54 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Veis_0269 on replicon NC_008786
Organism: Verminephrobacter eiseniae EF01-2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008786  Veis_0269  saccharopine dehydrogenase  100 
 
 
385 aa  773    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.901872  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2155  saccharopine dehydrogenase  68.19 
 
 
367 aa  459  9.999999999999999e-129  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2037  saccharopine dehydrogenase  63.81 
 
 
389 aa  429  1e-119  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1846  Saccharopine dehydrogenase  64.09 
 
 
389 aa  431  1e-119  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1936  saccharopine dehydrogenase  57.98 
 
 
392 aa  405  1.0000000000000001e-112  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3251  dehydrogenase  56.08 
 
 
373 aa  405  1.0000000000000001e-112  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.976387  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3051  TrkA-N:saccharopine dehydrogenase  60.66 
 
 
393 aa  401  9.999999999999999e-111  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.995368  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1243  saccharopine dehydrogenase  54.72 
 
 
365 aa  399  9.999999999999999e-111  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0633  hypothetical protein  53.76 
 
 
367 aa  397  1e-109  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.419888  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2920  saccharopine dehydrogenase  53.91 
 
 
367 aa  395  1e-109  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2268  Saccharopine dehydrogenase  54.93 
 
 
365 aa  392  1e-108  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.87049  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3712  saccharopine dehydrogenase  52.92 
 
 
367 aa  392  1e-108  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1992  putative saccharopine dehydrogenase, NAD-binding  55.21 
 
 
365 aa  393  1e-108  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.899138  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2656  saccharopine dehydrogenase  53.93 
 
 
373 aa  385  1e-106  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2308  hypothetical protein  54.08 
 
 
366 aa  380  1e-104  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1536  saccharopine dehydrogenase  53.52 
 
 
366 aa  376  1e-103  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.938044 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3947  Saccharopine dehydrogenase  55.34 
 
 
379 aa  377  1e-103  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.35469  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2136  saccharopine dehydrogenase  54.08 
 
 
366 aa  377  1e-103  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.112826  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2080  saccharopine dehydrogenase  54.08 
 
 
366 aa  377  1e-103  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.599315  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1737  saccharopine dehydrogenase  53.24 
 
 
366 aa  375  1e-103  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.406485 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1645  saccharopine dehydrogenase  53.24 
 
 
366 aa  376  1e-103  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.733408 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0976  hypothetical protein  54.08 
 
 
366 aa  377  1e-103  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.175424  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1723  saccharopine dehydrogenase  53.24 
 
 
366 aa  375  1e-103  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2269  saccharopine dehydrogenase  54.08 
 
 
366 aa  377  1e-103  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.044171  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3208  saccharopine dehydrogenase  61.08 
 
 
397 aa  378  1e-103  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6355  saccharopine dehydrogenase  53.24 
 
 
366 aa  375  1e-103  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1645  saccharopine dehydrogenase  53.24 
 
 
366 aa  376  1e-103  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5016  saccharopine dehydrogenase  52.96 
 
 
366 aa  374  1e-102  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.288707  normal  0.105633 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2810  saccharopine dehydrogenase  56.94 
 
 
380 aa  367  1e-100  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.111095  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4331  saccharopine dehydrogenase  48.9 
 
 
379 aa  345  6e-94  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0566  saccharopine dehydrogenase  52.89 
 
 
385 aa  335  1e-90  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.411174 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5587  Saccharopine dehydrogenase  48.91 
 
 
376 aa  333  3e-90  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0890714  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1254  hypothetical protein  47.29 
 
 
376 aa  312  6.999999999999999e-84  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.413052  normal  0.0375347 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1304  hypothetical protein  45.88 
 
 
362 aa  309  5.9999999999999995e-83  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1303  hypothetical protein  45.88 
 
 
362 aa  309  5.9999999999999995e-83  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5033  Saccharopine dehydrogenase  42.21 
 
 
354 aa  292  8e-78  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2420  Saccharopine dehydrogenase  38.07 
 
 
354 aa  270  2.9999999999999997e-71  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.870969  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0002  Saccharopine dehydrogenase  40.68 
 
 
360 aa  268  2e-70  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0292492 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0002  Saccharopine dehydrogenase  39.55 
 
 
360 aa  263  3e-69  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.717423  hitchhiker  0.0043893 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1791  saccharopine dehydrogenase  33.98 
 
 
392 aa  137  4e-31  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.493672  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2611  Saccharopine dehydrogenase  32.03 
 
 
413 aa  122  9.999999999999999e-27  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0384  Saccharopine dehydrogenase  26.65 
 
 
384 aa  115  1.0000000000000001e-24  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0854083  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1254  Saccharopine dehydrogenase  29.79 
 
 
385 aa  112  8.000000000000001e-24  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1622  saccharopine dehydrogenase  33.33 
 
 
348 aa  108  2e-22  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.871276  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0647  saccharopine dehydrogenase  29.89 
 
 
348 aa  97.4  4e-19  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0527  saccharopine dehydrogenase  33.33 
 
 
347 aa  95.9  1e-18  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0657  saccharopine dehydrogenase  30.71 
 
 
346 aa  81.6  0.00000000000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1035  saccharopine dehydrogenase  24.08 
 
 
369 aa  79  0.0000000000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  hitchhiker  0.002622 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2221  saccharopine dehydrogenase  27.22 
 
 
375 aa  47  0.0006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000139161  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0106  saccharopine dehydrogenase (NADP+, L-glutamate forming)  20.9 
 
 
380 aa  46.6  0.0007  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1392  oxidoreductase domain protein  28.47 
 
 
403 aa  45.1  0.002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0127888  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2707  saccharopine dehydrogenase  22.95 
 
 
439 aa  44.7  0.003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006670  CNA02370  saccharopine dehydrogenase (NADP+, L-glutamate-forming), putative  22.55 
 
 
934 aa  43.5  0.007  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.840978  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1148  saccharopine dehydrogenase  26.44 
 
 
325 aa  43.5  0.007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>