125 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmar_2611 on replicon NC_013501
Organism: Rhodothermus marinus DSM 4252



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013501  Rmar_2611  Saccharopine dehydrogenase  100 
 
 		 413 aa  846    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1254  Saccharopine dehydrogenase  33.68 
 
 		 385 aa  218  2e-55  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0384  Saccharopine dehydrogenase  32.55 
 
 		 384 aa  214  1.9999999999999998e-54  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0854083  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1791  saccharopine dehydrogenase  30.55 
 
 		 392 aa  210  4e-53  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.493672  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1254  hypothetical protein  31.8 
 
 		 376 aa  148  2.0000000000000003e-34  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.413052  normal  0.0375347 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1243  saccharopine dehydrogenase  30.85 
 
 		 365 aa  145  1e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3712  saccharopine dehydrogenase  31.02 
 
 		 367 aa  144  3e-33  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0633  hypothetical protein  29.53 
 
 		 367 aa  142  7e-33  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.419888  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6355  saccharopine dehydrogenase  30.49 
 
 		 366 aa  140  6e-32  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1723  saccharopine dehydrogenase  30.49 
 
 		 366 aa  140  6e-32  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1737  saccharopine dehydrogenase  30.49 
 
 		 366 aa  140  6e-32  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.406485 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5016  saccharopine dehydrogenase  30.49 
 
 		 366 aa  139  7.999999999999999e-32  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.288707  normal  0.105633 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1992  putative saccharopine dehydrogenase, NAD-binding  30.29 
 
 		 365 aa  139  1e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.899138  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1536  saccharopine dehydrogenase  30.49 
 
 		 366 aa  138  1e-31  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.938044 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2268  Saccharopine dehydrogenase  31.06 
 
 		 365 aa  139  1e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.87049  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1645  saccharopine dehydrogenase  30.22 
 
 		 366 aa  138  2e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1645  saccharopine dehydrogenase  30.22 
 
 		 366 aa  138  2e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.733408 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0976  hypothetical protein  32.9 
 
 		 366 aa  136  7.000000000000001e-31  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.175424  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2136  saccharopine dehydrogenase  32.9 
 
 		 366 aa  136  7.000000000000001e-31  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.112826  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2269  saccharopine dehydrogenase  32.57 
 
 		 366 aa  135  9.999999999999999e-31  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.044171  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2080  saccharopine dehydrogenase  32.57 
 
 		 366 aa  135  9.999999999999999e-31  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.599315  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2308  hypothetical protein  31.92 
 
 		 366 aa  134  3.9999999999999996e-30  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1622  saccharopine dehydrogenase  28.28 
 
 		 348 aa  134  3.9999999999999996e-30  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.871276  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3251  dehydrogenase  30.46 
 
 		 373 aa  133  6e-30  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.976387  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2920  saccharopine dehydrogenase  33.46 
 
 		 367 aa  132  1.0000000000000001e-29  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1936  saccharopine dehydrogenase  30.21 
 
 		 392 aa  130  3e-29  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2656  saccharopine dehydrogenase  30.25 
 
 		 373 aa  128  1.0000000000000001e-28  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5033  Saccharopine dehydrogenase  31.78 
 
 		 354 aa  127  3e-28  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0566  saccharopine dehydrogenase  29.16 
 
 		 385 aa  127  4.0000000000000003e-28  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.411174 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1304  hypothetical protein  30.07 
 
 		 362 aa  126  7e-28  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1303  hypothetical protein  30.07 
 
 		 362 aa  126  7e-28  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1846  Saccharopine dehydrogenase  36.18 
 
 		 389 aa  126  7e-28  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2037  saccharopine dehydrogenase  35.77 
 
 		 389 aa  123  5e-27  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0269  saccharopine dehydrogenase  32.03 
 
 		 385 aa  121  1.9999999999999998e-26  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.901872  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0527  saccharopine dehydrogenase  31.27 
 
 		 347 aa  120  3e-26  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1035  saccharopine dehydrogenase  26.4 
 
 		 369 aa  120  3.9999999999999996e-26  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.002622 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4331  saccharopine dehydrogenase  27.03 
 
 		 379 aa  117  6e-25  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2420  Saccharopine dehydrogenase  25.41 
 
 		 354 aa  116  6e-25  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.870969  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0647  saccharopine dehydrogenase  28.08 
 
 		 348 aa  115  1.0000000000000001e-24  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2810  saccharopine dehydrogenase  32.46 
 
 		 380 aa  114  2.0000000000000002e-24  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.111095  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5587  Saccharopine dehydrogenase  32.68 
 
 		 376 aa  115  2.0000000000000002e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0890714  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3051  TrkA-N:saccharopine dehydrogenase  32.43 
 
 		 393 aa  113  8.000000000000001e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.995368  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0657  saccharopine dehydrogenase  27.25 
 
 		 346 aa  112  2.0000000000000002e-23  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1835  Saccharopine dehydrogenase  23.81 
 
 		 398 aa  108  2e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.257501  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0002  Saccharopine dehydrogenase  28 
 
 		 360 aa  108  3e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.717423  hitchhiker  0.0043893 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3208  saccharopine dehydrogenase  30.89 
 
 		 397 aa  107  4e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0002  Saccharopine dehydrogenase  28 
 
 		 360 aa  107  5e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0292492 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2155  saccharopine dehydrogenase  32.03 
 
 		 367 aa  105  1e-21  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3947  Saccharopine dehydrogenase  27.06 
 
 		 379 aa  102  1e-20  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.35469  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5058  saccharopine dehydrogenase  22.75 
 
