37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHU_2707 on replicon NC_008255
Organism: Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008255  CHU_2707  saccharopine dehydrogenase  100 
 
 		 439 aa  914    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01665  saccharopine dehydrogenase, putative  42.38 
 
 		 456 aa  352  8.999999999999999e-96  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  decreased coverage  0.000853832  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1364  saccharopine dehydrogenase (NADP(+), L-lysine-forming)  40.95 
 
 		 454 aa  343  2.9999999999999997e-93  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5447  Saccharopine dehydrogenase (NAD(+), L-glutamate- forming)  40.13 
 
 		 441 aa  329  6e-89  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.205449  normal  1 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05601  saccharopine dehydrogenase (NADP+, L-glutamate-forming) (Eurofung)  30.2 
 
 		 450 aa  192  7e-48  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.404414  normal  1 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_70210  seventh step in lysine biosynthesis pathway  30.39 
 
 		 444 aa  191  2e-47  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.125717 
 
 
-
 
NC_006692  CNG01150  spermidine synthase, putative  29.86 
 
 		 748 aa  187  3e-46  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006670  CNA02370  saccharopine dehydrogenase (NADP+, L-glutamate-forming), putative  31.87 
 
 		 934 aa  177  4e-43  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.840978  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3542  Saccharopine dehydrogenase  28.83 
 
 		 382 aa  128  2.0000000000000002e-28  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0106  saccharopine dehydrogenase (NADP+, L-glutamate forming)  29.14 
 
 		 380 aa  122  9.999999999999999e-27  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_54394  saccharopine dehydrogenase  29.57 
 
 		 682 aa  114  4.0000000000000004e-24  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1047  saccharopine dehydrogenase  31.34 
 
 		 411 aa  110  7.000000000000001e-23  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.789456  normal  0.0319495 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1836  Saccharopine dehydrogenase  24.75 
 
 		 387 aa  86.7  7e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.973025 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1622  saccharopine dehydrogenase  24.49 
 
 		 348 aa  65.1  0.000000002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.871276  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0384  Saccharopine dehydrogenase  23.03 
 
 		 384 aa  63.2  0.000000009  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0854083  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0527  saccharopine dehydrogenase  23.81 
 
 		 347 aa  58.9  0.0000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1791  saccharopine dehydrogenase  23.01 
 
 		 392 aa  57.8  0.0000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.493672  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5033  Saccharopine dehydrogenase  22.66 
 
 		 354 aa  55.5  0.000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2611  Saccharopine dehydrogenase  27.54 
 
 		 413 aa  54.7  0.000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2420  Saccharopine dehydrogenase  24.04 
 
 		 354 aa  53.9  0.000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.870969  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0002  Saccharopine dehydrogenase  23.94 
 
 		 360 aa  52.8  0.00001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.717423  hitchhiker  0.0043893 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0647  saccharopine dehydrogenase  22.06 
 
 		 348 aa  52.8  0.00001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0002  Saccharopine dehydrogenase  23.55 
 
 		 360 aa  51.2  0.00003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0292492 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0633  hypothetical protein  23.33 
 
 		 367 aa  51.2  0.00004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.419888  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3051  TrkA-N:saccharopine dehydrogenase  21.79 
 
 		 393 aa  50.8  0.00005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.995368  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3712  saccharopine dehydrogenase  22.3 
 
 		 367 aa  50.1  0.00008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1254  hypothetical protein  21.74 
 
 		 376 aa  48.5  0.0002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.413052  normal  0.0375347 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1254  Saccharopine dehydrogenase  21.89 
 
 		 385 aa  45.4  0.002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5016  saccharopine dehydrogenase  22.96 
 
 		 366 aa  44.3  0.004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.288707  normal  0.105633 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0269  saccharopine dehydrogenase  22.95 
 
 		 385 aa  44.3  0.005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.901872  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1081  saccharopine dehydrogenase  25.17 
 
 		 399 aa  43.9  0.006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.706576  normal  0.0928318 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1645  saccharopine dehydrogenase  22.96 
 
 		 366 aa  43.1  0.009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.733408 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1737  saccharopine dehydrogenase  22.96 
 
 		 366 aa  43.1  0.009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.406485 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1723  saccharopine dehydrogenase  22.96 
 
 		 366 aa  43.1  0.009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1645  saccharopine dehydrogenase  22.96 
 
 		 366 aa  43.1  0.009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6355  saccharopine dehydrogenase  22.96 
 
 		 366 aa  43.1  0.009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3208  saccharopine dehydrogenase  20.92 
 
 		 397 aa  43.1  0.01  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>