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2417  hypothetical protein  55.56 
 
 		 295 aa  44.3  0.004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3208  saccharopine dehydrogenase  23.53 
 
 		 397 aa  43.9  0.004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2308  hypothetical protein  24.74 
 
 		 366 aa  43.9  0.004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1254  hypothetical protein  25.15 
 
 		 376 aa  43.5  0.006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.413052  normal  0.0375347 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3351  2-hydroxy-3-oxopropionate reductase  34.11 
 
 		 303 aa  43.5  0.007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.561404  hitchhiker  0.00525216 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1536  saccharopine dehydrogenase  25.79 
 
 		 366 aa  43.1  0.007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.938044 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2920  saccharopine dehydrogenase  23.42 
 
 		 367 aa  43.1  0.008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2197  2-hydroxy-3-oxopropionate reductase  27.73 
 
 		 290 aa  43.1  0.009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000000206144  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2656  saccharopine dehydrogenase  25.95 
 
 		 373 aa  42.7  0.009  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2076  oxidoreductase  55.88 
 
 		 315 aa  43.1  0.009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1177  3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase  46.15 
 
 		 295 aa  42.7  0.01  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.383553  normal  0.478459 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4274  3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase  46.15 
 
 		 295 aa  42.7  0.01  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.347219  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2972  2-hydroxy-3-oxopropionate reductase  33.77 
 
 		 310 aa  42.7  0.01  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.856928  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1143  3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase  46.15 
 
 		 295 aa  42.7  0.01  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.200546 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>