 		 369 aa  75.9  0.000000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4394  saccharopine dehydrogenase  22.73 
 
 		 384 aa  73.2  0.000000000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000130212 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1836  Saccharopine dehydrogenase  23.27 
 
 		 387 aa  71.2  0.00000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.973025 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1081  saccharopine dehydrogenase  21.72 
 
 		 399 aa  71.6  0.00000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.706576  normal  0.0928318 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3651  Saccharopine dehydrogenase  22.4 
 
 		 367 aa  71.6  0.00000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1922  saccharopine dehydrogenase  23.85 
 
 		 392 aa  70.9  0.00000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00339893 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0572  saccharopine dehydrogenase  21.8 
 
 		 398 aa  70.1  0.00000000007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1242  saccharopine dehydrogenase  20.78 
 
 		 394 aa  67.8  0.0000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1482  hypothetical protein  21.05 
 
 		 394 aa  67  0.0000000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1950  hypothetical protein  22.94 
 
 		 408 aa  66.6  0.0000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.275408  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3965  hypothetical protein  20.99 
 
 		 394 aa  65.9  0.000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1379  hypothetical protein  20.26 
 
 		 394 aa  65.5  0.000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1241  hypothetical protein  20.22 
 
 		 394 aa  64.7  0.000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1217  saccharopine dehydrogenase, NADP+, L-lysine forming; L-lysine dehydrogenase  20.22 
 
 		 394 aa  64.7  0.000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1342  hypothetical protein  20.22 
 
 		 394 aa  64.7  0.000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1416  hypothetical protein  20.22 
 
 		 394 aa  64.7  0.000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.572078 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1441  hypothetical protein  19.94 
 
 		 394 aa  63.2  0.000000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2320  Saccharopine dehydrogenase  20 
 
 		 396 aa  62.4  0.00000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0148  Saccharopine dehydrogenase  21.61 
 
 		 409 aa  61.2  0.00000003  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1202  saccharopine dehydrogenase  22.47 
 
 		 403 aa  60.8  0.00000004  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1219  saccharopine dehydrogenase, NADP+, L-lysine forming; L-lysine dehydrogenase  20.22 
 
 		 394 aa  60.5  0.00000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.182404  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0748  saccharopine dehydrogenase  21.28 
 
 		 400 aa  60.5  0.00000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1555  Saccharopine dehydrogenase  20.92 
 
 		 401 aa  59.3  0.0000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000142738  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4946  saccharopine dehydrogenase  23.39 
 
 		 407 aa  58.9  0.0000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5034  saccharopine dehydrogenase  23.39 
 
 		 407 aa  58.9  0.0000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1128  Saccharopine dehydrogenase  21.84 
 
 		 399 aa  58.9  0.0000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.785881  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5327  saccharopine dehydrogenase  23.21 
 
 		 407 aa  57.8  0.0000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0356987  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0061  saccharopine dehydrogenase  19.49 
 
 		 403 aa  57.4  0.0000004  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0677  saccharopine dehydrogenase  20.87 
 
 		 397 aa  56.6  0.0000008  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.10466 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2516  saccharopine dehydrogenase  20.72 
 
 		 396 aa  56.2  0.000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.558897  normal  0.297438 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3052  saccharopine dehydrogenase  19.81 
 
 		 399 aa  55.5  0.000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1535  Saccharopine dehydrogenase  21.5 
 
 		 396 aa  55.1  0.000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.82797 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2707  saccharopine dehydrogenase  27.54 
 
 		 439 aa  54.7  0.000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0914  putative saccharopine dehydrogenase family protein  19.54 
 
 		 424 aa  53.1  0.000008  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.867111  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6504  Saccharopine dehydrogenase  23.04 
 
 		 395 aa  53.1  0.000009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.752719  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3519  Saccharopine dehydrogenase  20.34 
 
 		 405 aa  52.8  0.00001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.368548  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2888  Saccharopine dehydrogenase  25.84 
 
 		 403 aa  52.8  0.00001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.120454 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1501  saccharopine dehydrogenase  19.31 
 
 		 424 aa  51.6  0.00003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0999  saccharopine dehydrogenase  20.64 
 
 		 405 aa  51.6  0.00003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0445398  hitchhiker  0.00533099 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1148  saccharopine dehydrogenase  31.25 
 
 		 325 aa  51.2  0.00004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4157  saccharopine dehydrogenase  21.96 
 
 		 413 aa  50.4  0.00005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.152115  normal  0.83779 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2539  saccharopine dehydrogenase  20.54 
 
 		 398 aa  50.1  0.00008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1495  Saccharopine dehydrogenase  26.58 
 
 		 376 aa  49.7  0.00009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.0000691069  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1715  saccharopine dehydrogenase  22.48 
 
 		 422 aa  49.3  0.0001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  unclonable  0.000000000659439  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5844  hypothetical protein  19.81 
 
 		 413 aa  49.7  0.0001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006670  CNA02370  saccharopine dehydrogenase (NADP+, L-glutamate-forming), putative  19.19 
 
 		 934 aa  48.1  0.0003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.840978  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4315  saccharopine dehydrogenase  25.79 
 
 		 378 aa  48.1  0.0003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.224112  normal  0.228939 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1941  Saccharopine dehydrogenase  24.58 
 
 		 446 aa  48.1  0.0003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1790  saccharopine dehydrogenase  20.87 
 
 		 401 aa  47.8  0.0004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0106  saccharopine dehydrogenase (NADP+, L-glutamate forming)  25.14 
 
 		 380 aa  47.4  0.0004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0438  saccharopine dehydrogenase  19.91 
 
 		 426 aa  47.4  0.0005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0417875  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>