57 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_4331 on replicon NC_007948
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012792  Vapar_5587  Saccharopine dehydrogenase  83.91 
 
 		 376 aa  634    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0890714  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4331  saccharopine dehydrogenase  100 
 
 		 379 aa  773    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0566  saccharopine dehydrogenase  74.73 
 
 		 385 aa  547  1e-154  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.411174 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3712  saccharopine dehydrogenase  48.6 
 
 		 367 aa  355  6.999999999999999e-97  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0633  hypothetical protein  47.47 
 
 		 367 aa  348  1e-94  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.419888  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1243  saccharopine dehydrogenase  47.12 
 
 		 365 aa  342  5e-93  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2656  saccharopine dehydrogenase  45.63 
 
 		 373 aa  338  8e-92  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1992  putative saccharopine dehydrogenase, NAD-binding  47.67 
 
 		 365 aa  336  2.9999999999999997e-91  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.899138  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2268  Saccharopine dehydrogenase  47.11 
 
 		 365 aa  335  7.999999999999999e-91  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.87049  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1936  saccharopine dehydrogenase  46.93 
 
 		 392 aa  331  1e-89  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3947  Saccharopine dehydrogenase  47.62 
 
 		 379 aa  329  5.0000000000000004e-89  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.35469  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0269  saccharopine dehydrogenase  48.9 
 
 		 385 aa  325  1e-87  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.901872  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2920  saccharopine dehydrogenase  45.81 
 
 		 367 aa  325  1e-87  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2155  saccharopine dehydrogenase  50.42 
 
 		 367 aa  324  1e-87  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1846  Saccharopine dehydrogenase  47.33 
 
 		 389 aa  322  5e-87  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5016  saccharopine dehydrogenase  45.71 
 
 		 366 aa  320  1.9999999999999998e-86  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.288707  normal  0.105633 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3251  dehydrogenase  43.84 
 
 		 373 aa  320  3e-86  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.976387  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1536  saccharopine dehydrogenase  45.71 
 
 		 366 aa  320  3e-86  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.938044 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1645  saccharopine dehydrogenase  45.43 
 
 		 366 aa  318  7.999999999999999e-86  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1254  hypothetical protein  48.32 
 
 		 376 aa  318  7.999999999999999e-86  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.413052  normal  0.0375347 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1645  saccharopine dehydrogenase  45.43 
 
 		 366 aa  318  7.999999999999999e-86  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.733408 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2308  hypothetical protein  44.6 
 
 		 366 aa  318  9e-86  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1737  saccharopine dehydrogenase  45.43 
 
 		 366 aa  318  1e-85  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.406485 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2080  saccharopine dehydrogenase  45.15 
 
 		 366 aa  318  1e-85  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.599315  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2136  saccharopine dehydrogenase  44.88 
 
 		 366 aa  318  1e-85  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.112826  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2269  saccharopine dehydrogenase  45.15 
 
 		 366 aa  318  1e-85  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.044171  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0976  hypothetical protein  44.88 
 
 		 366 aa  318  1e-85  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.175424  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6355  saccharopine dehydrogenase  45.43 
 
 		 366 aa  318  1e-85  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1723  saccharopine dehydrogenase  45.43 
 
 		 366 aa  318  1e-85  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2037  saccharopine dehydrogenase  46.67 
 
 		 389 aa  317  2e-85  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3051  TrkA-N:saccharopine dehydrogenase  48.77 
 
 		 393 aa  315  6e-85  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.995368  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3208  saccharopine dehydrogenase  49.19 
 
 		 397 aa  305  1.0000000000000001e-81  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2810  saccharopine dehydrogenase  43.26 
 
 		 380 aa  294  2e-78  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.111095  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1304  hypothetical protein  40.56 
 
 		 362 aa  286  5e-76  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1303  hypothetical protein  40.56 
 
 		 362 aa  286  5e-76  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2420  Saccharopine dehydrogenase  41.13 
 
 		 354 aa  283  4.0000000000000003e-75  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.870969  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0002  Saccharopine dehydrogenase  41.53 
 
 		 360 aa  275  1.0000000000000001e-72  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0292492 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0002  Saccharopine dehydrogenase  41.37 
 
 		 360 aa  274  2.0000000000000002e-72  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.717423  hitchhiker  0.0043893 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5033  Saccharopine dehydrogenase  41.83 
 
 		 354 aa  264  2e-69  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0384  Saccharopine dehydrogenase  29.6 
 
 		 384 aa  132  1.0000000000000001e-29  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0854083  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1254  Saccharopine dehydrogenase  30.79 
 
 		 385 aa  130  3e-29  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1791  saccharopine dehydrogenase  30.54 
 
 		 392 aa  118  9.999999999999999e-26  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.493672  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2611  Saccharopine dehydrogenase  27.03 
 
 		 413 aa  117  5e-25  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1622  saccharopine dehydrogenase  27.2 
 
 		 348 aa  111  2.0000000000000002e-23  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.871276  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0527  saccharopine dehydrogenase  29.34 
 
 		 347 aa  105  1e-21  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0657  saccharopine dehydrogenase  30.08 
 
 		 346 aa  102  8e-21  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0647  saccharopine dehydrogenase  27.27 
 
 		 348 aa  98.2  2e-19  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1035  saccharopine dehydrogenase  25.94 
 
 		 369 aa  70.9  0.00000000003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.002622 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_70210  seventh step in lysine biosynthesis pathway  24.24 
 
 		 444 aa  58.2  0.0000003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.125717 
 
 
-
 
NC_006692  CNG01150  spermidine synthase, putative  25.63 
 
 		 748 aa  50.8  0.00004  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0572  saccharopine dehydrogenase  22.85 
 
 		 388 aa  48.1  0.0003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.20382 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0106  saccharopine dehydrogenase (NADP+, L-glutamate forming)  22.22 
 
 		 380 aa  46.6  0.0007  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1835  Saccharopine dehydrogenase  22.93 
 
 		 398 aa  45.8  0.001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.257501  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0677  saccharopine dehydrogenase  25.58 
 
 		 397 aa  46.2  0.001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.10466 
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_54394  saccharopine dehydrogenase  26.39 
 
 		 682 aa  45.1  0.002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0148  Saccharopine dehydrogenase  27.56 
 
 		 409 aa  43.9  0.005  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4315  saccharopine dehydrogenase  25.82 
 
 		 378 aa  43.5  0.007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.224112  normal  0.228939 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>