23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_5447 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_5447  Saccharopine dehydrogenase (NAD(+), L-glutamate- forming)  100 
 
 		 441 aa  914    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.205449  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1364  saccharopine dehydrogenase (NADP(+), L-lysine-forming)  42.18 
 
 		 454 aa  360  2e-98  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01665  saccharopine dehydrogenase, putative  41.4 
 
 		 456 aa  348  9e-95  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  decreased coverage  0.000853832  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2707  saccharopine dehydrogenase  40.13 
 
 		 439 aa  329  6e-89  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_70210  seventh step in lysine biosynthesis pathway  31.9 
 
 		 444 aa  222  9.999999999999999e-57  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.125717 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05601  saccharopine dehydrogenase (NADP+, L-glutamate-forming) (Eurofung)  31.25 
 
 		 450 aa  217  2.9999999999999998e-55  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.404414  normal  1 
 
 
-
 
NC_006692  CNG01150  spermidine synthase, putative  30.05 
 
 		 748 aa  197  3e-49  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006670  CNA02370  saccharopine dehydrogenase (NADP+, L-glutamate-forming), putative  28.32 
 
 		 934 aa  185  1.0000000000000001e-45  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.840978  n/a   
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_54394  saccharopine dehydrogenase  31.76 
 
 		 682 aa  159  8e-38  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0106  saccharopine dehydrogenase (NADP+, L-glutamate forming)  31.1 
 
 		 380 aa  108  3e-22  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3542  Saccharopine dehydrogenase  29.24 
 
 		 382 aa  105  1e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1047  saccharopine dehydrogenase  34.15 
 
 		 411 aa  100  4e-20  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.789456  normal  0.0319495 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1836  Saccharopine dehydrogenase  22.99 
 
 		 387 aa  87  5e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.973025 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1622  saccharopine dehydrogenase  23.79 
 
 		 348 aa  58.2  0.0000003  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.871276  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0657  saccharopine dehydrogenase  26.07 
 
 		 346 aa  57.8  0.0000004  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0527  saccharopine dehydrogenase  23.74 
 
 		 347 aa  49.7  0.0001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1303  hypothetical protein  27.23 
 
 		 362 aa  48.5  0.0003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1304  hypothetical protein  27.23 
 
 		 362 aa  48.5  0.0003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2611  Saccharopine dehydrogenase  22.92 
 
 		 413 aa  46.6  0.0008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0647  saccharopine dehydrogenase  21.61 
 
 		 348 aa  45.4  0.002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3251  dehydrogenase  24.18 
 
 		 373 aa  44.3  0.004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.976387  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0384  Saccharopine dehydrogenase  21.18 
 
 		 384 aa  44.3  0.005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0854083  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1081  saccharopine dehydrogenase  25.2 
 
 		 399 aa  44.3  0.005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.706576  normal  0.0928318 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>