58 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_5033 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_5033  Saccharopine dehydrogenase  100 
 
 		 354 aa  735    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2420  Saccharopine dehydrogenase  60.97 
 
 		 354 aa  454  1.0000000000000001e-126  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.870969  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0002  Saccharopine dehydrogenase  55.87 
 
 		 360 aa  404  1.0000000000000001e-112  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0292492 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0002  Saccharopine dehydrogenase  55.3 
 
 		 360 aa  404  1e-111  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.717423  hitchhiker  0.0043893 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3712  saccharopine dehydrogenase  43.89 
 
 		 367 aa  313  3.9999999999999997e-84  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0633  hypothetical protein  43.09 
 
 		 367 aa  311  2e-83  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.419888  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3947  Saccharopine dehydrogenase  43.09 
 
 		 379 aa  297  2e-79  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.35469  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1936  saccharopine dehydrogenase  42.42 
 
 		 392 aa  292  7e-78  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2920  saccharopine dehydrogenase  41.44 
 
 		 367 aa  290  4e-77  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2656  saccharopine dehydrogenase  42.25 
 
 		 373 aa  287  2e-76  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3051  TrkA-N:saccharopine dehydrogenase  43.29 
 
 		 393 aa  286  2.9999999999999996e-76  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.995368  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1243  saccharopine dehydrogenase  41.69 
 
 		 365 aa  286  4e-76  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1992  putative saccharopine dehydrogenase, NAD-binding  41.97 
 
 		 365 aa  285  8e-76  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.899138  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3251  dehydrogenase  40.73 
 
 		 373 aa  283  4.0000000000000003e-75  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.976387  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2268  Saccharopine dehydrogenase  41.41 
 
 		 365 aa  281  1e-74  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.87049  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2080  saccharopine dehydrogenase  42.82 
 
 		 366 aa  279  4e-74  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.599315  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2269  saccharopine dehydrogenase  42.82 
 
 		 366 aa  279  4e-74  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.044171  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2155  saccharopine dehydrogenase  41.62 
 
 		 367 aa  279  5e-74  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0269  saccharopine dehydrogenase  42.33 
 
 		 385 aa  279  5e-74  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.901872  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0976  hypothetical protein  42.54 
 
 		 366 aa  279  6e-74  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.175424  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2136  saccharopine dehydrogenase  42.54 
 
 		 366 aa  279  6e-74  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.112826  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2308  hypothetical protein  42.25 
 
 		 366 aa  276  3e-73  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1536  saccharopine dehydrogenase  40.85 
 
 		 366 aa  273  3e-72  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.938044 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5587  Saccharopine dehydrogenase  42.78 
 
 		 376 aa  272  5.000000000000001e-72  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0890714  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1645  saccharopine dehydrogenase  41.13 
 
 		 366 aa  272  6e-72  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1645  saccharopine dehydrogenase  41.13 
 
 		 366 aa  272  6e-72  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.733408 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1723  saccharopine dehydrogenase  41.13 
 
 		 366 aa  272  8.000000000000001e-72  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6355  saccharopine dehydrogenase  41.13 
 
 		 366 aa  272  8.000000000000001e-72  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1737  saccharopine dehydrogenase  41.13 
 
 		 366 aa  272  8.000000000000001e-72  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.406485 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5016  saccharopine dehydrogenase  40.85 
 
 		 366 aa  271  1e-71  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.288707  normal  0.105633 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1846  Saccharopine dehydrogenase  42.21 
 
 		 389 aa  271  1e-71  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1254  hypothetical protein  41.88 
 
 		 376 aa  271  1e-71  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.413052  normal  0.0375347 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2037  saccharopine dehydrogenase  42.02 
 
 		 389 aa  270  2e-71  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0566  saccharopine dehydrogenase  41.87 
 
 		 385 aa  269  5e-71  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.411174 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4331  saccharopine dehydrogenase  41.83 
 
 		 379 aa  264  1e-69  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3208  saccharopine dehydrogenase  41.89 
 
 		 397 aa  264  1e-69  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1303  hypothetical protein  39.61 
 
 		 362 aa  258  9e-68  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1304  hypothetical protein  39.61 
 
 		 362 aa  258  9e-68  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2810  saccharopine dehydrogenase  40.06 
 
 		 380 aa  239  4e-62  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.111095  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1791  saccharopine dehydrogenase  29.92 
 
 		 392 aa  133  5e-30  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.493672  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2611  Saccharopine dehydrogenase  31.78 
 
 		 413 aa  127  2.0000000000000002e-28  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1622  saccharopine dehydrogenase  31.02 
 
 		 348 aa  125  1e-27  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.871276  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0384  Saccharopine dehydrogenase  26.58 
 
 		 384 aa  119  7e-26  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0854083  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1254  Saccharopine dehydrogenase  27.57 
 
 		 385 aa  117  1.9999999999999998e-25  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0647  saccharopine dehydrogenase  31.45 
 
 		 348 aa  111  2.0000000000000002e-23  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0527  saccharopine dehydrogenase  29.71 
 
 		 347 aa  108  1e-22  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0657  saccharopine dehydrogenase  29.75 
 
 		 346 aa  106  7e-22  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1035  saccharopine dehydrogenase  23.16 
 
 		 369 aa  68.9  0.0000000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.002622 
 
 
-
 
NC_006692  CNG01150  spermidine synthase, putative  22.08 
 
 		 748 aa  55.8  0.000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2707  saccharopine dehydrogenase  22.66 
 
 		 439 aa  55.5  0.000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01665  saccharopine dehydrogenase, putative  25.75 
 
 		 456 aa  52.8  0.00001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  decreased coverage  0.000853832  n/a   
 
 
-
 
NC_006670  CNA02370  saccharopine dehydrogenase (NADP+, L-glutamate-forming), putative  23.63 
 
 		 934 aa  52.4  0.00001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.840978  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_70210  seventh step in lysine biosynthesis pathway  23.83 
 
 		 444 aa  52.4  0.00001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.125717 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05601  saccharopine dehydrogenase (NADP+, L-glutamate-forming) (Eurofung)  22.78 
 
 		 450 aa  49.7  0.00007  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.404414  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0106  saccharopine dehydrogenase (NADP+, L-glutamate forming)  25.56 
 
 		 380 aa  48.1  0.0002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1364  saccharopine dehydrogenase (NADP(+), L-lysine-forming)  25 
 
 		 454 aa  47.8  0.0003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_54394  saccharopine dehydrogenase  23.44 
 
 		 682 aa  45.8  0.001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3542  Saccharopine dehydrogenase  23.99 
 
 		 382 aa  45.1  0.002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>