55 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lcho_0566 on replicon NC_010524
Organism: Leptothrix cholodnii SP-6



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010524  Lcho_0566  saccharopine dehydrogenase  100 
 
 		 385 aa  775    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.411174 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4331  saccharopine dehydrogenase  74.73 
 
 		 379 aa  558  1e-158  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5587  Saccharopine dehydrogenase  73.88 
 
 		 376 aa  540  9.999999999999999e-153  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0890714  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3712  saccharopine dehydrogenase  47.65 
 
 		 367 aa  350  3e-95  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1243  saccharopine dehydrogenase  50.28 
 
 		 365 aa  348  1e-94  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0633  hypothetical protein  47.93 
 
 		 367 aa  345  8e-94  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.419888  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3947  Saccharopine dehydrogenase  51.93 
 
 		 379 aa  344  2e-93  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.35469  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1936  saccharopine dehydrogenase  50 
 
 		 392 aa  343  2.9999999999999997e-93  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2268  Saccharopine dehydrogenase  51.25 
 
 		 365 aa  342  5.999999999999999e-93  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.87049  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1992  putative saccharopine dehydrogenase, NAD-binding  50.56 
 
 		 365 aa  338  9.999999999999999e-92  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.899138  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2656  saccharopine dehydrogenase  46.8 
 
 		 373 aa  331  1e-89  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2155  saccharopine dehydrogenase  50.97 
 
 		 367 aa  330  3e-89  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1254  hypothetical protein  47.63 
 
 		 376 aa  325  7e-88  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.413052  normal  0.0375347 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0269  saccharopine dehydrogenase  52.89 
 
 		 385 aa  325  9e-88  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.901872  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1536  saccharopine dehydrogenase  47.62 
 
 		 366 aa  324  2e-87  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.938044 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5016  saccharopine dehydrogenase  47.34 
 
 		 366 aa  323  3e-87  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.288707  normal  0.105633 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2920  saccharopine dehydrogenase  45.86 
 
 		 367 aa  322  5e-87  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1645  saccharopine dehydrogenase  47.06 
 
 		 366 aa  322  9.000000000000001e-87  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1645  saccharopine dehydrogenase  47.06 
 
 		 366 aa  322  9.000000000000001e-87  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.733408 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1737  saccharopine dehydrogenase  47.06 
 
 		 366 aa  321  9.999999999999999e-87  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.406485 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6355  saccharopine dehydrogenase  47.06 
 
 		 366 aa  321  9.999999999999999e-87  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1723  saccharopine dehydrogenase  47.06 
 
 		 366 aa  321  9.999999999999999e-87  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2080  saccharopine dehydrogenase  47.06 
 
 		 366 aa  321  1.9999999999999998e-86  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.599315  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2269  saccharopine dehydrogenase  47.06 
 
 		 366 aa  321  1.9999999999999998e-86  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.044171  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0976  hypothetical protein  46.78 
 
 		 366 aa  320  3e-86  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.175424  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2136  saccharopine dehydrogenase  46.78 
 
 		 366 aa  320  3e-86  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.112826  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2308  hypothetical protein  47.06 
 
 		 366 aa  320  3e-86  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1846  Saccharopine dehydrogenase  49.87 
 
 		 389 aa  318  9e-86  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3251  dehydrogenase  42.29 
 
 		 373 aa  313  3.9999999999999997e-84  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.976387  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2037  saccharopine dehydrogenase  49.6 
 
 		 389 aa  312  6.999999999999999e-84  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3051  TrkA-N:saccharopine dehydrogenase  49.73 
 
 		 393 aa  311  1e-83  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.995368  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2810  saccharopine dehydrogenase  46.11 
 
 		 380 aa  301  2e-80  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.111095  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1303  hypothetical protein  43.24 
 
 		 362 aa  295  6e-79  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1304  hypothetical protein  43.24 
 
 		 362 aa  295  6e-79  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3208  saccharopine dehydrogenase  50.13 
 
 		 397 aa  293  4e-78  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2420  Saccharopine dehydrogenase  40.56 
 
 		 354 aa  288  8e-77  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.870969  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5033  Saccharopine dehydrogenase  41.87 
 
 		 354 aa  277  2e-73  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0002  Saccharopine dehydrogenase  40.83 
 
 		 360 aa  269  5e-71  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0292492 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0002  Saccharopine dehydrogenase  40.56 
 
 		 360 aa  268  1e-70  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.717423  hitchhiker  0.0043893 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1254  Saccharopine dehydrogenase  31.37 
 
 		 385 aa  133  6.999999999999999e-30  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1791  saccharopine dehydrogenase  33.45 
 
 		 392 aa  132  7.999999999999999e-30  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.493672  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2611  Saccharopine dehydrogenase  29.16 
 
 		 413 aa  132  1.0000000000000001e-29  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0384  Saccharopine dehydrogenase  30.13 
 
 		 384 aa  128  2.0000000000000002e-28  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0854083  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1622  saccharopine dehydrogenase  32.28 
 
 		 348 aa  112  1.0000000000000001e-23  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.871276  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0647  saccharopine dehydrogenase  32.11 
 
 		 348 aa  106  7e-22  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0527  saccharopine dehydrogenase  30.89 
 
 		 347 aa  103  5e-21  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0657  saccharopine dehydrogenase  27.6 
 
 		 346 aa  99  1e-19  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1035  saccharopine dehydrogenase  29.44 
 
 		 369 aa  75.9  0.000000000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.002622 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1835  Saccharopine dehydrogenase  25.6 
 
 		 398 aa  67  0.0000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.257501  normal  1 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_70210  seventh step in lysine biosynthesis pathway  26.34 
 
 		 444 aa  55.5  0.000002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.125717 
 
 
-
 
NC_006692  CNG01150  spermidine synthase, putative  25.58 
 
 		 748 aa  52.4  0.00001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1836  Saccharopine dehydrogenase  28.48 
 
 		 387 aa  45.1  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.973025 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05601  saccharopine dehydrogenase (NADP+, L-glutamate-forming) (Eurofung)  26.52 
 
 		 450 aa  44.3  0.004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.404414  normal  1 
 
 
-
 
NC_006670  CNA02370  saccharopine dehydrogenase (NADP+, L-glutamate-forming), putative  22.45 
 
 		 934 aa  42.7  0.01  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.840978  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1364  saccharopine dehydrogenase (NADP(+), L-lysine-forming)  23.16 
 
 		 454 aa  42.7  0.01  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>