20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CA2559_01665 on replicon NC_014230
Organism: Croceibacter atlanticus HTCC2559



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014230  CA2559_01665  saccharopine dehydrogenase, putative  100 
 
 		 456 aa  947    Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  decreased coverage  0.000853832  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1364  saccharopine dehydrogenase (NADP(+), L-lysine-forming)  71.02 
 
 		 454 aa  691    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2707  saccharopine dehydrogenase  42.38 
 
 		 439 aa  352  1e-95  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5447  Saccharopine dehydrogenase (NAD(+), L-glutamate- forming)  41.4 
 
 		 441 aa  348  9e-95  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.205449  normal  1 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05601  saccharopine dehydrogenase (NADP+, L-glutamate-forming) (Eurofung)  35.65 
 
 		 450 aa  257  3e-67  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.404414  normal  1 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_70210  seventh step in lysine biosynthesis pathway  32.97 
 
 		 444 aa  231  2e-59  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.125717 
 
 
-
 
NC_006692  CNG01150  spermidine synthase, putative  28.79 
 
 		 748 aa  199  1.0000000000000001e-49  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006670  CNA02370  saccharopine dehydrogenase (NADP+, L-glutamate-forming), putative  30.69 
 
 		 934 aa  197  3e-49  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.840978  n/a   
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_54394  saccharopine dehydrogenase  28.7 
 
 		 682 aa  142  9.999999999999999e-33  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3542  Saccharopine dehydrogenase  27.76 
 
 		 382 aa  127  5e-28  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1047  saccharopine dehydrogenase  28.85 
 
 		 411 aa  108  3e-22  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.789456  normal  0.0319495 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0106  saccharopine dehydrogenase (NADP+, L-glutamate forming)  31.58 
 
 		 380 aa  107  4e-22  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1836  Saccharopine dehydrogenase  24.55 
 
 		 387 aa  97.1  6e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.973025 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1622  saccharopine dehydrogenase  24.09 
 
 		 348 aa  62.4  0.00000002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.871276  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5033  Saccharopine dehydrogenase  25.75 
 
 		 354 aa  52.8  0.00001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0657  saccharopine dehydrogenase  22.02 
 
 		 346 aa  48.9  0.0002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2611  Saccharopine dehydrogenase  21.94 
 
 		 413 aa  47  0.0006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0527  saccharopine dehydrogenase  21.67 
 
 		 347 aa  47  0.0008  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0647  saccharopine dehydrogenase  23.42 
 
 		 348 aa  45.4  0.002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1254  Saccharopine dehydrogenase  23.05 
 
 		 385 aa  44.3  0.005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>