22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fjoh_1364 on replicon NC_009441
Organism: Flavobacterium johnsoniae UW101



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009441  Fjoh_1364  saccharopine dehydrogenase (NADP(+), L-lysine-forming)  100 
 
 
454 aa  939    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01665  saccharopine dehydrogenase, putative  71.02 
 
 
456 aa  691    Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  decreased coverage  0.000853832  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5447  Saccharopine dehydrogenase (NAD(+), L-glutamate- forming)  42.18 
 
 
441 aa  360  2e-98  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.205449  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2707  saccharopine dehydrogenase  40.95 
 
 
439 aa  343  2.9999999999999997e-93  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05601  saccharopine dehydrogenase (NADP+, L-glutamate-forming) (Eurofung)  35.15 
 
 
450 aa  252  8.000000000000001e-66  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.404414  normal 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_70210  seventh step in lysine biosynthesis pathway  33.19 
 
 
444 aa  228  1e-58  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.125717 
 
 
-
 
NC_006692  CNG01150  spermidine synthase, putative  31.26 
 
 
748 aa  226  4e-58  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006670  CNA02370  saccharopine dehydrogenase (NADP+, L-glutamate-forming), putative  30.79 
 
 
934 aa  202  7e-51  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.840978  n/a   
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_54394  saccharopine dehydrogenase  29.05 
 
 
682 aa  147  3e-34  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3542  Saccharopine dehydrogenase  25.34 
 
 
382 aa  127  4.0000000000000003e-28  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0106  saccharopine dehydrogenase (NADP+, L-glutamate forming)  28.46 
 
 
380 aa  113  6e-24  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1047  saccharopine dehydrogenase  29.64 
 
 
411 aa  105  2e-21  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.789456  normal  0.0319495 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1836  Saccharopine dehydrogenase  23.42 
 
 
387 aa  85.5  0.000000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.973025 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1303  hypothetical protein  24.71 
 
 
362 aa  55.8  0.000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1304  hypothetical protein  24.71 
 
 
362 aa  55.8  0.000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3712  saccharopine dehydrogenase  24.1 
 
 
367 aa  50.4  0.00006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0633  hypothetical protein  23.59 
 
 
367 aa  48.5  0.0002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.419888  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5033  Saccharopine dehydrogenase  25 
 
 
354 aa  47.8  0.0005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3251  dehydrogenase  23.16 
 
 
373 aa  47  0.0007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.976387  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2920  saccharopine dehydrogenase  20.74 
 
 
367 aa  46.2  0.001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1622  saccharopine dehydrogenase  21.72 
 
 
348 aa  44.3  0.005  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.871276  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0657  saccharopine dehydrogenase  22.73 
 
 
346 aa  43.1  0.01  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>