52 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CNA02370 on replicon NC_006670
Organism: Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006670  CNA02370  saccharopine dehydrogenase (NADP+, L-glutamate-forming), putative  100 
 
 
934 aa  1897    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.840978  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_70210  seventh step in lysine biosynthesis pathway  32.1 
 
 
444 aa  237  8e-61  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.125717 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05601  saccharopine dehydrogenase (NADP+, L-glutamate-forming) (Eurofung)  32.82 
 
 
450 aa  237  1.0000000000000001e-60  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.404414  normal 
 
 
-
 
NC_006692  CNG01150  spermidine synthase, putative  33.77 
 
 
748 aa  223  9.999999999999999e-57  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1364  saccharopine dehydrogenase (NADP(+), L-lysine-forming)  31.22 
 
 
454 aa  216  1.9999999999999998e-54  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01665  saccharopine dehydrogenase, putative  31.25 
 
 
456 aa  205  3e-51  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  decreased coverage  0.000853832  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5447  Saccharopine dehydrogenase (NAD(+), L-glutamate- forming)  28.32 
 
 
441 aa  189  2e-46  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.205449  normal 
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_54394  saccharopine dehydrogenase  32.81 
 
 
682 aa  186  2.0000000000000003e-45  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2707  saccharopine dehydrogenase  31.88 
 
 
439 aa  178  4e-43  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3542  Saccharopine dehydrogenase  39.9 
 
 
382 aa  124  6e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3374  alanine dehydrogenase/PNT domain protein  27.19 
 
 
401 aa  122  1.9999999999999998e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.200237  normal  0.0897207 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3369  hypothetical protein  28.25 
 
 
408 aa  120  9.999999999999999e-26  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0502916  normal  0.14183 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4787  NAD(P) transhydrogenase subunit alpha  26.3 
 
 
400 aa  117  8.999999999999998e-25  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1836  Saccharopine dehydrogenase  30.77 
 
 
387 aa  116  2.0000000000000002e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.973025 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0106  saccharopine dehydrogenase (NADP+, L-glutamate forming)  35.41 
 
 
380 aa  116  2.0000000000000002e-24  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00210  hypothetical saccharopine dehydrogenase  26.98 
 
 
404 aa  107  1e-21  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.570746  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1047  saccharopine dehydrogenase  35.92 
 
 
411 aa  104  7e-21  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.789456  normal  0.0319495 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2709  NAD(P) transhydrogenase subunit alpha  30.86 
 
 
351 aa  71.6  0.00000000007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0107  saccharopine dehydrogenase (NAD+, L-lysine-forming)  25.49 
 
 
350 aa  70.1  0.0000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1791  saccharopine dehydrogenase  23.05 
 
 
392 aa  62  0.00000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.493672  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3541  alanine dehydrogenase/PNT domain protein  28.64 
 
 
345 aa  62  0.00000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2749  NAD(P) transhydrogenase subunit alpha  27.3 
 
 
351 aa  60.1  0.0000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.347882  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1086  saccharopine dehydrogenase (NAD+, L-lysine-forming)  27.3 
 
 
351 aa  60.1  0.0000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_86170  Saccharopine dehydrogenase [NAD+, L-lysine-forming] (Lysine--2-oxoglutarate reductase) (SDH)  26.52 
 
 
371 aa  56.2  0.000003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1048  NAD(P) transhydrogenase subunit alpha  23.72 
 
 
359 aa  53.9  0.00001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.251504  normal  0.0283981 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2942  saccharopine dehydrogenase (NAD(+), L-lysine-forming)  26.87 
 
 
351 aa  52.8  0.00003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.733159  normal  0.206684 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1622  saccharopine dehydrogenase  25.24 
 
 
348 aa  52  0.00005  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.871276  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1254  hypothetical protein  23.29 
 
 
376 aa  51.6  0.00006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.413052  normal  0.0375347 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5033  Saccharopine dehydrogenase  23.63 
 
 
354 aa  52  0.00006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1303  hypothetical protein  23.81 
 
 
362 aa  51.2  0.00009  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4015  saccharopine dehydrogenase (NAD+, L-lysine-forming)  23.3 
 
 
350 aa  51.2  0.00009  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.874849  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1304  hypothetical protein  23.81 
 
 
362 aa  51.2  0.00009  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1846  Saccharopine dehydrogenase  22.73 
 
 
389 aa  50.8  0.0001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2037  saccharopine dehydrogenase  24.28 
 
 
389 aa  49.7  0.0002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02873  Saccharopine dehydrogenase [NAD+, L-lysine-forming] (SDH)(EC 1.5.1.7)(Lysine--2-oxoglutarate reductase) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q870G1]  24.07 
 
 
375 aa  50.1  0.0002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.799324  normal  0.756333 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0527  saccharopine dehydrogenase  28.04 
 
 
347 aa  49.7  0.0003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0173  NAD(P)(+) transhydrogenase (AB-specific)  26.02 
 
 
390 aa  49.3  0.0003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0214  NAD(P)(+) transhydrogenase (AB-specific)  26.02 
 
 
390 aa  49.3  0.0003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1272  alanine dehydrogenase  29.17 
 
 
371 aa  48.9  0.0004  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1254  Saccharopine dehydrogenase  24.64 
 
 
385 aa  48.1  0.0007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2611  Saccharopine dehydrogenase  19.19 
 
 
413 aa  48.1  0.0007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006686  CND06290  saccharopine dehydrogenase (NAD+, L-lysine-forming), putative  25.97 
 
 
395 aa  46.6  0.002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.699378  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3051  TrkA-N:saccharopine dehydrogenase  20.6 
 
 
393 aa  47  0.002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.995368  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3251  dehydrogenase  21.53 
 
 
373 aa  46.2  0.003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.976387  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3712  saccharopine dehydrogenase  22 
 
 
367 aa  46.2  0.003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2420  Saccharopine dehydrogenase  24.74 
 
 
354 aa  45.4  0.005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.870969  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2920  saccharopine dehydrogenase  20 
 
 
367 aa  45.4  0.005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27310  alanine dehydrogenase  33.33 
 
 
387 aa  45.4  0.005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.301898 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0633  hypothetical protein  20 
 
 
367 aa  45.1  0.006  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.419888  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1800  alanine dehydrogenase  28.03 
 
 
372 aa  44.7  0.009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1765  alanine dehydrogenase  28.03 
 
 
372 aa  44.7  0.009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3208  saccharopine dehydrogenase  21.74 
 
 
397 aa  44.3  0.01  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>